Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_03116
Subject:
NM_146241.2
Aligned Length:
3076
Identities:
2771
Gaps:
5

Alignment

Query    1  ATGGGGGAAGACGACGCCGCGCTTCGGGCTGGCAGCAGGGGGCTCTCCGACCCGTGGGCAGACTCAGTGGGAGT  74
            |||||.|||||||||||||||||.|||||..||.|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGGAGAAGACGACGCCGCGCTCCGGGCAAGCGGCAGGGGGCTCTCGGACCCGTGGGCTGACTCGGTGGGAGT  74

Query   75  GCGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCCGTACACAAGCGGCTTGTGCTGGCCTTCGCTGTGTCCCTCGTGG  148
            |.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||.||||||
Sbjct   75  GAGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCAGTGCACAAGAGGCTTGTGCTGGCCTTTGCCGTGTCCATCGTGG  148

Query  149  CATTGCTCGCGGTCACAATGCTCGCTGTGCTGCTCAGCCTGCGCTTCGACGAGTGCGGGGCGAG---TGCCACG  219
            ||.||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||.||||.|||||||||||.||.|||||   .||.|.|
Sbjct  149  CACTGCTGGCTGTCACCATGCTGGCCGTCCTGCTCAGCTTGCGATTCGACGAGTGTGGAGCGAGCGCGGCGATG  222

Query  220  CCAGGCGCCGACGGTGGCCCCTCAGGCTTTCCGGAGCGCGGCGGCAACGGGAGCCTCCCTGGATCGGCCCGGCG  293
            ||.|||.||||||||||||.|...||.||.||.|||||||.|.|||||.|.|||.|.||.||.||.||||||||
Sbjct  223  CCTGGCACCGACGGTGGCCTCGGGGGTTTCCCCGAGCGCGACAGCAACAGCAGCTTTCCAGGTTCTGCCCGGCG  296

Query  294  CAACCACCACGCAGGCGGGGACTCCTGGCAGCCCGAG-GCGGGTGGGGTGGCCAGTCCGGGGACCACGTCGGCC  366
            ||||||||||||.||.|||||.||||..||||..||| || ||.|.|||||.||..|||||||||.||||.|||
Sbjct  297  CAACCACCACGCGGGTGGGGAATCCTCTCAGCGTGAGAGC-GGCGAGGTGGGCACCCCGGGGACCCCGTCTGCC  369

Query  367  CAGCCGCCGTCGGAGGAGGAGCGGGAGCCGTGGGAGCCGTGGACGCAGCTGCGCCTGTCGGGCCACCTGAAGCC  440
            |||||||||||||||||.||||||||||.||||.||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||
Sbjct  370  CAGCCGCCGTCGGAGGAAGAGCGGGAGCAGTGGCAGCCCTGGACACAGCTGCGCCTATCCGGCCACCTCAAGCC  443

Query  441  GCTGCACTACAATCTGATGCTCACCGCCTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCCGGGGAGGTCAACGTGGAGATCG  514
            |||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GCTGCACTACAATTTGATGCTCACCGCTTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCTGGGGAGGTCAACGTGGAGATCG  517

Query  515  CGTGCCGGAACGCCACCCGCTACGTAGTGCTGCACGCTTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAAGTGCAGCTGGCCGAG  588
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.||.||.
Sbjct  518  CGTGCCGGAACGCCACCCGCTACGTGGTACTGCACGCCTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAGGTGCAAGTAGCTGAA  591

Query  589  GACCGGGCGTTCGGGGCTGTCCCTGTAGCCGGTTTTTTCCTCTACCCGCAAACCCAGGTCTTAGTGGTGGTGCT  662
            |||.|||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||..|
Sbjct  592  GACAGGGCGTTCGGGGCTGTCCCGGTTGCAGGCTTTTTCCTCTACCCACAAACGCAGGTCTTGGTGGTGGTATT  665

