Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03462
• Subject: NM_001308112.2
• Aligned Length: 1755
• Identities: 1713
• Gaps: 42

Alignment

Query    1  ------------------------------------------ATGGACCACACATCCCCGACCTACATGCTTGC  32
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACTTCAAATGCAAGTATTCCTACCCTGCTCTGTACCAGATGGACCACACATCCCCGACCTACATGCTTGC  74

Query   33  TAACTTAACCCACTTGCATTCTGAACAACTTCTGCAGGGCTTGAATCTTCTTCGCCAACATCACGAACTCTGTG  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAACTTAACCCACTTGCATTCTGAACAACTTCTGCAGGGCTTGAATCTTCTTCGCCAACATCACGAACTCTGTG  148

Query  107  ACATCATTCTTCGAGTAGGTGATGTTAAAATTCATGCTCACAAAGTGGTACTTGCCAGCGTCAGCCCGTATTTC  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATCATTCTTCGAGTAGGTGATGTTAAAATTCATGCTCACAAAGTGGTACTTGCCAGCGTCAGCCCGTATTTC  222

Query  181  AAAGCTATGTTCACTGGAAACCTTTCTGAAAAAGAGAACAGTGAGGTTGAGTTTCAATGCATTGATGAAACTGC  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGCTATGTTCACTGGAAACCTTTCTGAAAAAGAGAACAGTGAGGTTGAGTTTCAATGCATTGATGAAACTGC  296

Query  255  TCTCCAGGCCATTGTGGAGTATGCCTATACAGGGACTGTTTTTATTTCTCAGGACACAGTTGAATCTCTCCTGC  328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTCCAGGCCATTGTGGAGTATGCCTATACAGGGACTGTTTTTATTTCTCAGGACACAGTTGAATCTCTCCTGC  370

Query  329  CAGCAGCAAACCTACTCCAGATAAAACTTGTCCTGAAAGAATGTTGTGCATTTCTTGAAAGCCAACTTGATCCT  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGCAGCAAACCTACTCCAGATAAAACTTGTCCTGAAAGAATGTTGTGCATTTCTTGAAAGCCAACTTGATCCT  444

Query  403  GGTAATTGTATTGGAATTTCTCGTTTTGCAGAAACATATGGTTGCCGTGACCTTTATTTGGCAGCCACTAAATA  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTAATTGTATTGGAATTTCTCGTTTTGCAGAAACATATGGTTGCCGTGACCTTTATTTGGCAGCCACTAAATA  518

Query  477  CATATGCCAGAATTTTGAAGCTGTTTGCCAGACTGAAGAGTTTTTTGAGCTTACACATGCTGACTTGGATGAAA  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATATGCCAGAATTTTGAAGCTGTTTGCCAGACTGAAGAGTTTTTTGAGCTTACACATGCTGACTTGGATGAAA  592

Query  551  TTGTTTCCAATGACTGTTTGAATGTAGCTACCGAAGAGACTGTTTTTTATGCATTAGAGTCTTGGATCAAGTAT  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTGTTTCCAATGACTGTTTGAATGTAGCTACCGAAGAGACTGTTTTTTATGCATTAGAGTCTTGGATCAAGTAT  666

Query  625  GATGTACAAGAACGCCAGAAATACTTAGCACAGTTACTAAACAGTGTACGATTACCATTGTTGAGTGTTAAGTT  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGTACAAGAACGCCAGAAATACTTAGCACAGTTACTAAACAGTGTACGATTACCATTGTTGAGTGTTAAGTT  740

Query  699  TCTCACTAGACTATATGAAGCAAATCATCTTATTCGTGATGATCGCACTTGTAAACATCTTTTGAATGAAGCCC  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTCACTAGACTATATGAAGCAAATCATCTTATTCGTGATGATCGCACTTGTAAACATCTTTTGAATGAAGCCC  814

Query  773  TAAAGTACCACTTTATGCCTGAACATAGACTCTCTCATCAGACAGTCTTGATGACACGACCTCGCTGTGCTCCC  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAAGTACCACTTTATGCCTGAACATAGACTCTCTCATCAGACAGTCTTGATGACACGACCTCGCTGTGCTCCC  888

