Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06223
• Subject: NM_011356.4
• Aligned Length: 977
• Identities: 871
• Gaps: 10

Alignment

Query   1  ATGGTCTGCGGCAGCCCGGGAGGGATGCTGCT--GCTGCGGGCCGGGCTGCTTGCCCTGGCTGCTCTCTGCCTG  72
           |||||||||.||.||||||||.||||||||||  |.|  ||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGTCTGCTGCGGCCCGGGACGGATGCTGCTAGGAT--GGGCCGGGTTGCTAGTCCTGGCTGCTCTCTGCCTG  72

Query  73  CTCCGGGTGCCCGGGGCTCGGGCTGCAGCCTGTGAGCCCGTCCGCATCCCCCTGTGCAAGTCCCTGCCCTGGAA  146
           ||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  73  CTCCAGGTGCCCGGAGCTCAGGCTGCAGCCTGTGAGCCTGTCCGCATCCCGCTGTGCAAGTCCCTTCCCTGGAA  146

Query 147  CATGACTAAGATGCCCAACCACCTGCACCACAGCACTCAGGCCAACGCCATCCTGGCCATCGAGCAGTTCGAAG  220
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 147  CATGACCAAGATGCCCAACCACCTGCACCACAGCACCCAGGCTAACGCCATCCTGGCCATGGAACAGTTCGAAG  220

Query 221  GTCTGCTGGGCACCCACTGCAGCCCCGATCTGCTCTTCTTCCTCTGTGCCATGTACGCGCCCATCTGCACCATT  294
           |.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 221  GGCTGCTGGGCACCCACTGCAGCCCGGATCTTCTCTTCTTCCTCTGTGCAATGTACGCACCCATTTGCACCATC  294

Query 295  GACTTCCAGCACGAGCCCATCAAGCCCTGTAAGTCTGTGTGCGAGCGGGCCCGGCAGGGCTGTGAGCCCATACT  368
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 295  GACTTCCAGCACGAGCCCATCAAGCCCTGCAAGTCTGTGTGTGAGCGCGCCCGACAGGGCTGCGAGCCCATTCT  368

Query 369  CATCAAGTACCGCCACTCGTGGCCGGAGAACCTGGCCTGCGAGGAGCTGCCAGTGTACGACAGGGGCGTGTGCA  442
           |||||||||||||||||||||||||||.|.|.||||||||||.||||||||.|||||||||.|.||||||||||
Sbjct 369  CATCAAGTACCGCCACTCGTGGCCGGAAAGCTTGGCCTGCGACGAGCTGCCGGTGTACGACCGCGGCGTGTGCA  442

Query 443  TCTCTCCCGAGGCCATCGTTACTGCGGACGGAGCTGATTTTCCTATGGATTCTAGTAACGGAAACTGTAGAGGG  516
           |||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||..|||.||||.||||||
Sbjct 443  TCTCTCCTGAGGCCATCGTCACCGCGGACGGAGCGGATTTTCCTATGGATTCAAGTACTGGACACTGCAGAGGG  516

Query 517  GCAAGCAGTGAACGCTGTAAATGTAAGCCTATTAGAGCTACACAGAAGACCTATTTCCGGAACAATTACAACTA  590
           ||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 517  GCAAGCAGCGAACGTTGCAAATGTAAGCCTGTCAGAGCTACACAGAAGACCTATTTCCGGAACAATTACAACTA  590

Query 591  TGTCATTCGGGCTAAAGTTAAAGAGATAAAGACTAAGTGCCATGATGTGACTGCAGTAGTGGAGGTGAAGGAGA  664
           ||||||.||||||||||||||||||.||||||..||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 591  TGTCATCCGGGCTAAAGTTAAAGAGGTAAAGATGAAATGTCATGATGTGACCGCCGTTGTGGAAGTGAAGGAAA  664

Query 665  TTCTAAAGTCCTCTCTGGTAAACATTCCACGGGACACTGTCAACCTCTATACCAGCTCTGGCTGCCTCTGCCCT  738
           ||||||||.|.||.|||||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 665  TTCTAAAGGCATCACTGGTAAACATTCCAAGGGACACCGTCAATCTTTATACCACCTCTGGCTGCCTCTGTCCT  738

Query 739  CCACTTAATGTTAATGAGGAATATATCATCATGGGCTATGAAGATGAGGAACGTTCCAGATTACTCTTGGTGGA  812
           |||||||.|||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 739  CCACTTACTGTCAATGAGGAATATGTCATCATGGGCTATGAAGACGAGGAACGTTCCAGGTTACTCTTGGTAGA  812

Query 813  AGGCTCTATAGCTGAGAAGTGGAAGGATCGACTCGGTAAAAAAGTTAAGCGCTGGGATATGAAGCTTCGTCATC  886
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|
Sbjct 813  AGGCTCTATAGCTGAGAAGTGGAAGGATCGGCTTGGTAAGAAAGTCAAGCGCTGGGATATGAAACTCCGACACC  886

Query 887  TTGGACTCAGTAAAAGTGATTCTAGCAATAGTGATTCCACTCAGAGTCAGAAGTCTGGCAGGAACTCGAACCCC  960
           |||||||..||||||.||||.|||||      |||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 887  TTGGACTGGGTAAAACTGATGCTAGC------GATTCCACTCAGAATCAGAAGTCTGGCAGGAACTCTAATCCC  954

Query 961  CGGCAAGCACGCAAA  975
           ||||.||||||||..
Sbjct 955  CGGCCAGCACGCAGC  969