Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05976
• Subject: XM_011522804.3
• Aligned Length: 2145
• Identities: 1816
• Gaps: 315

Alignment

Query    1  ATGCAGCCGAGAACTCCGCTCGTTCTGTGCGTTCTCCTGTCCCAGGTGCTGCTGCTAACATCTGCAGAAGATTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGACTGCACTCCTGGATTTCAGCAGAAAGTGTTCCATATCAATCAGCCAGCTGAATTCATTGAGGACCAGTCAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTCTAAACTTGACCTTCAGTGACTGTAAGGGAAACGACAAGCTACGCTATGAGGTCTCGAGCCCATACTTCAAG  222
                                                  |.|||||.|       ||||        ||||    
Sbjct    1  --------------------------------------ATGCTACCC-------TCTC--------ACTT----  17

Query  223  GTGAACAGCGATGGCGGCTTAGTTGCTCTGAGAAACATAACTGCAG---TGGGCAAAACTCTGTTCGTCCATGC  293
            ||     |.||||.||                         |.|||   |.|||.||    |||          
Sbjct   18  GT-----GTGATGACG-------------------------TTCAGGGTTTGGCGAA----TGT----------  47

Query  294  ACGGACCCCCCATGCGGAAG---ATATGGCAGAACTCGTGATTGTCGGGGGGAAAGACATCCAGGGCTCCTTGC  364
                        ||.|.|||   |||                                                
Sbjct   48  ------------TGAGCAAGCCAATA------------------------------------------------  61

Query  365  AGGATATATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTATCTCCCATTTTA  438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   62  AGGATATATTTAAATTTGCAAGAACTTCTCCTGTCCCAAGACAAAAGAGGTCCATTGTGGTATCTCCCATTTTA  135

Query  439  ATTCCAGAGAATCAGAGACAGCCTTTCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGGCCAGAAAGGTC  512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  136  ATTCCAGAGAATCAGAGACAGCCTTTCCCAAGAGATGTTGGCAAGGTAGTCGATAGTGACAGGCCAGAAAGGTC  209

Query  513  CAAGTTCCGGCTCACTGGAAAGGGAGTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGGA  586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  210  CAAGTTCCGGCTCACTGGAAAGGGAGTGGATCAAGAGCCTAAAGGAATTTTCAGAATCAATGAGAACACAGGGA  283

Query  587  GCGTCTCCATGACACGGACCTTGGACAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGAGACCACTGATGTC  660
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  284  GCGTCTCCGTGACACGGACCTTGGACAGAGAAGTAATCGCTGTTTATCAACTATTTGTGGAGACCACTGATGTC  357

Query  661  AATGGCAAAACTCTCGAGGGGCCGGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACAACCGACCGATCTT  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  358  AATGGCAAAACTCTCGAGGGGCCGGTGCCTCTGGAAGTCATTGTGATTGATCAGAATGACAACCGACCGATCTT  431

Query  735  TCGGGAAGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATGCGGATGACAGCCT  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  432  TCGGGAAGGCCCCTACATCGGCCACGTCATGGAAGGGTCACCCACAGGCACCACAGTGATGCGGATGACAGCCT  505

Query  809  TTGATGCAGATGACCCAGCCACCGATAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCGGCAGACGCCTGACAAGCCA  882
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  506  TTGATGCAGATGACCCAGCCACCGATAATGCCCTCCTGCGGTATAATATCCGTCAGCAGACGCCTGACAAGCCA  579

Query  883  TCTCCCAACATGTTCTACATCGATCCTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCG  956
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  580  TCTCCCAACATGTTCTACATCGATCCTGAGAAAGGAGACATTGTCACTGTTGTGTCACCTGCGCTGCTGGACCG  653

Query  957  AGAGACTCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTGGATGTTGGATTAA  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  654  AGAGACTCTGGAAAATCCCAAGTATGAACTGATCATCGAGGCTCAAGATATGGCTGGACTGGATGTTGGATTAA  727

Query 1031  CAGGCACGGCCACAGCCACGATCATGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTT  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  CAGGCACGGCCACAGCCACGATCATGATCGATGACAAAAATGATCACTCACCAAAATTCACCAAGAAAGAGTTT  801

