Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07338
• Subject: XR_001737526.2
• Aligned Length: 1924
• Identities: 1349
• Gaps: 574

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATACGCCTGCTGCAGCAGGAGGAGTTACGAGCCGGGCCGCGCGCTGCCTAAATACCTAAACCAGGTTTAGCGCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGCTCATATAAAGCTCTCCTAACTCGTCTTCCGGTGGGAATTTCTTCACGTGGGCCGGAGTCGGAGACTGAGTT  148

Query    1  ----------------------------------ATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAG  40
                                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGCTTTACTGAGGAGCTCTAAATTTAGGCGGGTATGAGTGATTTCAGTGAAGAATTAAAAGGGCCTGTGACAG  222

Query   41  ATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGGTGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAA  114
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGATGAAGAAGTGGAAACATCTGTGCTCAGTGGTGCAGGAATGCATTTTCCTTGGCTTCAAACATACGTAGAA  296

Query  115  ACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATTTTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGA  188
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTGTGGCCATTGGAGGGAAAAGGAGGAAGGATTTTGCTCAGACAACAAGTGCTTGTTTAAGTTTTATCCAAGA  370

Query  189  AGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCAGAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAG  262
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGCTCTGCTGAAGCACCAATGGCAGCAAGCTGCAGAATACATGTACAGTTATTTTCAGACCTTGGAAGATTCAG  444

Query  263  ATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTATTTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAA  336
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATAGCTACAAAAGGCAGGCTGCACCTGAGATTATTTGGAAGCTCGGAAGTGAAATTCTATTTTATCATCCCAAA  518

Query  337  AGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACCGGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTC  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGCAACATGGAGAGTTTCAATACTTTTGCTAACCGGATGAAAAATATTGGCGTCATGAATTATTTAAAGATCTC  592

Query  411  CTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGAATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGA  484
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTACAACATGCATTATACCTTCTGCATCATGGAATGCTTAAAGATGCTAAGAGAAATCTGAGTGAGGCAGAGA  666

Query  485  CATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGAAATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTA  558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CATGGAGACATGGTGAAAATACGTCTTCCCGGGAAATATTAATCAACCTTATTCAGGCCTATAAAGGGCTTTTA  740

Query  559  CAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAATTGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGT  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGTATTATACCTGGTCTGAAAAGAAGATGGAATTGTCAAAGCTTGATAAGGATGATTATGCTTACAATGCAGT  814

Query  633  AGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACATCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTT  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCCAGGATGTGTTCAACCACAGCTGGAAGACATCTGCAAATATTTCTGCATTGATTAAAATTCCTGGAGTTT  888

Query  707  GGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCTGGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTC  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGACCCTTTTGTGAAGAGTTATGTAGAAATGCTGGAATTCTATGGGGATCGAGATGGAGCCCAAGAGGTACTC  962

Query  781  ACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAAATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAG  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCAATTATGCATATGATGAAAAGTTTCCATCAAATCCAAATGCCCATATCTACTTATACAACTTTCTAAAGAG  1036

Query  855  ACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTGCTTAA-----------------------------------  893
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct 1037  ACAGAAGGCACCAAGATCAAAATTGATAAGTGTGCTTAAGATGGGATCATCCAGTTGCAGGAAAACAAGGGCTC  1110

Query  894  -----------------GATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACT  950
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCACTGATTCTACTTATGATTTTGTATCAGATTGTACCATCTCATAAATTGATGTTGGAATTCCATACATTACT  1184

Query  951  TAGAAAATCAGAAAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGAT  1024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGAAAATCAGAAAAAGAAGAACACCGTAAACTGGGGTTGGAGGTATTATTTGGAGTCTTAGATTTTGCCGGAT  1258

Query 1025  GCACTAAGAATATAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCG  1098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCACTAAGAATATAACTGCTTGGAAATACTTGGCAAAATATCTGAAAAATATCTTAATGGGAAACCACCTTGCG  1332

Query 1099  TGGGTTCAAGAAGAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGGTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAG  1172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TGGGTTCAAGAAGAGTGGAACTCCAGGAAAAACTGGTGGCCAGGCTTTCATTTCAGCTACTTTTGGGCAAAAAG  1406

Query 1173  TGATTGGAAGGAAGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTA  1246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGATTGGAAGGAAGATACAGCTTTGGCCTGTGAGAAAGCTTTTGTGGCTGGTTTACTGTTAGGAAAAGGTTGTA  1480

Query 1247  GATATTTCCGGTATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTG  1320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GATATTTCCGGTATATTTTAAAGCAAGATCACCAAATCTTAGGGAAGAAAATTAAGCGGATGAAGAGATCTGTG  1554

Query 1321  AAAAAATACAGTATTGTAAATCCAAGACTC--------------------------------------------  1350
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1555  AAAAAATACAGTATTGTAAATCCAAGACTCTGATACTGAATTTTAGTTATTTCACAGTTGTAGCTACACAGTAA  1628

Query 1351  --------------------------------------------------------------------------  1350
                                                                                      
Sbjct 1629  GTAGCTTGGTAGATAGTTATTGAATGTATTTATGTAGTGTATTAAGAAGCTTATATTACTACAAAAAACTTATT  1702

Query 1351  --------------------------------------------------------------------------  1350
                                                                                      
Sbjct 1703  TTTATATATTTTTATATTTTTGTATTATTTATAGCTAGAGAAACAATATTACTGCCTTTGCTCTTTGTAACTAT  1776

Query 1351  --------------------------------------------------------------------------  1350
                                                                                      
Sbjct 1777  GTCTGTTTTCTTTTTTGTAATGTTAAATGTTACATTTGTTAAGGAATAATTCTTCAAATGACAAACTAATTACA  1850

Query 1351  --------------------------------------------------------------------------  1350
                                                                                      
Sbjct 1851  GAATATAGCTCTACAGCAGTTATTGTTTGCAAATACTTTGCCTCTTGCTATTGTGTAATAAACTGTAACTTGTA  1924