Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07395
• Subject: NM_001258354.1
• Aligned Length: 2916
• Identities: 2885
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGGATACCGACTTATATGATGAGTTTGGGAATTATATTGGACCAGAGCTTGATTCTGATGAAGATGATGATGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATACCGACTTATATGATGAGTTTGGGAATTATATTGGACCAGAGCTTGATTCTGATGAAGATGATGATGA  74

Query   75  ATTGGGTAGAGAGACCAAAGATCTTGATGAGATGGATGATGATGACGACGACGATGACGTAGGAGATCATGACG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTGGGTAGAGAGACCAAAGATCTTGATGAGATGGATGATGATGACGACGACGATGACGTAGGAGATCATGACG  148

Query  149  ATGACCACCCTGGGATGGAGGTGGTGCTGCATGAGGACAAGAAGTACTACCCAACAGCCGAGGAGGTGTATGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGACCACCCTGGGATGGAGGTGGTGCTGCATGAGGACAAGAAGTACTACCCAACAGCCGAGGAGGTGTATGGT  222

Query  223  CCTGAGGTGGAGACCATAGTTCAAGAGGAAGACACTCAGCCTCTCACAGAACCCATTATTAAGCCAGTGAAAAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTGAGGTGGAGACCATAGTTCAAGAGGAAGACACTCAGCCTCTCACAGAACCCATTATTAAGCCAGTGAAAAC  296

Query  297  CAAGAAATTCACTCTGATGGAGCAGACATTACCTGTTACGGTGTATGAGATGGATTTCTTGGCGGATCTGATGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CAAGAAATTCACTCTGATGGAGCAGACATTACCTGTTACGGTGTATGAGATGGATTTCTTGGCGGATCTGATGG  370

Query  371  ATAACTCAGAGCTCATCAGAAATGTGACCCTTTGTGGACATCTCCACCATGGCAAGACATGTTTTGTGGATTGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct  371  ATAACTCAGAGCTCATCAGAAATGTGACCCTTTGTGGACATCTCCACCATGGCA--------------------  424

Query  445  TTAATTGAACAGACTCACCCGGAAATCAGAAAGCGCTATGACCAAGATCTGTGCTATACTGACATCCTCTTCAC  518
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  425  ----------AGACTCACCCGGAAATCAGAAAGCGCTATGACCAAGATCTGTGCTATACTGACATCCTCTTCAC  488

Query  519  AGAGCAAGAGAGAGGTGTAGGCATCAAAAGCACTCCTGTGACAGTGGTCTTGCCAGACACCAAAGGAAAATCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  AGAGCAAGAGAGAGGTGTAGGCATCAAAAGCACTCCTGTGACAGTGGTCTTGCCAGACACCAAAGGAAAATCTT  562

Query  593  ATCTCTTCAATATCATGGACACTCCAGGACATGTGAATTTCTCTGATGAGGTCACAGCTGGCTTGCGCATCTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  ATCTCTTCAATATCATGGACACTCCAGGACATGTGAATTTCTCTGATGAGGTCACAGCTGGCTTGCGCATCTCA  636

Query  667  GATGGAGTGGTCCTTTTCATTGATGCTGCTGAGGGGGTGATGCTGAACACAGAGCGGCTGATCAAGCATGCGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  GATGGAGTGGTCCTTTTCATTGATGCTGCTGAGGGGGTGATGCTGAACACAGAGCGGCTGATCAAGCATGCGGT  710

Query  741  GCAGGAGAGGCTGGCAGTCACTGTGTGCATCAACAAGATTGACCGGCTGATCCTGGAGCTGAAGCTGCCTCCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  GCAGGAGAGGCTGGCAGTCACTGTGTGCATCAACAAGATTGACCGGCTGATCCTGGAGCTGAAGCTGCCTCCAA  784

Query  815  CTGATGCTTATTACAAGCTGCGCCACATTGTGGATGAGGTCAATGGATTAATAAGCATGTATTCCACTGATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  CTGATGCTTATTACAAGCTGCGCCACATTGTGGATGAGGTCAATGGATTAATAAGCATGTATTCCACTGATGAG  858

Query  889  AACCTGATCCTTTCCCCACTCCTGGGTAACGTCTGCTTCTCCAGCTCCCAGTACAGCATCTGCTTCACGCTGGT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  859  AACCTGATCCTTTCCCCACTCCTGGGTAACGTCTGCTTCTCCAGCTCCCAGTACAGCATCTGCTTCACGCTGGG  932

Query  963  CTCCTTTGCCAAGATCTATGCCGACACCTTTGGTGACATTAATTACCAAGAATTTGCTAAAAGACTCTGGGGTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  CTCCTTTGCCAAGATCTATGCCGACACCTTTGGTGACATTAATTACCAAGAATTTGCTAAAAGACTCTGGGGTG  1006