Query  663  GAATAGGACACTGGACGCGCAGAGGAATTACAATCTGAAGATTATCTACAACGCGCTCATCGAGAATGAGCTCC  736
            |||.||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||..
Sbjct  666  GAACAGAACCCTGGACGCGCAGAGGCATTACAATCTGAAGATTATCTACAATGCCCTGATAGAGAACGAGCTTT  739

Query  737  TGGGCTTCTTCCGCAGCTCCTATGTGCTCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCGCCTACA  810
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  740  TGGGCTTCTTCCGCAGCTCCTACGTGATCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCACCTACA  813

Query  811  CATGCCAGAAAGGCATTTCCTTGTTTTGATGAGCCAATCTACAAGGCTACTTTCAAAATCAGCATCAAGCATCA  884
            ||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  814  CATGCCAGGAAGGCGTTTCCGTGTTTCGATGAACCAATCTACAAGGCCACTTTCAAAATCAGCATCAAACATCA  887

Query  885  AGCAACCTATTTATCTTTATCTAATATGCCAGTGGAAACTTCCGTGTTTGAGGAAGATGGATGGGTTACGGATC  958
            ||||||||||||.|||.||||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  888  AGCAACCTATTTGTCTCTATCCAACATGCCAGTGGAAACGTCTGTGTTCGAGGAAGATGGATGGGTGACAGATC  961

Query  959  ACTTTTCACAGACCCCTCTCATGTCCACATATTATTTAGCCTGGGCAATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACT  1032
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  ACTTTTCACAGACCCCTCTCATGTCTACATATTATTTAGCCTGGGCGATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACT  1035

Query 1033  ACCACCAAGAGTGGGGTTGTAGTACGATTATATGCAAGACCTGATGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGC  1106
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  ACCACCAAGAGTGGGGTTGTAGTCCGATTATATGCGAGACCCGACGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGC  1109

Query 1107  TCTCCATATAACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCCTTGCCAAAACTAG  1180
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1110  TCTCCACATTACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCTTTGCCAAAACTAG  1183

Query 1181  ATCTTTTAGCTGTGCCTAAGCATCCGTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGA  1254
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ATCTTTTAGCTGTGCCTAAGCATCCTTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGA  1257

Query 1255  ATACTGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATG  1328
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1258  ATACTGCTGGATCCCAGTGTGTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAAATATG  1331

Query 1329  TCACCAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACT  1402
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct 1332  TCACCAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACTCCAGTTTGGTGGGAAGATGTGTGGTTGAAGGAAGGCTTTGCTCACT  1405

Query 1403  ACTTTGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTT  1476
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1406  ACTTTGAATTTGTGGGTACAGACTACCTCTACCCTGCCTGGAACATGGAGAAGCAGAGATTTCTGACAGATGTT  1479

Query 1477  CTGCATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGA  1550
            |||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 1480  CTGCATGAAGTGATGCTACTTGATGGCTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTACGGGCAACAGA  1553

Query 1551  TATTGACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGG  1624
            |||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  TATTGACAGAGTGTTCGACTGGATCGCATACAAAAAGGGTGCTGCTCTAATTAGAATGCTGGCTAATTTTATGG  1627

Query 1625  GCCATTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGAT  1698
            |.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1628  GTCATTCAGTTTTTCAGAGGGGATTGCAAGATTATTTAACCATTCACAAGTATGGCAATGCAGCCAGAAATGAT  1701

Query 1699  CTCTGGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTG  1772
            |||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1702  CTCTGGAATACATTATCAGAGGCTTTAAGAAGGAATGGAAAATACGTGAACATACAAGAAGTAATGGATCAGTG  1775

Query 1773  GACACTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCC  1846
            ||||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||||
Sbjct 1776  GACACTGCAGATGGGATATCCTGTTATCACTATCCTGGGAAACACGACGGCAGAAAATAGAATACTTATCACCC  1849

