Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02825
• Subject: XM_011544878.3
• Aligned Length: 1794
• Identities: 1655
• Gaps: 135

Alignment

Query    1  ATGTCCGCATCCGCCCAGCAGCTGGCGGAGGAGCTGCAGATCTTCGGCCTAGACTGCGAGGAGGCTCTAATTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCGCATCCGCCCAGCAGCTGGCGGAGGAGCTGCAGATCTTCGGCCTAGACTGCGAGGAGGCTCTAATTGA  74

Query   75  GAAATTGGTAGAGCTTTGTGTTCAGTATGGACAGAATGAGGAGGGAATGGTAGGCGAGCTTATAGCCTTCTGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAATTGGTAGAGCTTTGTGTTCAGTATGGACAGAATGAGGAGGGAATGGTAGGCGAGCTTATAGCCTTCTGCA  148

Query  149  CCAGCACACATAAAGTTGGCCTTACCTCAGAGATCCTGAACTCTTTTGAGCATGAGTTTCTGAGCAAAAGATTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCAGCACACATAAAGTTGGCCTTACCTCAGAGATCCTGAACTCTTTTGAGCATGAGTTTCTGAGCAAAAGATTA  222

Query  223  TCGAAAGCCAGGCATAGTACCTGCAAGGACAGTGGCCATGCAGGAGCTAGAGACATTGTTTCCATTCAAGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCGAAAGCCAGGCATAGTACCTGCAAGGACAGTGGCCATGCAGGAGCTAGAGACATTGTTTCCATTCAAGAGCT  296

Query  297  AATTGAAGTGGAAGAAGAAGAGGAAATCCTCTTGAACTCTTACACCACACCTTCAAAGGGTTCTCAGAAGCGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATTGAAGTGGAAGAAGAAGAGGAAATCCTCTTGAACTCTTACACCACACCTTCAAAGGGTTCTCAGAAGCGAG  370

Query  371  CTATCTCTACCCCAGAAACCCCCCTAACAAAAAGGAGTGTGTCAACTCGTAGCCCCCATCAGCTACTCTCACCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTATCTCTACCCCAGAAACCCCCCTAACAAAAAGGAGTGTGTCAACTCGTAGCCCCCATCAGCTACTCTCACCG  444

Query  445  TCAAGTTTCTCTCCAAGTGCTACTCCCTCCCAGAAATACAACTCACGAAGTAACCGAGGAGAAGTGGTTACCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCAAGTTTCTCTCCAAGTGCTACTCCCTCCCAGAAATACAACTCACGAAGTAACCGAGGAGAAGTGGTTACCTC  518

Query  519  CTTCGGCTTAGCACAGGGAGTATCTTGGTCTGGGAGAGGAGGAGCTGGAAACATCAGCCTGAAGGTCTTGGGAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTCGGCTTAGCACAGGGAGTATCTTGGTCTGGGAGAGGAGGAGCTGGAAACATCAGCCTGAAGGTCTTGGGAT  592

Query  593  GTCCAGAGGCACTAACTGGGAGCTACAAATCCATGTTTCAGAAGCTCCCAGACATTCGAGAAGTTCTGACCTGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCCAGAGGCACTAACTGGGAGCTACAAATCCATGTTTCAGAAGCTCCCAGACATTCGAGAAGTTCTGACCTGT  666

Query  667  AAGATAGAAGAACTTGGCAGCGAACTCAAGGAACATTACAAGATTGAAGCTTTCACTCCTTTGCTAGCCCCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AAGATAGAAGAACTTGGCAGCGAACTCAAGGAACATTACAAGATTGAAGCTTTCACTCCTTTGCTAGCCCCAGC  740

Query  741  ACAGGAGCCTGTCACTCTGCTGGGCCAGATTGGCTGTGATAGCAACGGGAAGCTGAACAACAAGTCAGTGATTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGGAGCCTGTCACTCTGCTGGGCCAGATTGGCTGTGATAGCAACGGGAAGCTGAACAACAAGTCAGTGATTC  814

Query  815  TCGAGGGAGACCGGGAACATTCCTCGGGTGCTCAAATTCCAGTGGATTTATCTGAGCTTAAGGAATATTCTCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCGAGGGAGACCGGGAACATTCCTCGGGTGCTCAAATTCCAGTGGATTTATCTGAGCTTAAGGAATATTCTCTG  888

