Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05019
- Subject:
- XM_017000394.1
- Aligned Length:
- 1623
- Identities:
- 1499
- Gaps:
- 123
Alignment
Query 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCGAAACTGGCTGGTGCTGCTGTGCCCGTGTGTGCTCGGGGCCGCGCTGCACCTCTGGCTGCGGCTGCGCTC 74
Query 75 CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTG--------------------------------------- 109
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCCGCCGCCCGCCTGCGCCTCCGGGGCCGGCCCTGCAGGTGGAGTCTCACTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCA 148
Query 110 -------------------------------------------------------------------------- 109
Sbjct 149 ATGGCGCGGTCTCGGCTCACCCCAACCTCCACCTCCCGGGTTCAAGAGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTA 222
Query 110 ----------CAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTCACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTT 173
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTGGGATAACAGATCAGTTGGCCTTATTTCCTCAGTGGAAATCTACTCACTATGATGTGGTAGTTGGCGTGTT 296
Query 174 GTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGGATGAGACATTTGCTACAGCATCCCA 247
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTCAGCTCGCAATAACCATGAACTTCGAAACGTGATAAGAAGCACCTGGATGAGACATTTGCTACAGCATCCCA 370
Query 248 CATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAA 321
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 CATTAAGTCAACGTGTGCTTGTGAAGTTCATAATAGGTGCTCATGGCTGTGAAGTGCCTGTGGAAGACAGGGAG 444
Query 322 GATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATCAGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTC 395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GATCCTTATTCCTGTAAACTACTCAACATCACAAATCCAGTTTTGAATCAGGAAATTGAAGCGTTCAGTCTGTC 518
Query 396 CGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGTTTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTA 469
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CGAAGACACTTCATCGGGGCTGCCTGAGGATCGAGTTGTCAGCGTGAGTTTCCGAGTTCTCTACCCCATCGTTA 592
Query 470 TTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAGGAACATCACTGTCAAACTTTATCAG 543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTACCAGTCTTGGAGTGTTCTACGATGCCAATGATGTGGGTTTCCAGAGGAACATCACTGTCAAACTTTATCAG 666
Query 544 GCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCTGTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTG 617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCAGAACAAGAGGAGGCCCTCTTCATTGCTCGCTTCAGTCCTCCAAGCTGTGGTGTGCAGGTGAACAAGCTGTG 740
Query 618 GTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACAATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCC 691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTACAAGCCCGTGGAACAATTCATCTTACCAGAGAGCTTTGAAGGTACAATCGTGTGGGAGAGCCAAGACCTCC 814
Query 692 ACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGGGGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCT 765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACGGCCTTGTGTCAAGAAATCTCCACAAAGTGACAGTGAATGATGGAGGGGGAGTTCTCAGAGTCATTACAGCT 888
Query 766 GGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTGCAGGTGGTTTTATATATACTATTCA 839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGGAGGGTGCATTGCCTCATGAATTCTTGGAAGGTGTGGAGGGAGTTGCAGGTGGTTTTATATATACTATTCA 962
Query 840 GGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTTATTGATCATATAAGGAATCTCCATG 913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAAGGTGATGCTCTCTTACACAACCTTCATTCTCGCCCTCAAAGACTTATTGATCATATAAGGAATCTCCATG 1036
Query 914 AGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGTTTTTGTGGATGTTGTCGACACTTAT 987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGGAAGATGCCTTACTGAAGGAGGAAAGCAGCATCTATGATGATATTGTTTTTGTGGATGTTGTCGACACTTAT 1110
Query 988 CGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAACAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAA 1061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CGTAATGTTCCTGCAAAATTATTGAACTTCTATAGATGGACTGTGGAAACAACGAGCTTCAATTTGTTGCTGAA 1184
Query 1062 GACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATTGTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTA 1135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GACAGATGATGACTGTTACATAGACCTCGAAGCTGTATTTAATAGGATTGTCCAAAAGAATCTGGATGGGCCTA 1258
Query 1136 ATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGGAAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCG 1209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATTTTTGGTGGGGAAATTTCAGACTGAATTGGGCAGTTGACCGAACCGGAAAGTGGCAGGAGTTGGAGTACCCG 1332
Query 1210 AGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCAAGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAG 1283
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCCCCGCTTACCCTGCCTTTGCATGTGGGTCAGGATATGTGATCTCCAAGGACATCGTCAAGTGGCTGGCAAG 1406
Query 1284 CAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGCATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTA 1357
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAACTCGGGGAGGTTAAAGACCTATCAGGGTGAAGATGTAAGCATGGGCATCTGGATGGCTGCCATAGGACCTA 1480
Query 1358 AAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCT 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAAGATACCAGGACAGTCTGTGGCTGTGTGAGAAGACCTGTGAGACAGGAATGCTGTCTTCTCCTCAGTATTCT 1554
Query 1432 CCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTGCGGTGATCCTTGTCGATGTCAAGCAAGA 1500
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCGTGGGAACTGACGGAACTGTGGAAACTGAAGGAACGGTGCGGTGATCCTTGTCGATGTCAAGCAAGA 1623