Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06606
• Subject: NM_001037127.2
• Aligned Length: 894
• Identities: 734
• Gaps: 112

Alignment

Query   1  MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74
           |||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MRELVNIPLLQMLTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74

Query  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCIANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148

Query 149  KPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEEESEPEQDTKVFA  222
           ||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||||
Sbjct 149  KPSVSWIKGDNALRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKLVKLEVEEDREPEQDAKVFA  222

Query 223  RILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  296
           |||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  RILRAPESHNVTFGSFVTLRCTAIGIPVPTISWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  296

Query 297  KHGEKFSTAKAAATISIA---------------EW---------------------------------------  316
           ||||||||||||||.|||               ||                                       
Sbjct 297  KHGEKFSTAKAAATVSIAVPPPWFSMDTSFLWTEWSKSQKDSQGYCAQYRGEVCDAVLAKDALVFFNTSYRDPE  370

Query 317  -------------------------------------------------REYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHR  341
                                                            ||||||||||||||||..||.|.||
Sbjct 371  DAQELLIHTAWNELKAVSPLCRPAAEALLCNHLFQECSPGVVPTPMPICREYCLAVKELFCAKEWQAMEGKAHR  444

Query 342  GLYRSEMHLLSVPECSKLPSMHWDPTACARLPHL--------AFPPMTSSKPSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYS  407
           |||||.||||.|||||||||||.|||||.|||.|        .||..|||.||.|||||| .|.|||.|||.||
Sbjct 445  GLYRSGMHLLPVPECSKLPSMHRDPTACTRLPYLDYKKENITTFPSITSSRPSADIPNLP-ASTSSFAVSPAYS  517

Query 408  MTVIISIMSSFAIFVLLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLS  481
           |||||||.||||.|.||||.|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518  MTVIISIVSSFALFALLTIATLYCCRRRKEWKNKKRESTAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLS  591

Query 482  LEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKL  555
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  LEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKL  665

Query 556  LGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAY  629
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666  LGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSTRARVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAY  739

Query 630  LSERKFVHRDLATRNCLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYG  703
           ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  LSERKFVHRDLATRNCLVGETMVVKIADFGLSRNIYSADYYKADGNDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYG  813

Query 704  VVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERA  777
           ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct 814  VVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVIYYVRDGNILACPENCPLELYNLMRLCWSKLPADRPSFCSIHRILQRMCERA  887

Query 778  EGTVSV  783
           ||||.|
Sbjct 888  EGTVGV  893