Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05019
- Subject:
- NM_178640.2
- Aligned Length:
- 1516
- Identities:
- 1306
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGG---CTGCGGCTGCG 71
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||| ||..||||.||
Sbjct 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCTTGCGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCACCTCTGGCTCCG 74
Query 72 CTCCCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTA 145
.|||||||||..|.||..|..|.|||||.||.||.|.||||||||.|..||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 75 TTCCCCGCCGGACCCCCACAACACCGGGCCCAGCGCGGCAGATCAATCAGCCTTATTTCCTCACTGGAAATTTA 148
Query 146 CTCACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTTGTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACC 219
..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|.||||
Sbjct 149 GCCACTATGATGTGGTAGTTGGTGTGTTATCAGCTCGAAATAACCACGAACTTCGAAATGTGATAAGGAACACC 222
Query 220 TGGATG-AGACATTTGCTACAGCATCCCACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATG 292
|||.|| ||| |||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 223 TGGCTGAAGA-ATTTGCTGCATCATCCTACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCCCGTG 295
Query 293 GCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAAGATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTG 366
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||...|||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 296 GCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAGGATCCTTACTCCTGCCGACTGCTCAACATCACCAATCCAGTTTTG 369
Query 367 AATCAGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTCC-GAAGA---CACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCA 436
|||||.||||||||.||.||||| ||.||| ||||| |.|.|||||..|.||..||||.||.||||||||||
Sbjct 370 AATCAAGAAATTGAGGCATTCAG-CTTTCCTGAAGATGCCTCCTCATCTAGACTCTCTGAAGACCGAGTTGTCA 442
Query 437 GCGTGAGTTTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGT 510
|||||||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 443 GCGTGAGCTTCAGAGTTCTCTACCCAATCGTGATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAGTGATGTTGGT 516
Query 511 TTCCAGAGGAACATCACTGTCAAACTTTATCAGGCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCC 584
||.||.|||||||||||.|||||..|.||||||.||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 517 TTTCAAAGGAACATCACAGTCAAGTTGTATCAGACAGAGCAGGAGGAGGCCCTTTTCATCGCCCGATTCAGTCC 590
Query 585 TCCAAGCTGTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTGGTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTG 658
||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 591 TCCAAGTTGTGGCGTACAAGTGAACAAGCTCTGGTATAAGCCCGTGGAACAGTTCATCTTACCAGAGAGCTTTG 664
Query 659 AAGGTACAATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCCACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAAT 732
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||.|||||||||||||
Sbjct 665 AAGGTACAATCGTGTGGGAAAGCCAAGATCTCCATGGCCTCGTGTCCAGAAACCTGCACAGAGTGACAGTGAAT 738
Query 733 GATGGAGGGGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCTGGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGA 806
|||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||.||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 739 GATGGAGGGGGTGTTCTCAGAGTCCTTGCAGCTGGGGAAGGGGCACTGCCTCATGAATTCATGGAAGGTGTGGA 812
Query 807 GGGAGTTGCAGGTGGTTTTATATATACTATTCAGGAAGGTGATGCTCTCTTACACAA-CCTTCATTCTCGCCCT 879
|||||||||.|||||.|||||.||.|||.||||||||||||||||.||.||| |.|| ||||.|||||||.||.
Sbjct 813 GGGAGTTGCGGGTGGCTTTATCTACACTGTTCAGGAAGGTGATGCACTATTA-AGAAGCCTTTATTCTCGGCCC 885
Query 880 CAAAGACTTATTGATCATATA-AGGAATCTCCATGAGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATG 952
||.||||||...|||||.||| ||| ||||.||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||
Sbjct 886 CAGAGACTTGCAGATCACATACAGG-ATCTGCAGGTGGAAGATGCCTTACTGCAGGAGGAAAGCAGTGTCCATG 958
Query 953 ATGATATTGTTTTTGTGGATGTTGTCGACACTTATCGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGG 1026
|.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 959 ACGACATTGTCTTCGTGGATGTTGTGGATACTTACCGGAATGTTCCTGCAAAATTACTGAACTTCTATAGATGG 1032
Query 1027 ACTGTGGAAACAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAAGACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATT 1100
|||||||||.|.||.||||||.|||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||.||
Sbjct 1033 ACTGTGGAATCCACCAGCTTCGATTTGCTGCTCAAGACAGATGACGACTGTTATATAGACTTAGAAGCTGTGTT 1106
Query 1101 TAATAGGATTGTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTG 1174
||||||.||||..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|
Sbjct 1107 TAATAGAATTGCTCAGAAGAATCTAGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGGTTGAATTGGGCAGTGG 1180
Query 1175 ACCGAACCGGAAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCGAGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATAT 1248
||.||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1181 ACAGAACCGGAAAATGGCAGGAGCTGGAATACCCGAGCCCGGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGGTAT 1254
Query 1249 GTGATCTCCAAGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAGCAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGT 1322
||||||||||||||.|||||..|.|||||||||.|||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 GTGATCTCCAAGGATATCGTTGACTGGCTGGCAGGCAACTCCAGAAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGT 1328
Query 1323 AAGCATGGGCATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTAAAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCT 1396
.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1329 CAGCATGGGCATTTGGATGGCAGCCATAGGACCTAAAAGACACCAGGACAGCCTGTGGCTGTGTGAGAAAACCT 1402
Query 1397 GTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCTCCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGG 1470
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||....||.||||...||||.|||.||||||||||.|.|
Sbjct 1403 GTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTACTCACCAGAAGAGCTGAGCAAACTCTGGGAACTGAAGGAGCTG 1476
Query 1471 TGCGGTGATCCTTGTCGATGTCAAGCAAGA------ 1500
||.||.||||||||||..|||.||||||.|
Sbjct 1477 TGTGGGGATCCTTGTCAGTGTGAAGCAAAAGTACGA 1512