Query 1105  CAAGCCACAGTCGAGGAAGGAGCTGTGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGGATGACCCCGCCAC  1178
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  802  CAAGCCACAGTCGAGGAAGGAGCTGTGGGAGTTATTGTCAATTTGACAGTTGAAGATAAGGATGACCCCACCAC  875

Query 1179  AGGTGCATGGAGGGCTGCCTACACCATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATCCACACCAACCCTC  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  AGGTGCATGGAGGGCTGCCTACACCATCATCAACGGAAACCCCGGGCAGAGCTTTGAAATCCACACCAACCCTC  949

Query 1253  AAACCAACGAAGGGATGCTTTCTGTTGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCACACCCTGCTGATC  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  AAACCAACGAAGGGATGCTTTCTGTTGTCAAACCATTGGACTATGAAATTTCTGCCTTCCACACCCTGCTGATC  1023

Query 1327  AAAGTGGAAAATGAAGACCCACTCGTACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCACCGTCCACATCAC  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1024  AAAGTGGAAAATGAAGACCCACTCGTACCCGACGTCTCCTACGGCCCCAGCTCCACAGCCACCGTCCACATCAC  1097

Query 1401  TGTCCTGGATGTCAACGAGGGCCCAGTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAGGAGGACCTCTCTG  1474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1098  TGTCCTGGATGTCAACGAGGGCCCAGTCTTCTACCCAGACCCCATGATGGTGACCAGGCAGGAGGACCTCTCTG  1171

Query 1475  TGGGCAGCGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCATCAGGTATTCTGTT  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1172  TGGGCAGCGTGCTGCTGACAGTGAATGCCACGGACCCCGACTCCCTGCAGCATCAAACCATCAGGTATTCTGTT  1245

Query 1549  TACAAGGACCCAGCAGGTTGGCTGAATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAGCTGTGCTGGACCG  1622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1246  TACAAGGACCCAGCAGGTTGGCTGAATATTAACCCCATCAATGGGACTGTTGACACCACAGCTGTGCTGGACCG  1319

Query 1623  TGAGTCCACATTTGTCGACAACAGCGTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGCAACCCTCCCGCTA  1696
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1320  TGAGTCCCCATTTGTCGACAACAGCGTGTACACTGCTCTCTTCCTGGCAATTGACAGTGGCAACCCTCCCGCTA  1393

Query 1697  CGGGCACTGGGACTTTGCTGATAACCCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTACCCCACAGTAGCT  1770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1394  CGGGCACTGGGACTTTGCTGATAACCCTGGAGGACGTGAATGACAATGCCCCGTTCATTTACCCCACAGTAGCT  1467

Query 1771  GAAGTCTGTGATGATGCCAAAAACCTCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATCTTCACCCGAATAC  1844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1468  GAAGTCTGTGATGATGCCAAAAACCTCAGTGTAGTCATTTTGGGAGCATCAGATAAGGATCTTCACCCGAATAC  1541

Query 1845  AGATCCTTTCAAATTTGAAATCCACAAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAATA  1918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1542  AGATCCTTTCAAATTTGAAATCCACAAACAAGCTGTTCCTGATAAAGTCTGGAAGATCTCCAAGATCAACAATA  1615

Query 1919  CACACGCCCTGGTAAGCCTTCTTCAAAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCA  1992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1616  CACACGCCCTGGTAAGCCTTCTTCAAAATCTGAACAAAGCAAACTACAACCTGCCCATCATGGTGACAGATTCA  1689

Query 1993  GGGAAACCACCCATGACGAATATCACAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATTCCAAAGTGGACTG  2066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1690  GGGAAACCACCCATGACGAATATCACAGATCTCAGGGTACAAGTGTGCTCCTGCAGGAATTCCAAAGTGGACTG  1763

Query 2067  CAACGCGGCGGGGGCCCTGCGCTTCAGCCTGCCCTCAGTCCTGCTCCTCAGCCTCTTCAGCTTAGCTTGTCTG  2139
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1764  CAACGCGGCAGGGGCCCTGCGCTTCAGCCTGCCCTCAGTCCTGCTCCTCAGCCTCTTCAGCTTAGCTTGTCTG  1836