Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07353
- Subject:
- NM_001164169.1
- Aligned Length:
- 1716
- Identities:
- 1597
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGGATTTCGAAGATTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAACTACAAGTATTACTAGGCTT 74
||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.|||||
Sbjct 1 ATGGCGGATTTCGAGGAGTTGAGGAATATGGTTTCTAGTTTTAGGGTTTCTGAGTTACAAGTGTTACTGGGCTT 74
Query 75 TGCTGGACGGAATAAAAGTGGACGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGCTGCATTTATTGAAGAGCGGCTGCA 148
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 TGCTGGACGGAATAAAAGTGGGCGCAAGCATGACCTCCTGATGAGGGCGTTGCATTTATTGAAGAGTGGCTGCA 148
Query 149 GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATCCGAGAATTGTATAGACGCCGATATCCACGAACTCTTGAAGGACTTTCTGAT 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.||||
Sbjct 149 GCCCTGCGGTTCAGATTAAAATTCGAGAATTATATAGACGCCGATACCCACGGACACTTGAAGGACTTTGTGAT 222
Query 223 TTATCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGTTTGGATGGTGGCTCATCACCTGTAGAACCTGACTTGGCCGTGGC 296
.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||
Sbjct 223 CTTTCCACAATCAAATCATCGGTTTTCAGCTTGGATGGTAGCTCATCACCCGTAGAACCTGACTTGCCTGTGGC 296
Query 297 TGGAATCCACTCGTTGCCTTCCACTTCAGTTACACCTCACTCACCATCCTCTCCTGTTGGTTCTGTGCTGCTTC 370
|||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 297 TGGGATCCACTCGTTGCCTTCGACTTCAATTACACCTCATTCACCGTCATCTCCTGTTGGTTCTGTACTGCTGC 370
Query 371 AAGATACTAAGCCCACATTTGAGATGCAGCAGCCATCTCCCCCAATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA 444
||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGACACTAAGCCCACCTTTGAGATGCAGCAGCCGTCTCCGCCCATTCCTCCTGTCCATCCTGATGTGCAGTTA 444
Query 445 AAAAATCTGCCCTTTTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG 518
|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAAAACCTGCCTTTCTATGATGTCCTTGATGTTCTCATCAAGCCCACGAGTTTAGTTCAAAGCAGTATTCAGCG 518
Query 519 ATTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAACAAGTTAGAGAGATATGCATATCCAGGGATTTTT 592
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.||||
Sbjct 519 GTTTCAAGAGAAGTTTTTTATTTTTGCTTTGACACCTCAGCAAGTTAGAGAAATATGTATTTCAAGGGACTTTT 592
Query 593 TGCCAGGTGGTAGGAGAGATTATACAGTCCAAGTTCAGTTGAGACTTTGCCTGGCAGAGACAAGTTGCCCTCAA 666
||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||.||||||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593 TGCCGGGTGGCAGGAGAGACTACACAGTCCAAGTCCAGCTGCGACTTTGCTTGGCAGAGACCAGTTGCCCTCAA 666
Query 667 GAAGATAACTATCCAAATAGTCTATGTATAAAAGTAAATGGGAAGCTATTTCCTTTGCCTGGCTATGCACCACC 740
||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667 GAAGATAACTATCCCAATAGTTTGTGTATAAAAGTCAATGGGAAACTCTTTCCTTTGCCTGGCTATGCGCCACC 740
Query 741 GCCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCTTGAATATTACATCTTTAGTTAGGTTATCTTCAG 814
.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 741 ACCTAAAAATGGGATTGAACAGAAGCGCCCTGGACGCCCCCTGAACATTACGTCTTTAGTTAGGTTGTCTTCAG 814
Query 815 CTGTGCCAAACCAAATTTCCATTTCTTGGGCATCAGAAATTGGGAAGAATTACTCTATGTCTGTATATCTTGTA 888
||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 815 CTGTGCCAAATCAGATTTCTATTTCTTGGGCATCTGAAATTGGAAAGAATTACTCCATGTCTGTGTATCTTGTA 888
Query 889 CGGCAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAACCCTGATCATTCCAGAGC 962
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 CGACAGCTTACATCAGCCATGTTATTACAGAGATTAAAAATGAAAGGTATTAGAAATCCTGATCATTCCAGAGC 962
Query 963 ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGATCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGCCTTCGGGTATCCTTGATGT 1036
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 963 ACTAATTAAAGAAAAACTTACTGCAGACCCTGATAGTGAAATTGCTACAACTAGTCTTCGAGTGTCCTTGATGT 1036
Query 1037 GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCATGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGTTTTGATGCT 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 GCCCTTTAGGAAAAATGAGGCTGACAATCCCGTGCCGTGCAGTGACTTGTACACATCTGCAGTGCTTTGATGCT 1110
Query 1111 GCCCTCTATCTACAAATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATTTGTCCTGTGTGTGACAAAAAAGCTGCCTATGA 1184
|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111 GCCCTCTATCTTCAGATGAATGAGAAAAAGCCCACCTGGATCTGTCCTGTTTGTGACAAAAAGGCTGCCTATGA 1184
Query 1185 AAGTCTAATATTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTAGATGAGATCAAATTCCAAG 1258
.|||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 GAGTCTGATACTAGATGGGCTTTTTATGGAAATTCTCAATGACTGTTCTGATGTGGATGAGATCAAATTCCAGG 1258
Query 1259 AAGATGGTTCTTGGTGTCCAATGAGACCGAAGAAAGAAGCTATGAAAGTATCCAGCCAACCGTGTACAAAAATA 1332
|||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||.||
Sbjct 1259 AAGATGGTTCTTGGTGTCCCATGAGACCTAAAAAAGAAGCTATGAAAGTAACCAGCCAGCCCTGTACAAAAGTA 1332
Query 1333 GAAAGTTCAAGCGTCCTCAGTAAGCCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGAGGCAAGCAAGAAGAAAGTAGATGT 1406
|||||||||||.|||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1333 GAAAGTTCAAGTGTCTTTAGTAAACCTTGTTCAGTGACTGTAGCCAGTGATGCAAGCAAGAAGAAGATAGATGT 1406
Query 1407 TATTGATCTTACAATAGAAAGCTCTTCTGACGAAGAGGAAGACCCTCCTGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT 1480
|||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TATTGATCTAACAATAGAGAGCTCTTCTGATGAAGAGGAAGACCCTCCCGCCAAAAGGAAATGCATCTTTATGT 1480
Query 1481 CAGAAACACAAAGCAGCCCAACCAAAGGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACT 1554
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CAGAAACACAAAGCAGTCCAACCAAAGGGGTTCTCATGTATCAGCCATCTTCTGTAAGGGTGCCCAGTGTGACT 1554
Query 1555 TCGGTTGATCCTGCTGCTATTCCGCCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCATACGCCAATATCAAG 1628
||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1555 TCAGTTGATCCTGCTGCTATTCCACCTTCATTAACAGACTACTCAGTACCATTCCACCACACGCCAGTGTCAAG 1628
Query 1629 CATGTCATCAGATTTGCCAGGAGAACAAAGAAGAAATGATATTAATAATGAACTGAAGCTTGGAACATCTTCTG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1629 CATGTCATCAGATTTGCCAGGAGAACAAAGAAGAAATGATATTAATAACGAAGTGCAGCTTGGAGCATCTTCTG 1702
Query 1703 ATACTGTGCAACAG 1716
||||||||||||||
Sbjct 1703 ATACTGTGCAACAG 1716