Query 1847  AACAGCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAG  1920
            ||||||||||.||.|||||.||..||||||||||||||||||||.|||||||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1850  AACAGCATTTCATTTATGACATTGGTGCTAAAACTAAAGCACTTCAACTTCAAAACAGCAGTTACCTGTGGCAG  1923

Query 1921  ATTCCATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATC  1994
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  ATTCCATTAACCATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATC  1997

Query 1995  AGAGCACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTA  2068
            |||.||.|||||||||.|.||.||.||||.||||||||||.|.||.|||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1998  AGAACATCACAGAATAGCGTACTTAGACAGAGGAAGCTGGATCCTTGGGAACATCAATCAAACCGGCTACTTTA  2071

Query 2069  GAGTCAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTC  2142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||.||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2072  GAGTCAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTACTAATCGATCAGTTAATCAGGAACCACGAGGTACTTTCTGTC  2145

Query 2143  AGTAACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCT  2216
            ||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 2146  AGTAACCGCGCGGCTTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTGGCCAGGGCAGGCTATTTGCCTCAGAATATCCCCCT  2219

Query 2217  GGAGATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTC  2290
            .|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  AGAGATCATCAGATACCTGTCTGAGGAAAAGGATTTTCTTCCTTGGCACGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTC  2293

Query 2291  TAGATAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACA  2364
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 2294  TGGATAAATTACTGGACCGCATGGAGAACTACAATATCTTCAATGAATATATTCTAAAACAAGTTGCAACAACA  2367

Query 2365  TATATCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACT  2438
            ||.|||||||||||.|||||.|.||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2368  TACATCAAGCTTGGATGGCCAAGAAATAACTTCAATGGATCTCTCGTTCAAGCCTCCTACCAACATGAGGAGCT  2441

Query 2439  ACGTAGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTT  2512
            |||.||.|||||.||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2442  ACGGAGGGAAGTGATAATGTTGGCATGTAGTTTTGGGAACAAGCACTGTCACCAGCAGGCATCAACACTTATTT  2515

Query 2513  CAGATTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCA  2586
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2516  CAGACTGGATTTCCAGCAACAGAAACAGAATACCCCTGAATGTTAGAGACATCGTCTACTGCACAGGAGTGTCA  2589

Query 2587  CTACTGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAAT  2660
            ||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2590  CTGCTGGATGAGGATGTCTGGGAGTTTATCTGGATGAAATTCCACTCTACCACTGCAGTTTCTGAGAAAAAGAT  2663

Query 2661  ATTATTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTG  2734
            |.|..||||.||..||||||||||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2664  ACTGCTGGAGGCTCTAACTTGCAGCGATGACAGGAATTTATTAAGTAGGCTTCTAAATCTGTCTCTGAATTCTG  2737

Query 2735  AGGTGGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCC  2808
            ||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2738  AGGTGGTGTTGGATCAAGATGCAATTGATGTAATTATCCACGTAGCCAGAAATCCACATGGCCGAGACCTTGCC  2811

Query 2809  TGGAAGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACT  2882
            ||||||||||||||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2812  TGGAAGTTTTTCAGAGACAAATGGAAAATACTAAATACCAGGTATGGAGAAGCACTGTTTATGAATTCCAAACT  2885

Query 2883  CATCAGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATG  2956
            .||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||...|||||
Sbjct 2886  TATCAGTGGAGTTACAGAATTTCTTAATACAGAAGGTGAACTTAAAGAGCTAAAGAATTTCATGAAGTCCTATG  2959

Query 2957  ATGGGGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTAC  3030
            ||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 2960  ATGGGGTAGCCTCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTGGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAAGGTTTTAC  3033

Query 3031  CAAGACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC  3072
            |||||.|||||||||||.|||.|.||||||||..|.||||||
Sbjct 3034  CAAGATGAGCTTTTCCAGTGGCTGGGAAAAGCCATGAGACAC  3075