Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06606
• Subject: NM_010944.2
• Aligned Length: 879
• Identities: 727
• Gaps: 107

Alignment

Query   1  MRELVNIPLVHILTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74
           |||||||||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MRELVNIPLLQMLTLVAFSGTEKLPKAPVITTPLETVDALVEEVATFMCAVESYPQPEISWTRNKILIKLFDTR  74

Query  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCTANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  YSIRENGQLLTILSVEDSDDGIYCCIANNGVGGAVESCGALQVKMKPKITRPPINVKIIEGLKAVLPCTTMGNP  148

Query 149  KPSVSWIKGDSPLRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKVVKLEVEEESEPEQDTKVFA  222
           ||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||          |||
Sbjct 149  KPSVSWIKGDNALRENSRIAVLESGSLRIHNVQKEDAGQYRCVAKNSLGTAYSKLVKLEVE----------VFA  212

Query 223  RILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  296
           |||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 213  RILRAPESHNVTFGSFVTLRCTAIGIPVPTISWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATN  286

Query 297  KHGEKFSTAKAAATISIAEW------------------------------------------------------  316
           ||||||||||||||.|||||                                                      
Sbjct 287  KHGEKFSTAKAAATVSIAEWSKSQKDSQGYCAQYRGEVCDAVLAKDALVFFNTSYRDPEDAQELLIHTAWNELK  360

Query 317  ----------------------------------REYCLAVKELFCAKEWLVMEEKTHRGLYRSEMHLLSVPEC  356
                                             ||||||||||||||||..||.|.|||||||.||||.||||
Sbjct 361  AVSPLCRPAAEALLCNHLFQECSPGVVPTPMPICREYCLAVKELFCAKEWQAMEGKAHRGLYRSGMHLLPVPEC  434

Query 357  SKLPSMHWDPTACARLPHL--------AFPPMTSSKPSVDIPNLPSSSSSSFSVSPTYSMTVIISIMSSFAIFV  422
           |||||||.|||||.|||.|        .||..|||.||.|||||| .|.|||.|||.|||||||||.||||.|.
Sbjct 435  SKLPSMHRDPTACTRLPYLDYKKENITTFPSITSSRPSADIPNLP-ASTSSFAVSPAYSMTVIISIVSSFALFA  507

Query 423  LLTITTLYCCRRRKQWKNKKRESAAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIG  496
           ||||.|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 508  LLTIATLYCCRRRKEWKNKKRESTAVTLTTLPSELLLDRLHPNPMYQRMPLLLNPKLLSLEYPRNNIEYVRDIG  581

Query 497  EGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFE  570
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 582  EGAFGRVFQARAPGLLPYEPFTMVAVKMLKEEASADMQADFQREAALMAEFDNPNIVKLLGVCAVGKPMCLLFE  655

Query 571  YMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSMRAQVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRN  644
           ||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 656  YMAYGDLNEFLRSMSPHTVCSLSHSDLSTRARVSSPGPPPLSCAEQLCIARQVAAGMAYLSERKFVHRDLATRN  729

Query 645  CLVGENMVVKIADFGLSRNIYSADYYKANENDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYY  718
           |||||.||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 730  CLVGETMVVKIADFGLSRNIYSADYYKADGNDAIPIRWMPPESIFYNRYTTESDVWAYGVVLWEIFSYGLQPYY  803

Query 719  GMAHEEVIYYVRDGNILSCPENCPVELYNLMRLCWSKLPADRPSFTSIHRILERMCERAEGTVSV  783
           |||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|
Sbjct 804  GMAHEEVIYYVRDGNILACPENCPLELYNLMRLCWSKLPADRPSFCSIHRILQRMCERAEGTVGV  868