Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03823
• Subject: NM_001199469.2
• Aligned Length: 921
• Identities: 855
• Gaps: 66

Alignment

Query   1  ATGGCCCGAAATGCAGAAAAGGCCATGACGGCCTTAGCAAGATTTCGCCAGGCTCAGCTGGAAGAGGGAAAAGT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCCCGAAATGCAGAAAAGGCCATGACGGCCTTAGCAAGATTTCGCCAGGCTCAGCTGGAAGAGGGAAAAGT  74

Query  75  GAAGGAACGAAGACCCTTTCTGGCCTCAGAATGTACTGAACTGCCTAAAGCTGAGAAGTGGAGACGACAGATCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAAGGAACGAAGACCCTTTCTGGCCTCAGAATGTACTGAACTGCCTAAAGCTGAGAAGTGGAGACGACAGATCA  148

Query 149  TTGGAGAGATCTCTAAAAAAGTGGCTCAGATTCAGAATGCTGGTTTAGGTGAATTTCGAATTCGTGACCTGAAT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTGGAGAGATCTCTAAAAAAGTGGCTCAGATTCAGAATGCTGGTTTAGGTGAATTTCGAATTCGTGACCTGAAT  222

Query 223  GATGAAATTAACAAGCTGCTAAGGGAGAAAGGACACTGGGAGGTCCGGATAAAGGAGCTGGGAGGTCCTGATTA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GATGAAATTAACAAGCTGCTAAGGGAGAAAGGACACTGGGAGGTCCGGATAAAGGAGCTGGGAGGTCCTGATTA  296

Query 297  TGGAAAAGTTGGCCCTAAAATGCTGGATCATGAAGGAAAAGAAGTCCCAGGAAACCGAGGTTACAAGTACTTTG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TGGAAAAGTTGGCCCTAAAATGCTGGATCATGAAGGAAAAGAAGTCCCAGGAAACCGAGGTTACAAGTACTTTG  370

Query 371  GAGCAGCAAAAGATTTGCCTGGTGTTAGAGAGCTGTTTGAAAAAGAAC--------------------------  418
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                          
Sbjct 371  GAGCAGCAAAAGATTTGCCTGGTGTTAGAGAGCTGTTTGAAAAAGAACGCCAGGTGCGGTGGCTCATGCCTGTA  444

Query 419  ----------------------------------------CTCTTCCTCCTCCCAGAAAGACACGTGCTGAGCT  452
                                                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCGGGCGGATCACAAGCTCTTCCTCCTCCCAGAAAGACACGTGCTGAGCT  518

Query 453  CATGAAGGCAATCGATTTTGAGTACTATGGTTACCTAGATGAAGATGATGGTGTTATTGTGCCTTTGGAACAGG  526
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  CATGAAGGCAATCGATTTTGAGTACTATGGTTACCTAGATGAAGATGATGGTGTTATTGTGCCTTTGGAACAGG  592

Query 527  AATATGAAAAGAAACTCAGAGCCGAGTTAGTGGAAAAGTGGAAAGCAGAGAGAGAGGCTCGGCTGGCAAGAGGA  600
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AATATGAAAAGAAACTCAGAGCCGAGTTAGTGGAAAAGTGGAAAGCAGAGAGAGAGGCTCGGCTGGCAAGAGGA  666

Query 601  GAAAAGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGATCAACATCTATGCAGTCACCGAGGAGGAGTCGGACGAGGA  674
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  GAAAAGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGAGATCAACATCTATGCAGTCACCGAGGAGGAGTCGGACGAGGA  740

Query 675  AGGCAGCCAGGAGAAAGGAGGGGACGACAGCCAGCAGAAGTTCATTGCTCACGTCCCTGTTCCCTCGCAGCAAG  748
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  AGGCAGCCAGGAGAAAGGAGGGGACGACAGCCAGCAGAAGTTCATTGCTCACGTCCCTGTTCCCTCGCAGCAAG  814

Query 749  AGATTGAGGAGGCACTGGTGCGAAGGAAGAAAATGGAACTCCTCCAGAAGTATGCAAGCGAGACCCTGCAGGCC  822
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  AGATTGAGGAGGCACTGGTGCGAAGGAAGAAAATGGAACTCCTCCAGAAGTATGCAAGCGAGACCCTGCAGGCC  888

Query 823  CAAAGTGAAGAAGCCAGAAGGCTCCTGGGGTAT  855
           |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  CAAAGTGAAGAAGCCAGAAGGCTCCTGGGGTAT  921