Query 1037  ACATCTACTTCAACCCTAAGACGCGAAAGTTCACCAAAAAGGCCCCAACTAGCAGCTCCCAGAGAAGTTTCGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  ACATCTACTTCAACCCTAAGACGCGAAAGTTCACCAAAAAGGCCCCAACTAGCAGCTCCCAGAGAAGTTTCGTG  1080

Query 1111  GAGTTTATCTTGGAGCCTCTTTATAAGATCCTCGCCCAGGTTGTAGGTGACGTGGACACCAGCCTCCCACGGAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  GAGTTTATCTTGGAGCCTCTTTATAAGATCCTCGCCCAGGTTGTAGGTGACGTGGACACCAGCCTCCCACGGAC  1154

Query 1185  CCTAGACGAGCTTGGCATCCACCTGACGAAGGAGGAGCTGAAGCTGAACATCCGCCCCTTGCTCAGGCTGGTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  CCTAGACGAGCTTGGCATCCACCTGACGAAGGAGGAGCTGAAGCTGAACATCCGCCCCTTGCTCAGGCTGGTCT  1228

Query 1259  GCAAAAAGTTCTTTGGCGAGTTCACAGGCTTTGTGGACATGTGTGTGCAGCATATCCCTTCTCCAAAGGTGGGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  GCAAAAAGTTCTTTGGCGAGTTCACAGGCTTTGTGGACATGTGTGTGCAGCATATCCCTTCTCCAAAGGTGGGC  1302

Query 1333  GCCAAGCCCAAGATTGAGCACACCTACACCGGTGGTGTGGACTCCGACCTCGGCGAGGCTATGAGTGACTGTGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  GCCAAGCCCAAGATTGAGCACACCTACACCGGTGGTGTGGACTCCGACCTCGGCGAGGCTATGAGTGACTGTGA  1376

Query 1407  CCCTGATGGCCCCCTGATGTGCCACACTACTAAGATGTACAGCACAGATGATGGAGTCCAGTTTCACGCCTTTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  CCCTGATGGCCCCCTGATGTGCCACACTACTAAGATGTACAGCACAGATGATGGAGTCCAGTTTCACGCCTTTG  1450

Query 1481  GCCGGGTGCTGAGTGGCACCATTCATGCTGGGCAGCCTGTGAAGGTACTGGGGGAGAACTACACCCTGGAGGAT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  GCCGGGTGCTGAGTGGCACCATTCATGCTGGGCAGCCTGTGAAGGTACTGGGGGAGAACTACACCCTGGAGGAT  1524

Query 1555  GAGGAAGACTCCCAGATATGCACCGTGGGCCGCCTTTGGATCTCTGTGGCCAGGTACCACATCGAGGTGAACCG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  GAGGAAGACTCCCAGATATGCACCGTGGGCCGCCTTTGGATCTCTGTGGCCAGGTACCACATCGAGGTGAACCG  1598

Query 1629  TGTTCCTGCTGGCAACTGGGTTCTGATTGAAGGTGTTGATCAACCAATTGTGAAGACAGCAACCATAACCGAAC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599  TGTTCCTGCTGGCAACTGGGTTCTGATTGAAGGTGTTGATCAACCAATTGTGAAGACAGCAACCATAACCGAAC  1672

Query 1703  CCCGAGGCAATGAGGAGGCTCAGATTTTCCGACCCTTGAAGTTCAATACCACATCTGTTATCAAGATTGCTGTG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673  CCCGAGGCAATGAGGAGGCTCAGATTTTCCGACCCTTGAAGTTCAATACCACATCTGTTATCAAGATTGCTGTG  1746

Query 1777  GAGCCAGTCAACCCCTCAGAGCTGCCCAAGATGCTTGATGGCCTGCGCAAGGTCAACAAGAGCTATCCATCCCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747  GAGCCAGTCAACCCCTCAGAGCTGCCCAAGATGCTTGATGGCCTGCGCAAGGTCAACAAGAGCTATCCATCCCT  1820

Query 1851  CACCACCAAGGTGGAGGAGTCTGGCGAGCATGTGATCCTGGGCACTGGGGAGCTCTACCTGGACTGTGTGATGC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821  CACCACCAAGGTGGAGGAGTCTGGCGAGCATGTGATCCTGGGCACTGGGGAGCTCTACCTGGACTGTGTGATGC  1894

Query 1925  ATGATTTGCGGAAGATGTACTCAGAGATAGACATCAAGGTGGCTGACCCAGTTGTCACGTTTTGTGAGACGGTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1895  ATGATTTGCGGAAGATGTACTCAGAGATAGACATCAAGGTGGCTGACCCAGTTGTCACGTTTTGTGAGACGGTG  1968

