Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03868
• Subject: XM_017315161.1
• Aligned Length: 2586
• Identities: 2327
• Gaps: 72

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGTCTTTTCCACCTCA  17
                                                                     ||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGGACAGACAGAGAAAAGAGGGTCTTTGCCAACTCCTTTGGACTGGTGCAGTCAGAATGTCTTTCCCCCCTCA  74

Query   18  TTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCACTCCCACCAGGGATCCCACCCCCGCAGTTTCCAGGATTTCCTC  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  TTTGAATCGCCCTCCCATGGGAATCCCAGCTCTCCCTCCAGGGATCCCACCCCCACAGTTTCCTGGCTTTCCTC  148

Query   92  CACCTGTACCTCCAGGGACCCCAATGATTCCTGTACCAATGAGCATTATGGCTCCTGCTCCAACTGTCTTAGTA  165
            ||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  149  CACCAGTACCTCCAGGGACACCGATGATTCCTGTACCAATGAGTATTATGGCTCCTGCTCCAACTGTCCTAGTA  222

Query  166  CCCACTGTGTCTATGGTTGGAAAGCATTTGGGCGCAAGAAAGGATCATCCAGGCTTAAAGGCTAAAGAAAATGA  239
            ||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||....|||||||||||
Sbjct  223  CCTACCGTGTCCATGGTTGGAAAGCATTTGGGAGCCAGAAAGGATCATCCAGGCTTAAAATTAAAAGAAAATGA  296

Query  240  TGAAAATTGTGGTCCTACTACCACTGTTTTTGTTGGCAACATTTCCGAGAAAGCTTCAGACATGCTTATAAGAC  313
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct  297  TGAAAATTGTGGCCCTACTACTACAGTTTTTGTTGGGAACATTTCTGAGAAGGCTTCAGACATGCTTATACGAC  370

Query  314  AACTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTTTTGAGCTGGAAGAGAGTACAAGGTGCTTCCGGAAAGCTTCAAGCCTTC  387
            |.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||.
Sbjct  371  AGCTCTTAGCTAAATGTGGTTTGGTGTTGAGCTGGAAGAGAGTGCAAGGTGCTTCTGGGAAACTTCAAGCTTTT  444

Query  388  GGATTCTGTGAGTACAAGGAGCCAGAATCTACCCTCCGTGCACTCAGATTATTACATGACCTGCAAATTGGAGA  461
            |||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  GGATTTTGTGAGTATAAAGAGCCTGAATCTACCCTCCGTGCTCTCAGATTATTGCATGACCTTCAGATTGGAGA  518

Query  462  GAAAAAGCTACTCGTTAAAGTTGATGCAAAGACAAAGGCACAGCTGGATGAATGGAAAGCAAAGAAGAAAGCTT  535
            |||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct  519  GAAGAAGCTACTTGTTAAAGTTGATGCCAAGACAAAGGCACAGTTGGATGAATGGAAAGCAAAGAAGAAAG---  589

Query  536  CTAATGGGAATGCAAGGCCAGAAACTGTCACTAATGACGATGAAGAAGCCTTGGATGAAGAAACAAAGAGGAGA  609
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct  590  CTAATGGGAACGCCAGACCAGAAACTGTCACTAATGATGATGAAGAAGCCTTAGATGAAGAAACAAAGCGAAGA  663

Query  610  GATCAGATGATTAAAGGGGCTATTGAAGTTTTAATTCGTGAATACTCCAGTGAGCTAAATGCCCCCTCACAGGA  683
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GACCAGATGATTAAAGGGGCCATTGAAGTTTTAATCCGAGAATATTCCAGTGAACTAAATGCCCCCTCACAGGA  737

Query  684  ATCTGATTCTCACCCCAGGAAGAAGAAGAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGCAGATTTCCAGTGGCCCCAC  757
            .|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.
Sbjct  738  GTCTGACTCTCACCCCAGAAAGAAGAAAAAGGAAAAGAAGGAGGACATTTTCCGTAGATTTCCAGTGGCCCCAT  811

