Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03660
• Subject: NM_001288990.3
• Aligned Length: 712
• Identities: 658
• Gaps: 54

Alignment

Query   1  ------------------------------------------------------MGGHLSPWPTYTSGQTILQN  20
                                                                 ||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MACQQSRYHSFSSASRLQPRPSGVTIDESFLTEDKSTQNRKLLQKRRTLTGQFSMGGHLSPWPTYTSGQTILQN  74

Query  21  RKPCSDDYRKRVGSCQQHPFRTAKPQYLEELENYLRKELLLLDLGTDSTQELRLQPYREIFEFFIEDFKTYKPL  94
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  RKPCSDDYRKRVGSCQQHPFRTAKPQYLEELENYLRKELLLLDLGTDSTQELRLQPYREIFEFFIEDFKTYKPL  148

Query  95  LSSIKNAYEGMLAHQREKIRALEPLKAKLVTVNEDCNERILAMRAEEKYEISLLKKEKMNLLKLIDKKNEEKIS  168
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LSSIKNAYEGMLAHQREKIRALEPLKAKLVTVNEDCNERILAMRAEEKYEISLLKKEKMNLLKLIDKKNEEKIS  222

Query 169  LQSEVTKLRKNLAEEYLHYLSERDACKILIADLNELRYQREDMSLAQSPGIWGEDPVKLTLALKMTRQDLTRTQ  242
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  LQSEVTKLRKNLAEEYLHYLSERDACKILIADLNELRYQREDMSLAQSPGIWGEDPVKLTLALKMTRQDLTRTQ  296

Query 243  MELNNMKANFGDVVPRRDFEMQEKTNKDLQEQLDTLRASYEEVRKEHEILMQLHMSTLKERDQFFSELQEIQRT  316
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  MELNNMKANFGDVVPRRDFEMQEKTNKDLQEQLDTLRASYEEVRKEHEILMQLHMSTLKERDQFFSELQEIQRT  370

Query 317  STPRPDWTKCKDVVAGGPERWQMLAEGKNSDQLVDVLLEEIGSGLLREKDFFPGLGYGEAIPAFLRFDGLVENK  390
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  STPRPDWTKCKDVVAGGPERWQMLAEGKNSDQLVDVLLEEIGSGLLREKDFFPGLGYGEAIPAFLRFDGLVENK  444

Query 391  KPSKKDVVNLLKDAWKERLAEEQKETFPDFFFNFLEHRFGPSDAMAWAYTIFENIKIFHSNEVMSQFYAVLMGK  464
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  KPSKKDVVNLLKDAWKERLAEEQKETFPDFFFNFLEHRFGPSDAMAWAYTIFENIKIFHSNEVMSQFYAVLMGK  518

Query 465  RSENVYVTQKETVAQLLKEMTNADSQNEGLLTMEQFNTVLKSTFPLKTEEQIQELMEAGGWHPSSSNADLLNYR  538
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  RSENVYVTQKETVAQLLKEMTNADSQNEGLLTMEQFNTVLKSTFPLKTEEQIQELMEAGGWHPSSSNADLLNYR  592

Query 539  SLFMEDEEGQSEPFVQKLWEQYMDEKDEYLQQLKQELGIELHEEVTLPKLRGGLMTIDPSLDKQTVNTYMSQAF  612
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  SLFMEDEEGQSEPFVQKLWEQYMDEKDEYLQQLKQELGIELHEEVTLPKLRGGLMTIDPSLDKQTVNTYMSQAF  666

Query 613  QLPESEMPEEGDEKEEAVVEILQTALERLQVIDIRRVGPREPEPAS  658
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  QLPESEMPEEGDEKEEAVVEILQTALERLQVIDIRRVGPREPEPAS  712