Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06606
• Subject: NM_001037129.1
• Aligned Length: 871
• Identities: 735
• Gaps: 89

Alignment

Query   1  MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74
           |||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MRELVNIPLLQMLTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74

Query  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCIANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148

Query 149  KPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEEESEPEQDTKVFA  222
           ||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.||||
Sbjct 149  KPSVSWIKGDNALRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKLVKLEVEEDREPEQDAKVFA  222

Query 223  RILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  296
           |||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  RILRAPESHNVTFGSFVTLRCTAIGIPVPTISWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  296

Query 297  KHGEKFSTAKAAATISIAEW------------------------------------------------------  316
           ||||||||||||||.|||||                                                      
Sbjct 297  KHGEKFSTAKAAATVSIAEWSKSQKDSQGYCAQYRGEVCDAVLAKDALVFFNTSYRDPEDAQELLIHTAWNELK  370

Query 317  ----------------------------------REYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPEC  356
                                             ||||||||||||||||..||.|.|||||||.||||.||||
Sbjct 371  AVSPLCRPAAEALLCNHLFQECSPGVVPTPMPICREYCLAVKELFCAKEWQAMEGKAHRGLYRSGMHLLPVPEC  444

Query 357  SKLPSMHWDPTACARLPHLAFPPMTSSKPSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFVLLTITTLY  430
           |||||||.|||||.|||.||||..|||.||.|||||| .|.|||.|||.|||||||||.||||.|.||||.|||
Sbjct 445  SKLPSMHRDPTACTRLPYLAFPSITSSRPSADIPNLP-ASTSSFAVSPAYSMTVIISIVSSFALFALLTIATLY  517

Query 431  CCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVF  504
           ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518  CCRRRKEWKNKKRESTAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIGEGAFGRVF  591

Query 505  QARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLN  578
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  QARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFEYMAYGDLN  665

Query 579  EFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGENMV  652
           ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 666  EFLRSMSPHTVCSLSHSDLSTRARVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRNCLVGETMV  739

Query 653  VKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVI  726
           ||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740  VKIADFGLSRNIYSADYYKADGNDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYYGMAHEEVI  813

Query 727  YYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  783
           |||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|
Sbjct 814  YYVRDGNILACPENCPLELYNLMRLCWSKLPADRPSFCSIHRILQRMCERAEGTVGV  870