Query  758  TGATCCCTTATCCACTCATCACTAAGGAGGATATAAATGCTATAGAAATGGAAGAAGACAAAAGAGACCTGATA  831
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct  812  TGATCCCTTACCCACTCATCACCAAGGAGGATATAAATGCTATTGAAATGGAAGAAGACAAAAGAGATTTGATA  885

Query  832  TCTCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGACACACATAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGCAAAAAGGAAAAAGAAAG  905
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  886  TCCCGAGAGATCAGCAAATTCAGAGATACACACAAGAAACTGGAAGAAGAGAAAGGCAAAAAAGAAAAAGAAAG  959

Query  906  ACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAGCGTGAAAGGGAACGAGAAAGGCGAGAACGGGAAC  979
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  ACAGGAAATTGAGAAAGAACGGAGAGAAAGAGAGAGGGAACGTGAAAGGGAACGAGAAAGGCGAGAACGGGAAC  1033

Query  980  GAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAGAAAGAACGGGAGCGGGAACGAGAACGGGATAGGGACCGT  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1034  GAGAAAGGGAAAGAGAACGTGAACGAGAAAAGGAAAAAGAACGGGAGCGGGAACGAGAACGGGATAGGGATCGT  1107

Query 1054  GACCGGACAAAAGAGAGAGACCGAGATCGGGATCGAGAGAGAGATCGTGACCGGGATAGAGAAAGGAGCTCAGA  1127
            |||||.||||||||||||||||||      |||||||||||||||||.|||||.|||.|||||.||||||||||
Sbjct 1108  GACCGCACAAAAGAGAGAGACCGA------GATCGAGAGAGAGATCGGGACCGAGATCGAGAACGGAGCTCAGA  1175

Query 1128  TCGTAATAAGGATCGCAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACGAGAGCGGGAAAGAGAGA  1201
            |||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||      |
Sbjct 1176  TCGAAATAAGGATCGGAGTCGATCAAGAGAAAAAAGCAGAGATCGTGAAAGGGAACGGGAGCGGGAA------A  1243

Query 1202  GAGAGAGAGAACGAGAGCGAGAACGAGAACGGGAGCGAGAGAGAGAGCGAGAGAGGGAACGGGAGCGAGAAAGA  1275
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1244  GAGAGAGAGAACGAGAACGGGAACGAGAACGAGAGCGAGAGAGAGAACGGGAGAGAGAACGGGAACGGGAAAGA  1317

Query 1276  GAAAAAGACAAAAAACGGGACCGAGAAGAAGATGAAGAAGATGCATACGAACGAAGAAAACTTGAAAGAAAACT  1349
            ||.||||||||.|||.|.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1318  GAGAAAGACAAGAAAAGAGACAGAGAAGAGGATGAAGAAGATGCATATGAACGAAGAAAACTCGAACGAAAACT  1391

Query 1350  CCGAGAGAAAGAAGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACGAAAGAAAACCCGGGAAT  1423
            .|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||
Sbjct 1392  GCGAGAGAAAGAGGCTGCTTATCAAGAGCGCCTTAAGAATTGGGAAATCAGAGAACGAAAGAAAACTAGGGAAT  1465

Query 1424  ATGAGAAAGAAGCTGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCCAAAGAAGCTAAACGACTAAAAGAATTC  1497
            |||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1466  ATGAGAAGGAGGCAGAAAGAGAAGAAGAAAGAAGAAGAGAAATGGCTAAGGAGGCTAAACGACTAAAAGAATTC  1539

Query 1498  TTAGAAGACTATGATGATGATAGAGATGACCCCAAATATTACAGAGGAAGTGCTCTTCAGAAAAGGTTGCGTGA  1571
            .|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1540  CTAGAAGATTATGATGATGATAGAGATGACCCGAAGTACTACAGGGGTAGTGCTCTTCAGAAACGGTTGCGTGA  1613

Query 1572  TAGAGAAAAGGAAATGGAAGCAGATGAACGAGATAGGAAGAGAGAGAAGGAGGAGCTTGAGGAAATCAGGCAGC  1645
            |||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614  TAGGGAAAAAGAAATGGAAGCTGATGAACGAGACAGGAAGAGAGAGAAGGAAGAGCTTGAGGAAATCAGGCAGC  1687