Query  847  AAAGTACTTTGTGCAGTAGGAGGGAAATCTGGACTCTTTGCCTGTTTGGATAGTGTGGAGATGTACTTTCCTCA  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGTACTTTGTGCAGTAGGAGGGAAATCTGGACTCTTTGCCTGTTTGGATAGTGTGGAGATGTACTTTCCTCA  962

Query  921  GAATGACTCTTGGATTGGTTTGGCACCCCTAAACATTCCTCGCTATGAATTTGGAATATGCGTTTTAGACCAAA  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAATGACTCTTGGATTGGTTTGGCACCCCTAAACATTCCTCGCTATGAATTTGGAATATGCGTTTTAGACCAAA  1036

Query  995  AAGTATATGTTATAGGTGGTATTGCAACTAATGTGCGTCCTGGCGTCACTATCAGAAAACATGAAAATTCAGTG  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAGTATATGTTATAGGTGGTATTGCAACTAATGTGCGTCCTGGCGTCACTATCAGAAAACATGAAAATTCAGTG  1110

Query 1069  GAATGCTGGAATCCTGATACAAATACTTGGACTTCTCTAGAGAGAATGAATGAAAGCCGAAGTACTCTTGGAGT  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAATGCTGGAATCCTGATACAAATACTTGGACTTCTCTAGAGAGAATGAATGAAAGCCGAAGTACTCTTGGAGT  1184

Query 1143  AGTAGTACTTGCAGGAGAACTTTATGCCTTAGGTGGTTATGATGGACAATCTTATTTACAATCTGTAGAGAAGT  1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGTAGTACTTGCAGGAGAACTTTATGCCTTAGGTGGTTATGATGGACAATCTTATTTACAATCTGTAGAGAAGT  1258

Query 1217  ACATTCCCAAAATAAGAAAATGGCAACCTGTGGCACCAATGACGACAACAAGAAGTTGTTTTGCTGCAGCGGTA  1290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACATTCCCAAAATAAGAAAATGGCAACCTGTGGCACCAATGACGACAACAAGAAGTTGTTTTGCTGCAGCGGTA  1332

Query 1291  TTGGATGGAATGATATATGCCATTGGTGGGTATGGTCCTGCCCACATGAACAGTGTGGAGCGTTATGATCCAAG  1364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTGGATGGAATGATATATGCCATTGGTGGGTATGGTCCTGCCCACATGAACAGTGTGGAGCGTTATGATCCAAG  1406

Query 1365  TAAGGACTCCTGGGAGATGGTTGCATCCATGGCAGATAAAAGGATTCACTTTGGCGTGGGTGTCATGCTAGGCT  1438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TAAGGACTCCTGGGAGATGGTTGCATCCATGGCAGATAAAAGGATTCACTTTGGCGTGGGTGTCATGCTAGGCT  1480

Query 1439  TTATTTTTGTGGTGGGTGGACATAATGGAGTCTCACATTTGTCCAGCATTGAAAGATACGATCCTCATCAAAAT  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTATTTTTGTGGTGGGTGGACATAATGGAGTCTCACATTTGTCCAGCATTGAAAGATACGATCCTCATCAAAAT  1554

Query 1513  CAGTGGACTGTGTGTAGACCAATGAAAGAACCTAGAACAGGAGTTGGTGCTGCTGTAATCGATAACTACCTTTA  1586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGTGGACTGTGTGTAGACCAATGAAAGAACCTAGAACAGGAGTTGGTGCTGCTGTAATCGATAACTACCTTTA  1628

Query 1587  TGTCGTCGGTGGTCACTCAGGGTCTTCCTATCTGAATACAGTGCAGAAATATGATCCTATCTCAGATACGTGGC  1660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGTCGTCGGTGGTCACTCAGGGTCTTCCTATCTGAATACAGTGCAGAAATATGATCCTATCTCAGATACGTGGC  1702

Query 1661  TGGATTCAGCTGGCATGATATACTGTCGCTGCAACTTTGGGTTAACTGCACTT  1713
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGGATTCAGCTGGCATGATATACTGTCGCTGCAACTTTGGGTTAACTGCACTT  1755