Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_05976
Subject:
NM_001220488.2
Aligned Length:
762
Identities:
698
Gaps:
51

Alignment

Query   1  -------------------------------------------------MQPRTPLVLCVLLSQVLLLTSAEDL  25
                                                            |..|.|......  |||||||||||
Sbjct   1  MKTPPGASSRTKCSRELRSFCAFSCPRAKQPTCTAWFPQQEHPSENGPQMPGRDPPAASTM--QVLLLTSAEDL  72

Query  26  DCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHAR  99
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  73  DCTPGFQQKVFHINQPAEFIEDQSILNLTFSDCKGNDKLRYEVSSPYFKVNSDGGLVALRNITAVGKTLFVHAR  146

Query 100  TPHAEDMAELVIVGGKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKF  173
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 147  TPHAEDMAELVIVGGKDIQGSLQDIFKFARTSPVPRQKRSIVVSPILIPENQRQPFPRDVGKVVDSDRPERSKF  220

Query 174  RLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSMTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFRE  247
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 221  RLTGKGVDQEPKGIFRINENTGSVSVTRTLDREVIAVYQLFVETTDVNGKTLEGPVPLEVIVIDQNDNRPIFRE  294

Query 248  GPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRRQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRET  321
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  GPYIGHVMEGSPTGTTVMRMTAFDADDPATDNALLRYNIRQQTPDKPSPNMFYIDPEKGDIVTVVSPALLDRET  368

Query 322  LENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPATGA  395
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 369  LENPKYELIIEAQDMAGLDVGLTGTATATIMIDDKNDHSPKFTKKEFQATVEEGAVGVIVNLTVEDKDDPTTGA  442

Query 396  WRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVL  469
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 443  WRAAYTIINGNPGQSFEIHTNPQTNEGMLSVVKPLDYEISAFHTLLIKVENEDPLVPDVSYGPSSTATVHITVL  516

Query 470  DVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRES  543
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517  DVNEGPVFYPDPMMVTRQEDLSVGSVLLTVNATDPDSLQHQTIRYSVYKDPAGWLNINPINGTVDTTAVLDRES  590

Query 544  TFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDP  617
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 591  PFVDNSVYTALFLAIDSGNPPATGTGTLLITLEDVNDNAPFIYPTVAEVCDDAKNLSVVILGASDKDLHPNTDP  664

Query 618  FKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNA  691
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 665  FKFEIHKQAVPDKVWKISKINNTHALVSLLQNLNKANYNLPIMVTDSGKPPMTNITDLRVQVCSCRNSKVDCNA  738

Query 692  AGALRFSLPSVLLLSLFSLACL  713
           ||||||||||||||||||||||
Sbjct 739  AGALRFSLPSVLLLSLFSLACL  760