Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_05865
Subject:
NM_001290469.1
Aligned Length:
1013
Identities:
1009
Gaps:
0

Alignment

Query    1  MGDKKDDKDSPKKNKGKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPP  74
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Sbjct    1  MGDKKDDKSSPKKSKAKERRDLDDLKKEVAMTEHKMSVEEVCRKYNTDCVQGLTHSKAQEILARDGPNALTPPP  74

Query   75  TTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIM  148
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Sbjct   75  TTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAGTEDDPSGDNLYLGIVLAAVVIITGCFSYYQEAKSSKIM  148

Query  149  ESFKNMVPQQALVIREGEKMQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCT  222
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Sbjct  149  ESFKNMVPQQALVIREGEKMQVNAEEVVVGDLVEIKGGDRVPADLRIISAHGCKVDNSSLTGESEPQTRSPDCT  222

Query  223  HDNPLETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAVFLGVSF  296
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Sbjct  223  HDNPLETRNITFFSTNCVEGTARGVVVATGDRTVMGRIATLASGLEVGKTPIAIEIEHFIQLITGVAVFLGVSF  296

Query  297  FILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGT  370
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Sbjct  297  FILSLILGYTWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGT  370

Query  371  LTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASES  444
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Sbjct  371  LTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGTSFDKSSHTWVALSHIAGLCNRAVFKGGQDNIPVLKRDVAGDASES  444

Query  445  ALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCSTILLQGKEQ  518
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Sbjct  445  ALLKCIELSSGSVKLMRERNKKVAEIPFNSTNKYQLSIHETEDPNDNRYLLVMKGAPERILDRCATILLQGKEQ  518

Query  519  PLDEEMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAVPDA  592
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Sbjct  519  PLDEEMKEAFQNAYLELGGLGERVLGFCHYYLPEEQFPKGFAFDCDDVNFTTDNLCFVGLMSMIDPPRAAVPDA  592

Query  593  VGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAKACVIHGTDLKDFTSE  666
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Sbjct  593  VGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPVSQVNPRDAKACVIHGTDLKDFTSE  666

Query  667  QIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMIL  740
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Sbjct  667  QIDEILQNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDSPALKKADIGVAMGIAGSDVSKQAADMIL  740

Query  741  LDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAY  814
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Sbjct  741  LDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTSNIPEITPFLLFIMANIPLPLGTITILCIDLGTDMVPAISLAY  814

Query  815  EAAESDIMKRQPRNPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDL  888
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Sbjct  815  EAAESDIMKRQPRNPRTDKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFSYFVILAENGFLPGNLVGIRLNWDDRTVNDL  888

Query  889  EDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCP  962
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Sbjct  889  EDSYGQQWTYEQRKVVEFTCHTAFFVSIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLFEETALAAFLSYCP  962

Query  963  GMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKETYY  1013
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Sbjct  963  GMDVALRMYPLKPSWWFCAFPYSFLIFVYDEIRKLILRRNPGGWVEKETYY  1013