Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03829
• Subject: XM_017024896.2
• Aligned Length: 2085
• Identities: 1608
• Gaps: 477

Alignment

Query    1  ATGGAGGAGAAGCCCGGCCAGCCACAGCCTCAGCACCATCACAGCCACCACCATCCGCACCATCACCCTCAGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCAGCAGCAGCAGCCGCACCACCACCACCATTATTATTTCTACAACCACAGCCACAACCACCACCACCACCATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATCACCAGCAGCCTCACCAATACCTGCAGCATGGAGCCGAGGGCAGCCCCAAGGCCCAGCCAAAGCCGCTGAAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CATGAGCAGAAACACACCCTCCAGCAGCACCAGGAAACGCCGAAGAAGAAAACAGGCTATGGTGAACTAAACGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TAATGCTGGAGAAAGAGAAATATCTTTAAAGAACCTGAGTTCTGATGAAGCCACCAACCCTATTTCCAGGGTCC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCAATGGCAACCAGCAAGTTGTAGACACTAGCCTGAAGCAGACTGTAAAGGCCAACACCTTTGGGAAAGCAGGA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  ATTAAAACCAAGAATTTCATTCAGAAAAACAGTATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAATAAATCTGG  518
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------ATGGACAAAAAGAATGGGAAGTCTTATGAAAATAAATCTGG  41

Query  519  AGAGAATCAGTCTGTAGATAAGTCTGATACTATACCAATTCCAAATGGTGTGGTAACAAATAATTCTGGTTATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   42  AGAGAATCAGTCTGTAGATAAGTCTGATACTATACCAATTCCAAATGGTGTGGTAACAAATAATTCTGGTTATA  115

Query  593  TTACTAATGGTTATATGGGTAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGCGGATATACAACTCCTAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  TTACTAATGGTTATATGGGTAAAGGAGCAGATAATGATGGTAGTGGATCTGAGAGCGGATATACAACTCCTAAA  189

Query  667  AAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATATAGTGCAGGACAAAATAATGCAACA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  AAAAGGAAAGCTAGGCGCAATAGTGCCAAGGGTTGTGAAAACCTTAATATAGTGCAGGACAAAATAATGCAACA  263

Query  741  AGAGACCAGTGTCCCAACCTTAAAACAGGGACTTGAAACTTTCAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAAATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  AGAGACCAGTGTCCCAACCTTAAAACAGGGACTTGAAACTTTCAAGCCTGACTATAGTGAACAAAAGGGAAATC  337

Query  815  GAGTAGATGGTTCGAAGCCCATTTGGAAGTATGAAACTGGGCCTGGAGGAACAAGTCGAGGAAAACCTGCTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  GAGTAGATGGTTCGAAGCCCATTTGGAAGTATGAAACTGGGCCTGGAGGAACAAGTCGAGGAAAACCTGCTGTG  411

Query  889  GGTGATATGCTTCGGAAAAGCTCAGATAGTAAACCTGGTGTGAGCAGCAAAAAGTTTGATGATCGGCCCAAAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  GGTGATATGCTTCGGAAAAGCTCAGATAGTAAACCTGGTGTGAGCAGCAAAAAGTTTGATGATCGGCCCAAAGG  485

Query  963  AAAGCATGCTTCAGCTGTTGCCTCCAAAGAGGACTCGTGGACCCTATTTAAACCACCCCCAGTTTTTCCAGTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  AAAGCATGCTTCAGCTGTTGCCTCCAAAGAGGACTCGTGGACCCTATTTAAACCACCCCCAGTTTTTCCAGTGG  559

Query 1037  ACAATAGCAGTGCTAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACTATA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  ACAATAGCAGTGCTAAAATAGTTCCTAAAATAAGTTATGCAAGCAAAGTTAAGGAAAACCTCAACAAAACTATA  633

