Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03298
• Subject: NM_001366344.1
• Aligned Length: 855
• Identities: 714
• Gaps: 141

Alignment

Query   1  ATGGCGCTTGTCCCCTGCCAGGTGCTGCGGATGGCAATCCTGCTGTCTTACTGCTCTATCCTGTGTAACTACAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGCTTGTCCCCTGCCAGGTGCTGCGGATGGCAATCCTGCTGTCTTACTGCTCTATCCTGTGTAACTACAA  74

Query  75  GGCCATCGAAATGCCCTCACACCAGACCTACGGAGGGAGCTGGAAATTCCTGACGTTCATTGATCT--------  140
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  75  GGCCATCGAAATGCCCTCACACCAGACCTACGGAGGGAGCTGGAAATTCCTGACGTTCATTGATCTGATGGAGT  148

Query 141  --------------------------------------------------------------------------  140
                                                                                     
Sbjct 149  CTCACTCTGTCACCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCTGTGTTCAAGC  222

Query 141  -----------------------------------------------------------GGTTATCCAGGCTGT  155
                                                                      |||||||||||||||
Sbjct 223  TATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCGTGTGCCACCATGCCCGGGTTATCCAGGCTGT  296

Query 156  CTTTTTTGGCATCTGTGTGCTGACTGATCTTTCCAGTCTTCTGACTCGAGGAAGTGGGAACCAGGAGCAAGAGA  229
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CTTTTTTGGCATCTGTGTGCTGACTGATCTTTCCAGTCTTCTGACTCGAGGAAGTGGGAACCAGGAGCAAGAGA  370

Query 230  GGCAGCTCAAGAAGCTCATCTCTCTCCGGGACTGGATGTTAGCTGTGTTGGCCTTTCCTGTTGGGGTTTTTGTT  303
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GGCAGCTCAAGAAGCTCATCTCTCTCCGGGACTGGATGTTAGCTGTGTTGGCCTTTCCTGTTGGGGTTTTTGTT  444

Query 304  GTAGCAGTGTTCTGGATCATTTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCCGAAGCTGCTGGATAATTTTATCCC  377
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GTAGCAGTGTTCTGGATCATTTATGCCTATGACAGAGAGATGATATACCCGAAGCTGCTGGATAATTTTATCCC  518

Query 378  AGGGTGGCTGAATCACGGAATGCACACGACGGTTCTGCCCTTTATATTAATCGAGATGAGGACATCGCACCATC  451
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AGGGTGGCTGAATCACGGAATGCACACGACGGTTCTGCCCTTTATATTAATCGAGATGAGGACATCGCACCATC  592

Query 452  AGTATCCCAGCAGGAGCAGCGGACTTACCGCCATATGTACCTTCTCTGTTGGCTATATATTATGGGTGTGCTGG  525
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AGTATCCCAGCAGGAGCAGCGGACTTACCGCCATATGTACCTTCTCTGTTGGCTATATATTATGGGTGTGCTGG  666

Query 526  GTGCATCATGTAACTGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACACATTGGCCCAGGAGCCAGAATCATCTTCTT  599
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GTGCATCATGTAACTGGCATGTGGGTGTACCCTTTCCTGGAACACATTGGCCCAGGAGCCAGAATCATCTTCTT  740

Query 600  TGGGTCTACAACCATCTTAATGAACTTCCTGTACCTGCTGGGAGAAGTTCTGAACAACTATATCTGGGATACAC  673
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  TGGGTCTACAACCATCTTAATGAACTTCCTGTACCTGCTGGGAGAAGTTCTGAACAACTATATCTGGGATACAC  814

Query 674  AGAAAAGTATGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCCTAAATTGGAA  714
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  AGAAAAGTATGGAAGAAGAGAAAGAAAAGCCTAAATTGGAA  855