Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04579
• Subject: NM_001346343.2
• Aligned Length: 786
• Identities: 654
• Gaps: 132

Alignment

Query   1  ATGGCCTTGGGATTAAAGTGCTTCCGCATGGTCCACCCTACCTTTCGCAATTATCTTGCAGCCTCTATCAGACC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  CGTTTCAGAAGTTACACTGAAGACAGTGCATGAAAGACAACATGGCCATAGGCAATACATGGCCTATTCAGCTG  148
                                                                     ||||||||||||||||
Sbjct   1  ----------------------------------------------------------ATGGCCTATTCAGCTG  16

Query 149  TACCAGTCCGCCATTTTGCTACCAAGAAAGCCAAAGCCAAAGGGAAAGGACAGTCCCAAACCAGAGTGAATATT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  17  TACCAGTCCGCCATTTTGCTACCAAGAAAGCCAAAGCCAAAGGGAAAGGACAGTCCCAAACCAGAGTGAATATT  90

Query 223  AATGCTGCCTTGGTTGAGGATATAATCAACTTGGAAGAGGTGAATGAAGAAATGAAGTCTGTGATAGAAGCTCT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  91  AATGCTGCCTTGGTTGAGGATATAATCAACTTGGAAGAGGTGAATGAAGAAATGAAGTCTGTGATAGAAGCTCT  164

Query 297  CAAGGATAATTTCAATAAGACTCTCAATATAAGGACCTCACCAGGATCCCTTGACAAGATTGCTGTGGTAACTG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 165  CAAGGATAATTTCAATAAGACTCTCAATATAAGGACCTCACCAGGATCCCTTGACAAGATTGCTGTGGTAACTG  238

Query 371  CTGACGGGAAGCTTGCTTTAAACCAGATTAGCCAGATCTCCATGAAGTCGCCACAGCTGATTTTGGTGAATATG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 239  CTGACGGGAAGCTTGCTTTAAACCAGATTAGCCAGATCTCCATGAAGTCGCCACAGCTGATTTTGGTGAATATG  312

Query 445  GCCAGCTTCCCAGAGTGTACAGCTGCAGCTATCAAGGCTATAAGAGAAAGTGGAATGAATCTGAACCCAGAAGT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 313  GCCAGCTTCCCAGAGTGTACAGCTGCAGCTATCAAGGCTATAAGAGAAAGTGGAATGAATCTGAACCCAGAAGT  386

Query 519  GGAAGGGACGCTAATTCGGGTACCCATTCCCCAAGTAACCAGAGAGCACAGAGAAATGCTGGTGAAACTGGCCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 387  GGAAGGGACGCTAATTCGGGTACCCATTCCCCAAGTAACCAGAGAGCACAGAGAAATGCTGGTGAAACTGGCCA  460

Query 593  AACAGAACACCAACAAGGCCAAAGACTCTTTACGGAAGGTTCGCACCAACTCAATGAACAAGCTGAAGAAATCC  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461  AACAGAACACCAACAAGGCCAAAGACTCTTTACGGAAGGTTCGCACCAACTCAATGAACAAGCTGAAGAAATCC  534

Query 667  AAGGATACAGTCTCAGAGGACACCATTAGGCTAATAGAGAAACAGATCAGCCAAATGGCCGATGACACAGTGGC  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535  AAGGATACAGTCTCAGAGGACACCATTAGGCTAATAGAGAAACAGATCAGCCAAATGGCCGATGACACAGTGGC  608

Query 741  AGAACTGGACAGGCATCTGGCAGTGAAGACCAAAGAACTCCTTGGA  786
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 609  AGAACTGGACAGGCATCTGGCAGTGAAGACCAAAGAACTCCTTGGA  654