Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06106
Subject:
NM_001301737.1
Aligned Length:
851
Identities:
833
Gaps:
0

Alignment

Query   1  MGNRGMEDLIPLVNRLQDAFSAIGQNADLDLPQIAVVGGQSAGKSSVLENFVGRDFLPRGSGIVTRRPLVLQLV  74
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Sbjct   1  MGNRGMEDLIPLVNRLQDAFSAIGQNADLDLPQIAVVGGQSAGKSSVLENFVGRDFLPRGSGIVTRRPLVLQLV  74

Query  75  NATTEYAEFLHCKGKKFTDFEEVRLEIEAETDRVTGTNKGISPVPINLRVYSPHVLNLTLVDLPGMTKVPVGDQ  148
           |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  NSTTEYAEFLHCKGKKFTDFEEVRLEIEAETDRVTGTNKGISPVPINLRVYSPHVLNLTLVDLPGMTKVPVGDQ  148

Query 149  PPDIEFQIRDMLMQFVTKENCLILAVSPANSDLANSDALKVAKEVDPQGQRTIGVITKLDLMDEGTDARDVLEN  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  PPDIEFQIRDMLMQFVTKENCLILAVSPANSDLANSDALKIAKEVDPQGQRTIGVITKLDLMDEGTDARDVLEN  222

Query 223  KLLPLRRGYIGVVNRSQKDIDGKKDITAALAAERKFFLSHPSYRHLADRMGTPYLQKVLNQQLTNHIRDTLPGL  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  KLLPLRRGYIGVVNRSQKDIDGKKDITAALAAERKFFLSHPSYRHLADRMGTPYLQKVLNQQLTNHIRDTLPGL  296

Query 297  RNKLQSQLLSIEKEVEEYKNFRPDDPARKTKALLQMVQQFAVDFEKRIEGSGDQIDTYELSGGARINRIFHERF  370
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Sbjct 297  RNKLQSQLLSIEKEVDEYKNFRPDDPARKTKALLQMVQQFAVDFEKRIEGSGDQIDTYELSGGARINRIFHERF  370

Query 371  PFELVKMEFDEKELRREISYAIKNIHGIRTGLFTPDMAFETIVKKQVKKIREPCLKCVDMVISELISTVRQCTK  444
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Sbjct 371  PFELVKMEFDEKELRREISYAIKNIHGIRTGLFTPDLAFEATVKKQVQKLKEPSIKCVDMVVSELTSTIRKCSE  444

Query 445  KLQQYPRLREEMERIVTTHIREREGRTKEQVMLLIDIELAYMNTNHEDFIGFANAQQRSNQMNKKKTSGNQDEI  518
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Sbjct 445  KLQQYPRLREEMERIVTTHIREREGRTKEQVMLLIDIELAYMNTNHEDFIGFANAQQRSNQMNKKKTSGNQDEI  518

Query 519  LVIRKGWLTINNIGIMKGGSKEYWFVLTAENLSWYKDYEEKEKKYMLSVDNLKLRDVEKGFMSSKHIFALFNTE  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  LVIRKGWLTINNIGIMKGGSKEYWFVLTAENLSWYKDDEEKEKKYMLSVDNLKLRDVEKGFMSSKHIFALFNTE  592

Query 593  QRNVYKDYRQLELACETQEEVDSWKASFLRAGVYPERVGDKEKASETEENGSDSFMHSMDPQLERQVETIRNLV  666
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Sbjct 593  QRNVYKDYRQLELACETQEEVDSWKASFLRAGVYPERVGDKEKASETEENGSDSFMHSMDPQLERQVETIRNLV  666

Query 667  DSYMAIVNKTVRDLMPKTIMHLMINNTKEFIFSELLANLYSCGDQNTLMEESAEQAQRRDEMLRMYHALKEALS  740
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Sbjct 667  DSYMAIVNKTVRDLMPKTIMHLMINNTKEFIFSELLANLYSCGDQNTLMEESAEQAQRRDEMLRMYHALKEALS  740

Query 741  IIGDINTTTVSTPMPPPVDDSWLQVQSVPAGRRSPTSSPTPQRRAPAVPPARPGSRGPAPGPPPAGSALGGAPP  814
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Sbjct 741  IIGDINTTTVSTPMPPPVDDSWLQVQSVPAGRRSPTSSPTPQRRAPAVPPARPGSRGPAPGPPPAGSALGGAPP  814

Query 815  VPSRPGASPDPFGPPPQVPSRPNRAPPGVPRITISDP  851
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Sbjct 815  VPSRPGASPDPFGPPPQVPSRPNRAPPGVPRITISDP  851