Query 1646  GCCTTCTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAGAGGCTGAGAGGCGCAGG  1719
            ||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688  GCTTACTGGCAGAAGGGCATCCAGATCCAGATGCAGAGCTCCAGAGGATGGAACAAGAGGCTGAGAGGCGCAGG  1761

Query 1720  CAGCCACAAATAAAGCAAGAGCCAGAATCAGAAGAGGAGGAAGAAGAAAAGCAAGAAAAAGAAGAAAAACGAGA  1793
            ||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762  CAACCTCAAATAAAGCAAGAACCAGAATCCGAGGAAGAAGAAGAAGAAAAGCAAGAAAAAGAAGAAAAACGAGA  1835

Query 1794  AGAACCCATGGAAGAGGAAGAGGAGCCAGAGCAAAAGCCTTGTCTGAAACCTACTCTGAGGCCCATCAGCTCTG  1867
            .||.||..||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||.|||||||||||||
Sbjct 1836  GGAGCCTGTGGAAGAGGAGGAAGAACCAGAGCAAAAGCCTTGTCTCAAGCCGACTTTGAGACCCATCAGCTCTG  1909

Query 1868  CTCCATCTGTTTCCTCTGCCAGTGGCAATGCAACACCTAACACTCCTGGGGATGAGTCTCCCTGTGGTATTATT  1941
            |.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1910  CCCCATCTGTGTCCTCTGCCAGTGGCAACGCAACCCCCAACACTCCTGGGGATGAGTCTCCTTGTGGTATTATT  1983

Query 1942  ATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAACCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATAGGACTAAGTCTTAAACT  2015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
Sbjct 1984  ATTCCTCATGAAAACTCACCAGATCAACAGCAGCCTGAGGAGCATAGGCCAAAAATAGGACTAAGCCTTAAATT  2057

Query 2016  GGGTGCTTCCAATAGTCCTGGTCAGCCTAATTCTGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGTAGATAGTGTCTTTAACA  2089
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2058  GGGTGCTTCCAATAGTCCTGGCCAACCTAATTCAGTGAAGAGAAAGAAACTACCTGTAGATAGTGTCTTTAACA  2131

Query 2090  AATTTGAGGATGAAGACAGTGATGACGTACCCCGAAAAAGGAAACTGGTTCCCTTGGATTATGGTGAAGATGAT  2163
            ||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct 2132  AATTCGAGGATGAGGACAGTGATGATGTGCCCCGAAAAAGGAAACTCGTTCCCCTGGATTATGGCGAAGATGAT  2205

Query 2164  AAAAATGCAACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGTAAACACATTAAGAGTCTCATTGAGAAAATCCC  2237
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2206  AAAAATGCCACCAAAGGCACTGTAAACACTGAAGAAAAGCGCAAACACATTAAGAGTCTCATTGAGAAAATTCC  2279

Query 2238  TACAGCCAAACCTGAGCTCTTCGCTTATCCCCTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTATACTGATGGAACGTCGAA  2311
            .||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 2280  CACAGCCAAACCTGAGCTCTTTGCTTATCCTTTGGATTGGTCTATTGTGGATTCTATACTGATGGAACGAAGAA  2353

Query 2312  TTAGACCATGGATTAATAAGAAAATCATAGAATATATAGGTGAAGAAGAAGCTACATTAGTTGATTTTGTTTGT  2385
            |..|.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2354  TCCGGCCATGGATCAATAAGAAAATCATCGAATACATAGGTGAAGAAGAAGCTACATTAGTTGATTTTGTTTGC  2427

Query 2386  TCTAAGGTTATGGCTCATAGTTCACCCCAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTACTTGATGAAGAAGCAGA  2459
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2428  TCTAAGGTTATGGCACATAGTTCACCACAGAGCATTTTAGATGATGTTGCCATGGTACTAGATGAAGAAGCAGA  2501

Query 2460  AGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAATTGGTCTTGTGAAG  2529
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2502  AGTTTTTATAGTCAAAATGTGGAGATTATTGATATATGAAACAGAAGCCAAGAAAATTGGCCTTGTGAAG  2571