Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06867
• Subject: XM_005245413.3
• Aligned Length: 1008
• Identities: 861
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGACTCAGGCTGTGCAGACAAACGGAACTCAACCATTAAGCAAAACATGGGAACTCAGTTTATATGAGTTACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACGAACACCTCAGGAGGCAATAACAGATGGCTTAGAAATTGTGGTTTCACCTCGAAGTCTACACAGTGAATTAA  148
                                                                                     |
Sbjct    1  -------------------------------------------------------------------------A  1

Query  149  TGTGCCCAATTTGTTTGGATATGTTGAAGAACACCATGACTACAAAGGAGTGTTTACATCGTTTTTGTGCAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    2  TGTGCCCAATTTGTTTGGATATGTTGAAGAACACCATGACTACAAAGGAGTGTTTACATCGTTTTTGTGCAGAC  75

Query  223  TGCATCATCACAGCCCTTAGAAGTGGCAACAAAGAATGTCCTACCTGTCGGAAAAAACTAGTTTCCAAAAGATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   76  TGCATCATCACAGCCCTTAGAAGTGGCAACAAAGAATGTCCTACCTGTCGGAAAAAACTAGTTTCCAAAAGATC  149

Query  297  ACTAAGGCCAGACCCAAACTTTGATGCACTCATCAGCAAAATTTATCCAAGTCGTGATGAGTATGAAGCTCATC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  150  ACTAAGGCCAGACCCAAACTTTGATGCACTCATCAGCAAAATTTATCCAAGTCGTGATGAGTATGAAGCTCATC  223

Query  371  AAGAGAGAGTATTAGCCAGGATCAACAAGCACAATAATCAGCAAGCACTCAGTCACAGCATTGAGGAAGGACTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  224  AAGAGAGAGTATTAGCCAGGATCAACAAGCACAATAATCAGCAAGCACTCAGTCACAGCATTGAGGAAGGACTG  297

Query  445  AAGATACAGGCCATGAACAGACTGCAGCGAGGCAAGAAACAACAGATTGAAAATGGTAGTGGAGCAGAAGATAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  298  AAGATACAGGCCATGAACAGACTGCAGCGAGGCAAGAAACAACAGATTGAAAATGGTAGTGGAGCAGAAGATAA  371

Query  519  TGGTGACAGTTCACACTGCAGTAATGCATCCACACATAGCAATCAGGAAGCAGGCCCTAGTAACAAACGGACCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  372  TGGTGACAGTTCACACTGCAGTAATGCATCCACACATAGCAATCAGGAAGCAGGCCCTAGTAACAAACGGACCA  445

Query  593  AAACATCTGATGATTCTGGGCTAGAGCTTGATAATAACAATGCAGCAATGGCAATTGATCCAGTAATGGATGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  446  AAACATCTGATGATTCTGGGCTAGAGCTTGATAATAACAATGCAGCAATGGCAATTGATCCAGTAATGGATGGT  519

Query  667  GCTAGTGAAATTGAATTAGTATTCAGGCCTCATCCCACACTTATGGAAAAAGATGACAGTGCACAGACGAGATA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  520  GCTAGTGAAATTGAATTAGTATTCAGGCCTCATCCCACACTTATGGAAAAAGATGACAGTGCACAGACGAGATA  593

Query  741  CATAAAGACTTCTGGTAACGCCACTGTTGATCACTTATCCAAGTATCTGGCTGTGAGGTTAGCTTTAGAAGAAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  594  CATAAAGACTTCTGGTAACGCCACTGTTGATCACTTATCCAAGTATCTGGCTGTGAGGTTAGCTTTAGAAGAAC  667

Query  815  TTCGAAGCAAAGGTGAATCAAACCAGATGAACCTTGATACAGCCAGTGAGAAGCAGTATACCATTTATATAGCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  668  TTCGAAGCAAAGGTGAATCAAACCAGATGAACCTTGATACAGCCAGTGAGAAGCAGTATACCATTTATATAGCA  741

Query  889  ACAGCCAGTGGCCAGTTCACTGTATTAAATGGCTCTTTTTCTTTGGAATTGGTCAGTGAGAAATACTGGAAAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  742  ACAGCCAGTGGCCAGTTCACTGTATTAAATGGCTCTTTTTCTTTGGAATTGGTCAGTGAGAAATACTGGAAAGT  815

Query  963  GAACAAACCCATGGAACTTTATTACGCACCTACAAAGGAGCACAAA  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  816  GAACAAACCCATGGAACTTTATTACGCACCTACAAAGGAGCACAAA  861