Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03116
• Subject: XM_017019244.1
• Aligned Length: 3072
• Identities: 2163
• Gaps: 909

Alignment

Query    1  ATGGGGGAAGACGACGCCGCGCTTCGGGCTGGCAGCAGGGGGCTCTCCGACCCGTGGGCAGACTCAGTGGGAGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCGACCCCGCACCACGGAGCGCCACATCGCCGTACACAAGCGGCTTGTGCTGGCCTTCGCTGTGTCCCTCGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CATTGCTCGCGGTCACAATGCTCGCTGTGCTGCTCAGCCTGCGCTTCGACGAGTGCGGGGCGAGTGCCACGCCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGCGCCGACGGTGGCCCCTCAGGCTTTCCGGAGCGCGGCGGCAACGGGAGCCTCCCTGGATCGGCCCGGCGCAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCACCACGCAGGCGGGGACTCCTGGCAGCCCGAGGCGGGTGGGGTGGCCAGTCCGGGGACCACGTCGGCCCAGC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CGCCGTCGGAGGAGGAGCGGGAGCCGTGGGAGCCGTGGACGCAGCTGCGCCTGTCGGGCCACCTGAAGCCGCTG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CACTACAATCTGATGCTCACCGCCTTCATGGAGAACTTCACCTTCTCCGGGGAGGTCAACGTGGAGATCGCGTG  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  CCGGAACGCCACCCGCTACGTAGTGCTGCACGCTTCCCGAGTGGCGGTGGAGAAAGTGCAGCTGGCCGAGGACC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  GGGCGTTCGGGGCTGTCCCTGTAGCCGGTTTTTTCCTCTACCCGCAAACCCAGGTCTTAGTGGTGGTGCTGAAT  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  AGGACACTGGACGCGCAGAGGAATTACAATCTGAAGATTATCTACAACGCGCTCATCGAGAATGAGCTCCTGGG  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  CTTCTTCCGCAGCTCCTATGTGCTCCACGGGGAGAGAAGATTCCTTGGTGTTACTCAGTTTTCGCCTACACATG  814
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  815  CCAGAAAGGCATTTCCTTGTTTTGATGAGCCAATCTACAAGGCTACTTTCAAAATCAGCATCAAGCATCAAGCA  888
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  889  ACCTATTTATCTTTATCTAATATGCCAGTGGAAACTTCCGTGTTTGAGGAAGATGGATGGGTTACGGATCACTT  962
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------ATGCCAGTGGAAACTTCCGTGTTTGAGGAAGATGGATGGGTTACGGATCACTT  53

Query  963  TTCACAGACCCCTCTCATGTCCACATATTATTTAGCCTGGGCAATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACTACCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   54  TTCACAGACCCCTCTCATGTCCACATATTATTTAGCCTGGGCAATTTGCAACTTCACATACAGAGAAACTACCA  127

Query 1037  CCAAGAGTGGGGTTGTAGTACGATTATATGCAAGACCTGATGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGCTCTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  128  CCAAGAGTGGGGTTGTAGTACGATTATATGCAAGACCTGATGCTATCAGAAGAGGATCCGGGGACTATGCTCTC  201

Query 1111  CATATAACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCCTTGCCAAAACTAGATCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  202  CATATAACAAAGAGATTAATAGAATTTTATGAAGACTACTTTAAAGTGCCCTATTCCTTGCCAAAACTAGATCT  275

Query 1185  TTTAGCTGTGCCTAAGCATCCGTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGAATAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  TTTAGCTGTGCCTAAGCATCCGTATGCTGCTATGGAGAACTGGGGACTAAGTATTTTTGTGGAACAAAGAATAC  349

Query 1259  TGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATGTCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  350  TGCTGGATCCCAGTGTTTCATCTATTTCTTATTTGCTGGATGTCACCATGGTCATTGTTCATGAGATATGTCAC  423

Query 1333  CAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACTACTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  424  CAGTGGTTTGGTGACCTTGTGACGCCTGTGTGGTGGGAAGACGTGTGGCTGAAGGAAGGGTTTGCTCACTACTT  497

Query 1407  TGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTTCTGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  TGAATTTGTTGGTACAGACTACCTCTATCCTGGCTGGAACATGGAAAAGCAGAGGTTTCTGACCGATGTTCTGC  571

Query 1481  ATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGATATT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  572  ATGAAGTGATGCTGCTGGACGGTTTGGCCAGTTCCCATCCAGTATCACAGGAAGTGCTGCAGGCAACAGATATT  645