Query 1111  CAGAACTCTTCTGTGTCACCAACTTCATCTTCATCATCTTCATCATCTACCGGGGAAACTCAGACCCAATCATC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  CAGAACTCTTCTGTGTCACCAACTTCATCTTCATCATCTTCATCATCTACCGGGGAAACTCAGACCCAATCATC  707

Query 1185  AAGTCGCTTATCCCAGGTCCCTATGTCAGCGCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAACTTTTCTAATGGGCCTGTTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  AAGTCGCTTATCCCAGGTCCCTATGTCAGCGCTGAAATCTGTTACTTCTGCCAACTTTTCTAATGGGCCTGTTT  781

Query 1259  TAGCAGGGACTGATGGAAATGTTTATCCTCCAGGGGGTCAGCCACTGCTAACTACTGCTGCTAATACTCTAACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  TAGCAGGGACTGATGGAAATGTTTATCCTCCAGGGGGTCAGCCACTGCTAACTACTGCTGCTAATACTCTAACA  855

Query 1333  CCCATCTCTTCTGGGACAGATTCAGTTCTCCAGGACATGAGTCTAACTTCAGCAGCTGTTGAACAAATTAAGAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  CCCATCTCTTCTGGGACAGATTCAGTTCTCCAGGACATGAGTCTAACTTCAGCAGCTGTTGAACAAATTAAGAC  929

Query 1407  TAGCCTTTTTATCTATCCTTCAAATATGCAAACTATGCTGTTGAGCACAGCACAAGTGGATCTGCCCTCTCAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  TAGCCTTTTTATCTATCCTTCAAATATGCAAACTATGCTGTTGAGCACAGCACAAGTGGATCTGCCCTCTCAGA  1003

Query 1481  CAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAGTGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCTGGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  CAGATCAGCAAAACCTGGGGGATATCTTCCAGAATCAGTGGGGTTTATCATTTATAAATGAGCCCAGTGCTGGC  1077

Query 1555  CCTGAGACTGTTACTGGGAAGTCATCAGAGCATAAAGTGATGGAGGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGCTAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  CCTGAGACTGTTACTGGGAAGTCATCAGAGCATAAAGTGATGGAGGTGACATTTCAAGGAGAATATCCTGCTAC  1151

Query 1629  TTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTACGAGCTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  TTTGGTTTCACAGGGTGCTGAAATAATTCCCTCAGGAACTGAGCATCCTGTGTTTCCCAAGGCTTACGAGCTGG  1225

Query 1703  AGAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTAGCATTCTAAAATCTGGGACTACTAGTGAGAGTGGAGCCTTATCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  AGAAACGGACTAGTCCTCAAGTTCTGGGTAGCATTCTAAAATCTGGGACTACTAGTGAGAGTGGAGCCTTATCC  1299

Query 1777  TTGGAACCCAGTCATATAGGTGACCTGCAGAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTCAAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1300  TTGGAACCCAGTCATATAGGTGACCTGCAGAAAGCAGACACCAGTAGTCAAGGTGCTTTAGTGTTTCTCTCAAA  1373

Query 1851  GGACTACGAGATAGAAAGTCAAAATCCTCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCTGCCAAAGAACAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1374  GGACTACGAGATAGAAAGTCAAAATCCTCTGGCCTCTCCTACGAACACTTTGTTAGGCTCTGCCAAAGAACAGA  1447

Query 1925  GATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCACACT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1448  GATACCAGAGAGGCCTAGAAAGGAATGATAGCTGGGGTTCTTTTGACCTGAGGGCTGCTATTGTATATCACACT  1521

Query 1999  AAAGAAATGGAATCTATTTGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCATGGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1522  AAAGAAATGGAATCTATTTGGAATTTGCAGAAGCAAGATCCCAAAAGGATAATCACTTACAATGAAGCCATGGA  1595

Query 2073  TAGTCCAGATCAA  2085
            |||||||||||||
Sbjct 1596  TAGTCCAGATCAA  1608