Query  889  TTTCCTGGACAGGTTGTAATTATGGAAGGAATCAACACCACTGGTAGGAAACTTGTTGCCACCAAACTCTACGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCCTGGACAGGTTGTAATTATGGAAGGAATCAACACCACTGGTAGGAAACTTGTTGCCACCAAACTCTACGA  962

Query  963  GGGTGTGCCACTTCCATTTTATCAGCCCACTGAAGAGGATGCAGACTTTGAGCAAAGCATGGTCCTGGTTGCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGGTGTGCCACTTCCATTTTATCAGCCCACTGAAGAGGATGCAGACTTTGAGCAAAGCATGGTCCTGGTTGCCT  1036

Query 1037  GTGGACCATACACCACATCTGACAGCATCACGTATGACCCCCTGCTTGACCTGATTGCTGTCATCAACCATGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTGGACCATACACCACATCTGACAGCATCACGTATGACCCCCTGCTTGACCTGATTGCTGTCATCAACCATGAC  1110

Query 1111  CGGCCAGATGTCTGCATCCTGTTTGGCCCTTTCCTGGATGCTAAGCATGAACAGGTGGAGAATTGTCTACTGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGGCCAGATGTCTGCATCCTGTTTGGCCCTTTCCTGGATGCTAAGCATGAACAGGTGGAGAATTGTCTACTGAC  1184

Query 1185  AAGTCCATTTGAAGACATTTTCAAGCAGTGTCTACGAACAATTATTGAAGGCACAAGAAGCTCCGGCTCCCACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGTCCATTTGAAGACATTTTCAAGCAGTGTCTACGAACAATTATTGAAGGCACAAGAAGCTCCGGCTCCCACC  1258

Query 1259  TTGTCTTTGTCCCGTCATTGAGAGATGTGCACCATGAGCCTGTGTACCCCCAGCCGCCTTTCAGCTACTCCGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTGTCTTTGTCCCGTCATTGAGAGATGTGCACCATGAGCCTGTGTACCCCCAGCCGCCTTTCAGCTACTCCGAT  1332

Query 1333  CTGTCTCGAGAGGACAAAAAGCAAGTACAGTTTGTGTCCGAGCCCTGCAGCCTCTCCATAAACGGAGTGATCTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGTCTCGAGAGGACAAAAAGCAAGTACAGTTTGTGTCCGAGCCCTGCAGCCTCTCCATAAACGGAGTGATCTT  1406

Query 1407  CGGCTTGACATCCACAGATCTGCTTTTCCACCTGGGGGCCGAGGAGATCAGTAGTTCTTCCGGAACTTCAGACA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGGCTTGACATCCACAGATCTGCTTTTCCACCTGGGGGCCGAGGAGATCAGTAGTTCTTCCGGAACTTCAGACA  1480

Query 1481  GATTCAGCCGAATACTCAAGCACATCTTGACCCAGAGGAGCTACTACCCACTCTACCCGCCCCAAGAAGACATG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GATTCAGCCGAATACTCAAGCACATCTTGACCCAGAGGAGCTACTACCCACTCTACCCGCCCCAAGAAGACATG  1554

Query 1555  GCCATTGACTATGAGTCGTTCTATGTTTACGCACAGCTGCCTGTCACCCCAGATGTCCTCATCATCCCGTCAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCCATTGACTATGAGTCGTTCTATGTTTACGCACAGCTGCCTGTCACCCCAGATGTCCTCATCATCCCGTCAGA  1628

Query 1629  GCTGAGGTACTTCGTGAAGGATGTCCTCGGCTGTGTCTGTGTGAACCCTGGGCGCCTTACCAAAGGGCAGGTGG  1702
            |||||||||||||||||||||.|               |||..||.                            
Sbjct 1629  GCTGAGGTACTTCGTGAAGGAAG---------------GTGCCAAG----------------------------  1659

Query 1703  GAGGCACCTTCGCCCGACTCTACCTTAGGAGGCCGGCAGCGGACGGGGCAGAGAGGCAGAGCCCATGCATTGCT  1776
                                                                                      
Sbjct 1660  --------------------------------------------------------------------------  1659

Query 1777  GTGCAGGTCGTCAGGATC  1794
                              
Sbjct 1660  ------------------  1659