Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07648
Subject:
NM_001190854.1
Aligned Length:
596
Identities:
435
Gaps:
114

Alignment

Query   1  MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQGMTHLEAQNKIKGCT  74
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct   1  MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKASQAHVRIGDVVLSIDGISAQGMTHLEAQNKIKACT  74

Query  75  GSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTSTNNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSS  148
           |||||||||||||.|.|||.|||                                                   
Sbjct  75  GSLNMTLQRASAAAKSEPVSVQK---------------------------------------------------  97

Query 149  AFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLHANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAE  222
                                                                     |||||||||..|||||
Sbjct  98  ----------------------------------------------------------PTVTSVCSESAQELAE  113

Query 223  GQRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLK  296
           |||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 114  GQRRGSQGDIKQQNGPPRKHIVERNTEFYHIPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLT  187

Query 297  ESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGV  370
           |||.|||||||..||||.|.|||.||..|..|...||.|.||.|..|..||||||||||.| ||||||||||..
Sbjct 188  ESENDNTKKANSTQEPSQQPASSGASPLSASEGPESPGSSRPSVAGLRSAAAFKPVGSTSV-KSPSWQRPNQAA  260

Query 371  PSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEF  444
           ||||||||.|..||.    ....|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 261  PSTGRISNNARSSGT----GASVGPPQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEF  330

Query 445  NCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFH  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 331  NCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFH  404

Query 519  LEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAH  592
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 405  LEDGEPYCETDYYALFGTICRGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAH  478

Query 593  SVNF  596
           ||||
Sbjct 479  SVNF  482