Query 1555  GACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGGGCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  646  GACAGGGTGTTTGACTGGATCGCATATAAAAAGGGTGCTGCTTTAATAAGAATGCTGGCTAATTTTATGGGCCA  719

Query 1629  TTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGATCTCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  720  TTCAGTTTTCCAGAGGGGTTTGCAAGATTATTTAACCATTCATAAGTATGGTAATGCAGCCAGAAATGATCTCT  793

Query 1703  GGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTGGACA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  794  GGAATACATTATCGGAGGCTTTAAAAAGAAATGGGAAATATGTAAATATACAAGAAGTAATGGATCAGTGGACA  867

Query 1777  CTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCCAACA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  868  CTCCAGATGGGTTATCCTGTTATCACCATCTTGGGAAACACAACAGCAGAAAATAGAATAATAATTACCCAACA  941

Query 1851  GCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAGATTC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  942  GCATTTTATCTATGATATCAGTGCTAAAACTAAAGCACTTAAACTTCAGAATAACAGTTACCTGTGGCAGATTC  1015

Query 1925  CATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATCAGAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1016  CATTAACTATTGTGGTAGGAAATAGAAGCCATGTGTCTTCAGAAGCAATTATTTGGGTGTCTAACAAATCAGAG  1089

Query 1999  CACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTAGAGT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1090  CACCACAGAATAACTTATTTGGACAAAGGAAGCTGGCTGCTGGGGAACATCAATCAAACTGGCTATTTTAGAGT  1163

Query 2073  CAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTCAGTA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1164  CAACTATGACCTAAGGAACTGGAGATTATTAATTGATCAATTAATCCGGAATCATGAGGTTCTTTCTGTCAGTA  1237

Query 2147  ACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCTGGAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1238  ACCGAGCGGGCTTGATCGATGATGCCTTCAGCCTAGCCAGGGCTGGCTATTTGCCTCAGAATATTCCTCTGGAG  1311

Query 2221  ATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTCTAGA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1312  ATTATCAGATACCTGTCTGAGGAGAAGGATTTTCTTCCTTGGCATGCTGCCAGCCGAGCTCTTTATCCTCTAGA  1385

Query 2295  TAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACATATA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1386  TAAATTACTGGACCGCATGGAAAACTACAACATTTTCAATGAATATATTTTAAAGCAAGTTGCAACAACATATA  1459

Query 2369  TCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACTACGT  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1460  TCAAGCTTGGGTGGCCGAAAAATAATTTTAATGGATCTCTTGTTCAAGCATCCTACCAACATGAAGAACTACGT  1533

Query 2443  AGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTTCAGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1534  AGAGAAGTTATAATGCTGGCCTGCAGTTTTGGCAACAAGCACTGTCACCAACAGGCATCAACACTTATTTCAGA  1607

Query 2517  TTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCACTAC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1608  TTGGATTTCCAGCAACAGGAACAGAATACCACTAAATGTTAGAGACATCGTATACTGTACAGGAGTGTCACTAC  1681

Query 2591  TGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAATATTA  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1682  TGGATGAGGATGTCTGGGAATTCATATGGATGAAATTCCATTCCACCACAGCAGTTTCTGAGAAGAAAATATTA  1755

Query 2665  TTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTGAGGT  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1756  TTGGAAGCCTTAACTTGCAGTGATGACAGGAATTTATTAAACAGGCTTCTAAATCTGTCACTGAATTCTGAGGT  1829

Query 2739  GGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCCTGGA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1830  GGTGCTGGATCAAGATGCAATTGATGTCATAATCCATGTAGCTCGAAATCCACATGGTCGAGACCTTGCCTGGA  1903

Query 2813  AGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACTCATC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1904  AGTTTTTCAGGGATAAATGGAAGATATTAAATACCAGGTATGGAGAAGCATTGTTTATGAATTCCAAACTCATC  1977

Query 2887  AGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATGATGG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1978  AGTGGTGTCACAGAATTTCTTAATACTGAAGGTGAACTCAAAGAGCTCAAGAACTTCATGAAAAACTATGATGG  2051

Query 2961  GGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTACCAAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2052  GGTAGCTGCTGCTTCTTTCTCACGAGCTGTGGAAACTGTCGAAGCCAATGTGCGCTGGAAAATGCTTTACCAAG  2125

Query 3035  ACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC  3072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2126  ACGAGCTTTTCCAATGGTTAGGAAAAGCTCTAAGACAC  2163