Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02790
- Subject:
- XM_017316812.1
- Aligned Length:
- 1214
- Identities:
- 1050
- Gaps:
- 91
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------ATGGAGA 7
|||||..
Sbjct 1 ATGTCATCAGATTCCATGGACCAGCCCAGGAACCCCTGCGAGAACGAGCCACTGACCCCGGGTTATCATGGATT 74
Query 8 AAAAGAAA---ATGGTAACTCAGGGTAACCAGGAGCCGACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT 78
...||.|| |||| .|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCAGCAAGGGATGG----CCAGGGTAACCAGGAGCCAACAACAACTCCTGACGCAATGGTTCAGCCTTTTACT 144
Query 79 ACCATCCCATTTCCACCACCTCCGCAGAATGGAATTCCCACAGAGTATGGGGTGCCACACACTCAAGACTATGC 152
||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 145 ACCATCCCGTTCCCACCACCTCCACAAAATGGAATTCCCACAGAATATGGAGTGCCACACACTCAGGACTATGC 218
Query 153 CGGCCAGACCGGTGAGCATAACCTGACACTCTACGGAAGTACGCAAGCC-CACGGGGAGCAGAGCAGCAACTCA 225
||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||| |||| ||.||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 219 CGGCCAGACCAGTGAACATAACCTGACCCTCTACGGGAGTACGC-AGCCTCATGGAGAACAGAGTAGCAATTCA 291
Query 226 CCCAGCACACAAAATGGATCTCTTAC---GACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGCCAGCAGTCACAGACACA 296
|||||||..||.|||||||||||.|| |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 292 CCCAGCAACCAGAATGGATCTCTCACGCAGACAGAAGGTGGAGCACAGACAGACGGACAACAGTCACAGACACA 365
Query 297 AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACCCCGAAACGGCTGCATGTCTCTAATATTCCTTTCCGCTTCCGGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 366 AAGTAGTGAAAATTCAGAGAGTAAATCTACGCCCAAGCGACTACATGTCTCTAATATTCCCTTCCGCTTCCGAG 439
Query 371 ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTAGAAATAATCTTTAATGAACGTGGC 444
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 440 ACCCTGACCTCCGGCAGATGTTTGGGCAGTTTGGCAAAATCCTAGATGTGGAAATAATCTTTAATGAGCGCGGC 513
Query 445 TCTAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTACACGGCAC 518
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 514 TCCAAGGGATTCGGGTTCGTAACTTTCGAGAATAGTGCTGATGCAGACAGGGCCAGGGAGAAATTGCACGGCAC 587
Query 519 CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCTACAGCACGTGTAATGACCAATAAGAAGATGGTCACAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 588 CGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTGAATAATGCAACAGCACGGGTCATGACCAACAAGAAGATGGTCACGC 661
Query 593 CATATGCAAATGGTTGGAAATTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTATATGGTCCGGAGTTATATGCAGCATCCAGC 666
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 662 CATATGCAAATGGCTGGAAGTTAAGCCCAGTAGTTGGAGCTGTGTATGGTCCTGAGTTATATGCAGCATCCAGC 735
Query 667 TTTCAAGCAGATGTGTCCCTAGGCAATGATGCAGCAGTGCCCCTATCAGGAAGAGGGGGTATCAACACTTACAT 740
||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||.|.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 736 TTTCAAGCTGATGTGTCCCTAGGCAATGAGGCGGCTGTGCCCTTGTCAGGAAGAGGAGGCATCAACACTTACAT 809
Query 741 TCCTTTAATCAGTCTCCCTTTAGTTCCTGGCTTCCCTTACCCTACTGCAGCCACCACGGCAGCCGCTTTCAGAG 814
.|||.|||||| |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 810 CCCTCTAATCA------------TTCCTGGCTTCCCTTACCCAACTGCAGCCACCACGGCAGCTGCTTTCCGAG 871
Query 815 GAGCCCATTTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTATATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCC 888
||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 872 GAGCCCATCTGAGGGGCAGAGGGCGGACAGTGTATGGTGCAGTCCGAGCGGTACCTCCAACAGCCATCCCCGCC 945
Query 889 TATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 946 TATCCAGGTGTGGTTTACCAGGACGGATTTTACGGTGCTGACCTCTATGGTGGATATGCAGCCTACAGATATGC 1019
Query 963 ACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACCGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGTGACGGTTATGGCAGGG 1036
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1020 ACAGCCTGCTACTGCAACCGCAGCCACAGCTGCTGCAGCCGCTGCAGCCGCTTACAGCGACGGTTACGGCAGGG 1093
Query 1037 TGTACACAGCCGACCCCTACCATGCCCTTGCCCCTGCCGCTAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTATAC 1110
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1094 TGTACACAGCTGACCCCTACCATGCCCTCGCCCCTGCCGCCAGCTATGGAGTTGGCGCTGTGGCGAGTTTGTAC 1167
Query 1111 CGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1140
||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168 CGAGGTGGCTACAGCCGATTTGCCCCCTAC 1197