Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03660
• Subject: XM_017023446.1
• Aligned Length: 2028
• Identities: 1800
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ATGGGTGGGCAC---CTGTCCCCATGGCCCACATACACCAG-TGGCCAGACCATTTTGCAAAATCGAAAACCCT  70
                .|||..||   ||||.|.|          |||..||| |..||||.||                  .|..
Sbjct    1  ----ATGGCGACCGGCTGTACGC----------TACCACAGCTTCCCAGGCC------------------GCGG  42

Query   71  GTTCAGATGACTACCGGAAGCGAGTAGG----GAGCTGCCAGCAGCACCCCTTTCGCACTGCCAAGCCCCAGTA  140
            ||.|.|||..|  |||...||..||.||    |..||||||||||        ||||..|.|||     |||  
Sbjct   43  GTGCTGATTGC--CCGCCTGCCCGTGGGTCATGGCCTGCCAGCAG--------TCGCGGTACCA-----CAG--  99

Query  141  CTTGGAGGAACTGGAAAACTACCTACGCAAGGAGCTCCTCCTGC-TGGACCTGGGCACAGATTCCACCCAGGAA  213
            |||                               |||.||| || |.|          |||||.||.|||    
Sbjct  100  CTT-------------------------------CTCGTCC-GCGTCG----------AGATTACAGCCA----  127

Query  214  CTAAGGCTGCAGCCTTACAGAGAGATCTTTGAGTTCTTCATAGAGGA---CTT-----CAAAACGTACAAG---  276
                     |.||||| ||| |||     |||     .||||||.||   |||     ||.||  .|||||   
Sbjct  128  ---------CGGCCTT-CAG-GAG-----TGA-----CCATAGACGAATCCTTTCTCACAGAA--GACAAGAGC  178

Query  277  --CCATTACTATC-----CTCCATCAAGAATGCGTATGAGGGGATGCTGGCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG  343
              ||   |..|||     ||.|.|||..||  ||.|     |||.||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  179  ACCC---AGAATCGCAAGCTTCTTCAGAAA--CGAA-----GGACGCT-GCCCACCAAAGGGAGAAGATTCGGG  241

Query  344  CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  CTCTGGAGCCCCTGAAGGCCAAGCTTGTCACTGTGAATGAGGACTGCAATGAGAGGATCCTGGCCATGAGAGCT  315

Query  418  GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  GAGGAGAAATATGAAATCTCCCTGCTCAAGAAAGAGAAGATGAACTTGCTAAAACTCATCGACAAAAAGAATGA  389

Query  492  GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  GGAGAAGATTTCATTGCAGAGCGAGGTGACCAAACTGAGGAAGAACTTGGCTGAGGAGTACCTGCACTACCTCA  463

Query  566  GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  GTGAGCGAGATGCCTGTAAGATCCTCATCGCAGACCTGAATGAGCTGCGGTACCAGCGGGAGGACATGTCATTA  537

Query  640  GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  GCCCAGTCGCCAGGCATCTGGGGGGAGGACCCTGTGAAGTTAACCCTGGCTCTTAAGATGACCCGGCAAGACCT  611

Query  714  GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  GACCCGCACGCAGATGGAACTCAACAACATGAAGGCCAACTTTGGAGATGTGGTCCCCAGGAGGGACTTTGAAA  685

Query  788  TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAG  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  TGCAGGAGAAGACCAACAAGGATCTTCAGGAGCAGCTGGACACCCTGAGAGCCAGCTACGAGGAGGTTCGCAAG  759

Query  862  GAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGA  935
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  GAGCATGAGATCCTCATGCAGCTGCACATGAGCACGCTGAAGGAACGGGACCAATTCTTCTCTGAGCTGCAGGA  833

Query  936  GATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAA---------------------------AG  982
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           ||
Sbjct  834  GATCCAGCGCACTTCCACGCCGCGGCCTGACTGGACCAAGTGCAAAGACTCCAGCTCCCTCTCCCCACATGCAG  907

Query  983  ATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTG  1056
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  ATGTGGTGGCTGGGGGCCCAGAGCGCTGGCAGATGCTGGCTGAGGGCAAGAACAGCGACCAGCTGGTGGACGTG  981

Query 1057  CTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCAT  1130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  CTCCTGGAAGAGATTGGTTCGGGGCTGCTGCGGGAGAAAGACTTCTTCCCTGGTCTGGGCTATGGGGAAGCCAT  1055

Query 1131  CCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCA  1204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  CCCTGCTTTTCTTCGGTTTGATGGCCTCGTGGAGAACAAGAAGCCAAGCAAGAAGGACGTGGTCAACCTCCTCA  1129

Query 1205  AGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAG  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  AGGATGCCTGGAAGGAACGTCTTGCTGAGGAGCAGAAAGAGACGTTCCCAGATTTCTTCTTCAATTTCCTGGAG  1203

Query 1279  CATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAA  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  CATCGCTTTGGGCCCAGTGATGCCATGGCCTGGGCTTATACTATTTTTGAAAATATCAAGATCTTCCACTCCAA  1277

Query 1353  CGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGA  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278  CGAGGTTATGAGTCAGTTCTATGCAGTCTTGATGGGAAAGCGGAGTGAGAATGTGTATGTCACCCAGAAGGAGA  1351

Query 1427  CAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTC  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352  CAGTAGCCCAGCTGCTGAAGGAGATGACAAATGCTGACAGTCAGAACGAGGGGCTACTAACCATGGAGCAGTTC  1425

Query 1501  AACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTG  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426  AACACTGTCCTCAAGAGTACCTTCCCTCTCAAGACAGAAGAGCAAATCCAGGAGCTGATGGAGGCAGGGGGCTG  1499

Query 1575  GCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTG  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500  GCATCCCAGCAGCAGCAATGCAGACTTGCTCAACTACCGCTCACTGTTTATGGAGGATGAGGAGGGCCAGAGTG  1573

Query 1649  AGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAG  1722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574  AGCCCTTTGTGCAAAAACTCTGGGAACAATACATGGATGAGAAGGACGAGTACTTACAGCAGCTAAAGCAGGAG  1647

Query 1723  CTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCT  1796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648  CTTGGCATAGAACTCCATGAGGAAGTGACTCTGCCCAAGCTGCGAGGGGGCCTGATGACCATCGACCCCAGCCT  1721

Query 1797  GGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTG  1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722  GGACAAGCAGACAGTGAACACCTACATGAGCCAGGCCTTCCAGCTCCCTGAGTCGGAAATGCCAGAGGAGGGTG  1795

Query 1871  ACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGT  1944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796  ACGAGAAGGAAGAAGCCGTGGTGGAAATCCTCCAGACTGCCCTGGAGCGGCTTCAGGTGATTGACATCAGGCGT  1869

Query 1945  GTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870  GTGGGACCTCGAGAGCCAGAGCCTGCAAGC  1899