Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03863
• Subject: NM_001270407.1
• Aligned Length: 894
• Identities: 786
• Gaps: 108

Alignment

Query   1  ATGGCGAGGAGGAGCCGCCACCGCCTCCTCCTGCTGCTGCTGCGCTACCTGGTGGTCGCCCTGGGCTATCATAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGAGGAGGAGCCGCCACCGCCTCCTCCTGCTGCTGCTGCGCTACCTGGTGGTCGCCCTGGGCTATCATAA  74

Query  75  GGCCTATGGGTTTTCTGCCCCAAAAGACCAACAAGTAGTCACAGCAGTAGAGTACCAAGAGGCTATTTTAGCCT  148
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  75  GGCCTATGGGTTTTCTGCCCCAAAAGACCAACAAGTAGTCACAGCAGTAGAGTAC-------------------  129

Query 149  GCAAAACCCCAAAGAAGACTGTTTCCTCCAGATTAGAGTGGAAGAAACTGGGTCGGAGTGTCTCCTTTGTCTAC  222
                                                                                     
Sbjct 130  --------------------------------------------------------------------------  129

Query 223  TATCAACAGACTCTTCAAGGTGATTTTAAAAATCGAGCTGAGATGATAGATTTCAATATCCGGATCAAAAATGT  296
                          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 130  ---------------CAAGGTGATTTTAAAAATCGAGCTGAGATGATAGATTTCAATATCCGGATCAAAAATGT  188

Query 297  GACAAGAAGTGATGCGGGGAAATATCGTTGTGAAGTTAGTGCCCCATCTGAGCAAGGCCAAAACCTGGAAGAGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 189  GACAAGAAGTGATGCGGGGAAATATCGTTGTGAAGTTAGTGCCCCATCTGAGCAAGGCCAAAACCTGGAAGAGG  262

Query 371  ATACAGTCACTCTGGAAGTATTAGTGGCTCCAGCAGTTCCATCATGTGAAGTACCCTCTTCTGCTCTGAGTGGA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263  ATACAGTCACTCTGGAAGTATTAGTGGCTCCAGCAGTTCCATCATGTGAAGTACCCTCTTCTGCTCTGAGTGGA  336

Query 445  ACTGTGGTAGAGCTACGATGTCAAGACAAAGAAGGGAATCCAGCTCCTGAATACACATGGTTTAAGGATGGCAT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337  ACTGTGGTAGAGCTACGATGTCAAGACAAAGAAGGGAATCCAGCTCCTGAATACACATGGTTTAAGGATGGCAT  410

Query 519  CCGTTTGCTAGAAAATCCCAGACTTGGCTCCCAAAGCACCAACAGCTCATACACAATGAATACAAAAACTGGAA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411  CCGTTTGCTAGAAAATCCCAGACTTGGCTCCCAAAGCACCAACAGCTCATACACAATGAATACAAAAACTGGAA  484

Query 593  CTCTGCAATTTAATACTGTTTCCAAACTGGACACTGGAGAATATTCCTGTGAAGCCCGCAATTCTGTTGGATAT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485  CTCTGCAATTTAATACTGTTTCCAAACTGGACACTGGAGAATATTCCTGTGAAGCCCGCAATTCTGTTGGATAT  558

Query 667  CGCAGGTGTCCTGGGAAACGAATGCAAGTAGATGATCTCAACATAAGTGGCATCATAGCAGCCGTAGTAGTTGT  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559  CGCAGGTGTCCTGGGAAACGAATGCAAGTAGATGATCTCAACATAAGTGGCATCATAGCAGCCGTAGTAGTTGT  632

Query 741  GGCCTTAGTGATTTCCGTTTGTGGCCTTGGTGTATGCTATGCTCAGAGGAAAGGCTACTTTTCAAAAGAAACCT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633  GGCCTTAGTGATTTCCGTTTGTGGCCTTGGTGTATGCTATGCTCAGAGGAAAGGCTACTTTTCAAAAGAAACCT  706

Query 815  CCTTCCAGAAGAGTAATTCTTCATCTAAAGCCACGACAATGAGTGAAAATGATTTCAAGCACACAAAATCCTTT  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707  CCTTCCAGAAGAGTAATTCTTCATCTAAAGCCACGACAATGAGTGAAAATGATTTCAAGCACACAAAATCCTTT  780

Query 889  ATAATT  894
           ||||||
Sbjct 781  ATAATT  786