Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_04914
• Subject: NM_001354319.1
• Aligned Length: 874
• Identities: 699
• Gaps: 170

Alignment

Query   1  ATGACTGGCAAAACACAGACCAGCAACGTCACCAATAAGAATGACCCCAAGTCCATCAACTCCCGTGTTTTCAT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGACTGGCAAAACACAGACCAGCAACGTCACCAATAAGAATGACCCCAAGTCCATCAACTCCCGTGTTTTCAT  74

Query  75  CGGCAATCTAAATACGGCAATTGTCAAGAAAGTTGACATTGAAGCCATTTTTTCAAAGTATGGAAAAATAGTTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CGGCAATCTAAATACGGCAATTGTCAAGAAAGTTGACATTGAAGCCATTTTTTCAAAGTATGGAAAAATAGTTG  148

Query 149  GATGTTCCGTTCACAAAGGTTATGCATTTGTACAGTACATGAGTGAGCGACATGCAAGAGCTGCAGTGGCTGGA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GATGTTCCGTTCACAAAGGTTATGCATTTGTACAGTACATGAGTGAGCGACATGCAAGAGCTGCAGTGGCTGGA  222

Query 223  GAAAATGCCAGAGTCATCGCCGGCCAACCACTTGATATCAACATGGCAGGAGAGCCCAAACCATACAGACCAAA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GAAAATGCCAGAGTCATCGCCGGCCAACCACTTGATATCAACATGGCAGGAGAGCCCAAACCATACAGACCAAA  296

Query 297  ACCTGGAAACAAGAGGCCCCTTTCTGCACTTTACAGACTTGAATCAAAGGAACCTTTCCTGTCTGTTGGCGGTT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  ACCTGGAAACAAGAGGCCCCTTTCTGCACTTTACAGACTTGAATCAAAGGAACCTTTCCTGTCTGTTGGCGGTT  370

Query 371  ATGTCTTTGACTATGATTACTACAGAGATGATTTCTACAATCGGTTATTTGATTACCACGGGCGTGTGCCTCCA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  ATGTCTTTGACTATGATTACTACAGAGATGATTTCTACAATCGGTTATTTGATTACCACGGGCGTGTGCCTCCA  444

Query 445  CCTCCCCGTGCAGTAATTCCGCTGAAGCGTCCCAGAGTGGCAGTCACAACGACTCGCAGGGGGAAAGGAGTCTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CCTCCCCGTGCAGTAATTCCGCTGAAGCGTCCCAGAGTGGCAGTCACAACGACTCGCAGGGGGAAAGGAGTCTT  518

Query 519  TTCCATGAAAGGTGGATCGAGATCTACTGCCAGTGGGTCAACAGGTTCTAAATTGAAATCAGATGAGTTACAGA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TTCCATGAAAGGTGGATCGAGATCTACTGCCAGTGGGTCAACAGGTTCTAAATTGAAATCAGATGAGTTACAGA  592

Query 593  CCATCAAGAAAGAATTAACCCAGATCAAAACTAAAATTGACTCCTTGCTAGGGCGCCTGGAGAAGATTGAGAAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CCATCAAGAAAGAATTAACCCAGATCAAAACTAAAATTGACTCCTTGCTAGGGCGCCTGGAGAAGATTGAGAAA  666

Query 667  CAGCAGAAGGCGGAGGCAGAAGCT-CAGAAGAAGCAATTGGAAGAGAGTCTAGTGCTGATCCAAGAGGAATGTG  739
           |||||||||||||||||||...|| ||||..|||                      |||||             
Sbjct 667  CAGCAGAAGGCGGAGGCAGTTTCTACAGATAAAG----------------------TGATC-------------  705

Query 740  TGTCAGAGATTGCAGATCACTCTACAGAGGAGCCTGCTGAAGGAGGGCCAGATGCCGATGGAGAAGAGATGACA  813
                                                                                     
Sbjct 706  --------------------------------------------------------------------------  705

Query 814  GATGGGATAGAGGAGGACTTCGATGAAGATGGGGGTCATGAGCTGTTTCTACAGATAAAG  873
                                                                       
Sbjct 706  ------------------------------------------------------------  705