Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03948
• Subject: XM_017007041.1
• Aligned Length: 1950
• Identities: 1437
• Gaps: 513

Alignment

Query    1  ATGGCCGGCGCTCGGGCCGCCGCCGCCGCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGCAACCAGCCGCCTCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGCTGGGGCTTGGGGAGCTGCTGGAGGAGTTCTCCCGGACTCAGTACCGGGCCAAGGATGGCAGCGGGACCG  148
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------ATGGCAGCGGGACCG  15

Query  149  GCGGCTCTAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCCGAGACTACTGTTTCAGCGTGATT  222
            |||||||||||                                                               
Sbjct   16  GCGGCTCTAAG---------------------------------------------------------------  26

Query  223  CCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTCCTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAA  296
                                                                                      
Sbjct   27  --------------------------------------------------------------------------  26

Query  297  GGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC  370
                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   27  ------------GTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCTCATCCACCGCAGCAAGATGGCCC  88

Query  371  GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   89  GGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACATTTGCAGGTCGGCCACACTGGCT  162

Query  445  GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  163  GGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGGGGTGCAGATGATGCCTGGGCAGA  236

Query  519  TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  237  TGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCATCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCT  310

Query  593  ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  311  ATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGATGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAG  384

Query  667  TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  385  TTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTATGCCGACTTCACTCTCCTCTCCAT  458

Query  741  CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  459  CCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACATGGCAGAAGGGCTCATATTTAACT  532

Query  815  GGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTCACTCTCTGAACATTGACTGGAGC  888
            |||||                                                                     
Sbjct  533  GGAAG---------------------------------------------------------------------  537

Query  889  CAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA  962
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  ------CAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTGCTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGA  605

Query  963  TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  606  TGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCCCCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCC  679

Query 1037  TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  680  TTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGATCCTCTACCTCACTGTGGCCTAT  753

Query 1111  GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  754  GACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAGGAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAA  827

Query 1185  TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  828  TTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAGGAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGG  901

Query 1259  ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  902  ATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTGGCAGCACCACCAGCCTTGGCAGC  975

Query 1333  GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  976  GACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACCTATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCC  1049

Query 1407  AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1050  AGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCCACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGC  1123

Query 1481  CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  CACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCAGGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCA  1197

Query 1555  AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAG---------------  1613
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 1198  AACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCCAAACCCAGATCAGTGGACCATCC  1271

Query 1614  --------------------------------------------------------------------------  1613
                                                                                      
Sbjct 1272  CCTGCCCGGATCCTCTCTCTCCACAGACTATGGCAGCTGGCAGATGGTAACGGGCTGTGGCAGTATTCAGGAGC  1345

Query 1614  -------------------------------------------------------------------GCTTGCA  1620
                                                                               |||||||
Sbjct 1346  GGGCTGTCCTGCACACAGACTCCTCTCTCCCTTTCAGCTTCCCGGATGAGCTCCCTAACAGTTGTCTGCTTGCA  1419

Query 1621  GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG  1694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1420  GCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTACAGCAGCACAGTGGG  1493

Query 1695  GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC  1768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1494  GCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTGCCCGTGGTGTTGGAC  1567

Query 1769  TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1794
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1568  TCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1593