Query 1999  GTGGAAACATCCTCCCTCAAGTGCTTTGCTGAAACGCCTAATAAGAAGAACAAGATCACCATGATTGCTGAGCC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1969  GTGGAAACATCCTCCCTCAAGTGCTTTGCTGAAACGCCTAATAAGAAGAACAAGATCACCATGATTGCTGAGCC  2042

Query 2073  TCTTGAGAAGGGCCTGGCAGAGGACATAGAGAATGAGGTGGTCCAGATTACGTGGAACAGGAAGAAGCTGGGAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2043  TCTTGAGAAGGGCCTGGCAGAGGACATAGAGAATGAGGTGGTCCAGATTACGTGGAACAGGAAGAAGCTGGGAG  2116

Query 2147  AGTTCTTCCAGACCAAGTACGATTGGGATCTGCTGGCTGCCCGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGATGCGACT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2117  AGTTCTTCCAGACCAAGTACGATTGGGATCTGCTGGCTGCCCGTTCCATCTGGGCTTTTGGCCCTGATGCGACT  2190

Query 2221  GGCCCCAACATTCTGGTGGATGATACTCTGCCCTCTGAGGTGGACAAGGCTCTTCTTGGTTCAGTGAAGGACAG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2191  GGCCCCAACATTCTGGTGGATGATACTCTGCCCTCTGAGGTGGACAAGGCTCTTCTTGGTTCAGTGAAGGACAG  2264

Query 2295  CATCGTTCAAGGTTTCCAGTGGGGAACCAGGGAGGGCCCCCTCTGTGATGAATTGATTCGGAATGTCAAGTTTA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2265  CATCGTTCAAGGTTTCCAGTGGGGAACCAGGGAGGGCCCCCTCTGTGATGAATTGATTCGGAATGTCAAGTTTA  2338

Query 2369  AGATCCTGGATGCGGTGGTTGCCCAGGAGCCCCTGCACCGGGGCGGGGGCCAGATCATCCCCACAGCCAGGAGA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2339  AGATCCTGGATGCGGTGGTTGCCCAGGAGCCCCTGCACCGGGGCGGGGGCCAGATCATCCCCACAGCCAGGAGA  2412

Query 2443  GTCGTCTACTCTGCCTTCCTCATGGCTACTCCTCGTCTGATGGAGCCTTACTACTTTGTAGAGGTCCAGGCCCC  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2413  GTCGTCTACTCTGCCTTCCTCATGGCTACTCCTCGTCTGATGGAGCCTTACTACTTTGTAGAGGTCCAGGCCCC  2486

Query 2517  TGCAGATTGCGTCTCTGCAGTTTATACCGTCCTGGCCAGGCGCAGGGGGCACGTGACTCAGGATGCACCCATCC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2487  TGCAGATTGCGTCTCTGCAGTTTATACCGTCCTGGCCAGGCGCAGGGGGCACGTGACTCAGGATGCACCCATCC  2560

Query 2591  CAGGCTCCCCTCTGTACACCATCAAAGCTTTTATCCCGGCCATCGACTCTTTTGGCTTTGAGACTGATCTCCGG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2561  CAGGCTCCCCTCTGTACACCATCAAAGCTTTTATCCCGGCCATCGACTCTTTTGGCTTTGAGACTGATCTCCGG  2634

Query 2665  ACTCACACCCAGGGACAAGCCTTTTCTCTGTCTGTCTTCCACCACTGGCAGATTGTGCCTGGTGATCCCCTGGA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2635  ACTCACACCCAGGGACAAGCCTTTTCTCTGTCTGTCTTCCACCACTGGCAGATTGTGCCTGGTGATCCCCTGGA  2708

Query 2739  CAAGAGCATTGTCATCCGCCCCTTGGAGCCACAGCCAGCTCCTCACCTGGCCCGGGAATTCATGATCAAAACCC  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2709  CAAGAGCATTGTCATCCGCCCCTTGGAGCCACAGCCAGCTCCTCACCTGGCCCGGGAATTCATGATCAAAACCC  2782

Query 2813  GCCGTAGGAAGGGCCTCAGTGAAGATGTGAGCATCAGCAAATTCTTCGATGATCCTATGTTGCTGGAACTTGCC  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2783  GCCGTAGGAAGGGCCTCAGTGAAGATGTGAGCATCAGCAAATTCTTCGATGATCCTATGTTGCTGGAACTTGCC  2856

Query 2887  AAACAGGATGTTGTGCTCAATTACCCCATG  2916
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2857  AAACAGGATGTTGTGCTCAATTACCCCATG  2886