Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02921
• Subject: NM_001113564.1
• Aligned Length: 1224
• Identities: 1123
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ATGCCTGGGCACTTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGTTATTTGACGACGAATC  74
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTGGGCACCTACAGGAAGGCTTCGGCTGCGTGGTCACCAACCGATTCGACCAGCTATTTGACGACGAATC  74

Query   75  GGACCCCTTCGAGGTGCTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCTG  148
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  GGACCCTTTCGAGGTACTGAAGGCAGCAGAGAACAAGAAAAAAGAAGCCGGCGGGGGCGGCGTTGGGGGCCCCG  148

Query  149  GGGCCAAGAGCGCAGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCAGGCAAACAGCTGCGCAAGGAGTCC  222
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.||||||
Sbjct  149  GGGCCAAGAGCGCGGCTCAGGCCGCGGCCCAGACCAACTCCAACGCGGCGGGCAAACAGTTGCGTAAAGAGTCC  222

Query  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTTGGCGTGGTTGACAAGAAAGAGGAGACGCAGCCGCCCGT  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  223  CAGAAAGACCGCAAGAACCCGCTGCCCCCCAGCGTCGGCGTGGCCGACAAAAAGGAGGAGACGCAGCCGCCGGT  296

Query  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGACGAGTTGGAAGAAGACCTGATCAACAACTTCAGGGTGAAGGGAAAATAA  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct  297  GGCGCTTAAGAAAGAAGGAATAAGGCGAGTTGGAAGAAGACCCGATCAACAACTACAGGGTGATGGGAAACTAA  370

Query  371  TTGATAGAAGACCAGAAAGGCGACCACCTCGTGAACGAAGATTCGAAAAGCCACTTGAAGAAAAGGGTGAAGGA  444
            |||||||.|||.||||||||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTGATAGGAGAGCAGAAAGGCGACCACCCCGTGAAAGAAGATTTGAAAAGCCACTTGAAGAAAAAGGTGAAGGA  444

Query  445  GGCGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATTGACCGACCTATTCGAGGTCGTGGTGGTCTTGGAAGAGGTCGAGG  518
            ||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  GGTGAATTTTCAGTTGATAGACCGATTATCGAACGGCCTATCCGAGGCCGAGGTGGTCTTGGAAGGGGTCGAGG  518

Query  519  GGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGAGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAACGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGCCGTGGACGTGGAATGGGCCGAGGCGATGGATTTGATTCTCGTGGCAAGCGTGAATTTGATAGGCATAGTG  592

Query  593  GAAGTGATAGATCTTCTTTTTCACATTACAGTGGCCTGAAGCACGAGGACAAACGTGGAGGTAGCGGATCTCAC  666
            |||||||||||||                  ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  GAAGTGATAGATC------------------TGGCCTGAAGCATGAGGACAAACGCGGAGGTAGCGGCTCTCAC  648

Query  667  AACTGGGGAACTGTCAAAGACGAATTAACAGAGTCCCCCAAATACATTCAGAAACAAATATCTTATAATTACAG  740
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  649  AACTGGGGAACTGTCAAAGATGAATTAACAGAGTCACCCAAATACATTCAGAAACAAATATCTTATAATTGCAG  722

Query  741  TGACTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAGAACATCATCCAGTGGCAGACACTGAAA  814
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |.||.||.||||||||.|||||||
Sbjct  723  TGATTTGGATCAATCAAATGTGACTGAGGAAACACCTGAAGGTGAAG---AGCACCCTGTGGCAGATACTGAAA  793

Query  815  ATAAGGAGAATGAAGTTGAAGAGGTAAAAGAGGAGGGTCCAAAAGAGATGACTTTGGATGAGTGGAAGGCTATT  888
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||
Sbjct  794  ATAAGGAGAACGAAGTTGAAGAGGTTAAGGAAGAGGGTCCAAAAGAGATGACTCTGGATGAGTGGAAAGCTATT  867

Query  889  CAAAATAAGGACCGGGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGTGCTGATGGGCAGTGGAAGAA  962
            ||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||
Sbjct  868  CAAAATAAAGACCGAGCAAAAGTAGAATTTAATATCCGAAAACCAAATGAAGGCGCCGATGGACAATGGAAAAA  941

Query  963  GGGATTTGTTCTTCATAAATCAAAGAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCGGTTATGGACCATCATTTCCGGA  1036
            ||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GGGATTTGTTCTGCATAAATCAAAAAGTGAAGAGGCTCATGCTGAAGATTCAGTTATGGACCATCATTTCCGGA  1015

Query 1037  AGCCAGCAAATGATATAACGTCTCAGCTGGAGATCAATTTTGGAGACCTTGGCCGCCCAGGACGTGGCGGCAGG  1110
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 1016  AGCCAGCAAATGATATAACATCTCAACTGGAGATCAATTTTGGAGACTTAGGCCGCCCAGGACGTGGTGGCAGA  1089

Query 1111  GGAGGACGAGGTGGACGTGGGCGTGGTGGGCGCCCAAACCGTGGCAGCAGGACCGACAAGTCAAGTGCTTCTGC  1184
            ||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1090  GGAGGACGTGGTGGGCGTGGGCGTGGTGGACGTCCAAACCGTGGCAGCAGGACTGATAAGTCAAGTGCTTCTGC  1163

Query 1185  TCCTGATGTGGATGACCCAGAGGCATTCCCAGCTCTGGCT  1224
            |||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1164  TCCTGATGTAGATGACCCAGAGGCCTTCCCAGCTCTGGCC  1203