Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05019
- Subject:
- XM_006516818.3
- Aligned Length:
- 1516
- Identities:
- 1223
- Gaps:
- 116
Alignment
Query 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGG---CTGCGGCTGCG 71
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||| ||..||||.||
Sbjct 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCTTGCGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCACCTCTGGCTCCG 74
Query 72 CTCCCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTA 145
.|||||||||..|.||..|..|.|||||.||.||.|.||||||||.|..||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 75 TTCCCCGCCGGACCCCCACAACACCGGGCCCAGCGCGGCAGATCAATCAGCCTTATTTCCTCACTGGAAATTTA 148
Query 146 CTCACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTTGTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACC 219
..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|.||||
Sbjct 149 GCCACTATGATGTGGTAGTTGGTGTGTTATCAGCTCGAAATAACCACGAACTTCGAAATGTGATAAGGAACACC 222
Query 220 TGGATG-AGACATTTGCTACAGCATCCCACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATG 292
|||.|| ||| |||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 223 TGGCTGAAGA-ATTTGCTGCATCATCCTACATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCCCGTG 295
Query 293 GCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAAGATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTG 366
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||...|||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 296 GCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAGGATCCTTACTCCTGCCGACTGCTCAACATCACCAATCCAGTTTTG 369
Query 367 AATCAGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTCC-GAAGA---CACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCA 436
|||||.||||||||.||.||||| ||.||| ||||| |.|.|||||..|.||..||||.||.||||||||||
Sbjct 370 AATCAAGAAATTGAGGCATTCAG-CTTTCCTGAAGATGCCTCCTCATCTAGACTCTCTGAAGACCGAGTTGTCA 442
Query 437 GCGTGAGTTTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGT 510
|||||||.|||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||
Sbjct 443 GCGTGAGCTTCAGAGTTCTCTACCCAATCGTGATTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAGTGATGTTGGT 516
Query 511 TTCCAGAGGAACATCACTGTCAAACTTTATCAGGCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCC 584
||.||.|||||||||||.|||||..|.||||||.||||
Sbjct 517 TTTCAAAGGAACATCACAGTCAAGTTGTATCAGACAGA------------------------------------ 554
Query 585 TCCAAGCTGTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTGGTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTG 658
|||| ||||||||||
Sbjct 555 ---------------GCAG---------------------------------------------GAGAGCTTTG 568
Query 659 AAGGTACAATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCCACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAAT 732
|||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.||||.|||||||||||||
Sbjct 569 AAGGTACAATCGTGTGGGAAAGCCAAGATCTCCATGGCCTCGTGTCCAGAAACCTGCACAGAGTGACAGTGAAT 642
Query 733 GATGGAGGGGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCTGGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGA 806
|||||||||||.||||||||||||.||.||||||||||.||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 643 GATGGAGGGGGTGTTCTCAGAGTCCTTGCAGCTGGGGAAGGGGCACTGCCTCATGAATTCATGGAAGGTGTGGA 716
Query 807 GGGAGTTGCAGGTGGTTTTATATATACTATTCAGGAAGGTGATGCTCTCTTACACAA-CCTTCATTCTCGCCCT 879
|||||||||.|||||.|||||.||.|||.||||||||||||||||.||.||| |.|| ||||.|||||||.||.
Sbjct 717 GGGAGTTGCGGGTGGCTTTATCTACACTGTTCAGGAAGGTGATGCACTATTA-AGAAGCCTTTATTCTCGGCCC 789
Query 880 CAAAGACTTATTGATCATATA-AGGAATCTCCATGAGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATG 952
||.||||||...|||||.||| ||| ||||.||.|.||||||||||||||||.|||||||||||||..||.|||
Sbjct 790 CAGAGACTTGCAGATCACATACAGG-ATCTGCAGGTGGAAGATGCCTTACTGCAGGAGGAAAGCAGTGTCCATG 862
Query 953 ATGATATTGTTTTTGTGGATGTTGTCGACACTTATCGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGG 1026
|.||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 863 ACGACATTGTCTTCGTGGATGTTGTGGATACTTACCGGAATGTTCCTGCAAAATTACTGAACTTCTATAGATGG 936
Query 1027 ACTGTGGAAACAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAAGACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATT 1100
|||||||||.|.||.||||||.|||||.||||.|||||||||||.||||||||.||||||.|.||||||||.||
Sbjct 937 ACTGTGGAATCCACCAGCTTCGATTTGCTGCTCAAGACAGATGACGACTGTTATATAGACTTAGAAGCTGTGTT 1010
Query 1101 TAATAGGATTGTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTG 1174
||||||.||||..||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.|
Sbjct 1011 TAATAGAATTGCTCAGAAGAATCTAGATGGGCCTAATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGGTTGAATTGGGCAGTGG 1084
Query 1175 ACCGAACCGGAAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCGAGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATAT 1248
||.||||||||||.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1085 ACAGAACCGGAAAATGGCAGGAGCTGGAATACCCGAGCCCGGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGGTAT 1158
Query 1249 GTGATCTCCAAGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAGCAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGT 1322
||||||||||||||.|||||..|.|||||||||.|||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1159 GTGATCTCCAAGGATATCGTTGACTGGCTGGCAGGCAACTCCAGAAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGT 1232
Query 1323 AAGCATGGGCATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTAAAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCT 1396
.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1233 CAGCATGGGCATTTGGATGGCAGCCATAGGACCTAAAAGACACCAGGACAGCCTGTGGCTGTGTGAGAAAACCT 1306
Query 1397 GTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCTCCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGG 1470
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||....||.||||...||||.|||.||||||||||.|.|
Sbjct 1307 GTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTACTCACCAGAAGAGCTGAGCAAACTCTGGGAACTGAAGGAGCTG 1380
Query 1471 TGCGGTGATCCTTGTCGATGTCAAGCAAGA------ 1500
||.||.||||||||||..|||.||||||.|
Sbjct 1381 TGTGGGGATCCTTGTCAGTGTGAAGCAAAAGTACGA 1416