Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07648
- Subject:
- NM_001256427.2
- Aligned Length:
- 1806
- Identities:
- 1428
- Gaps:
- 375
Alignment
Query 1 ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA 74
Query 75 CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG 148
Query 149 TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA 222
Query 223 GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGGGAGA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAA------- 289
Query 297 ACCTAAAGAAGTAGTTAAACCTGTGCCCATTACATCTCCTGCTGTGTCCAAAGTCACTTCCACAAACAACATGG 370
Sbjct 290 -------------------------------------------------------------------------- 289
Query 371 CCTACAATAAGGCACCACGGCCTTTTGGTTCTGTGTCTTCACCAAAAGTCACATCCATCCCATCACCATCGTCT 444
Sbjct 290 -------------------------------------------------------------------------- 289
Query 445 GCCTTCACCCCAGCCCATGCGACCACCTCATCACATGCTTCCCCTTCACCCGTGGCTGCCGTCACTCCTCCCCT 518
Sbjct 290 -------------------------------------------------------------------------- 289
Query 519 GTTCGCTGCATCTGGACTGCATGCTAATGCCAATCTTAGTGCTGACCAGTCTCCATCTGCACTGAGCGCTGGTA 592
Sbjct 290 -------------------------------------------------------------------------- 289
Query 593 AAACTGCAGTTAATGTCCCACGGCAGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 ------------------------AGCCCACAGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAG 339
Query 667 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATG------------------GCCCACCAAGAAA 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct 340 GGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTAAACAGCAAAATGGGAAAATCCCACCTAAACGCCCACCAAGAAA 413
Query 723 ACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTG 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 ACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTG 487
Query 797 AGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACT 870
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 AGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACT 561
Query 871 GGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAATAACTCTCAGGAGCCTTCTCCGCA 944
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 GGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAATAACTCTCAGGAGCCTTCTCCGCA 635
Query 945 GTTGGCTTCCTCGGTAGCTTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGGCAGACCAGGGG 1018
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 GTTGGCTTCCTCGGTAGCTTCCACACGGAGCATGCCCGAGAGCCTGGACAGCCCAACCTCTGGCAGACCAGGGG 709
Query 1019 TTACCAGCCTCACAACTGCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAA 1092
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 TTACCAGCCTCACAGCTGCAGCTGCCTTCAAGCCTGTAGGATCCACTGGCGTCATCAAGTCACCAAGCTGGCAA 783
Query 1093 CGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTGCTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGC 1166
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 CGGCCAAACCAAGGAGTACCTTCCACTGGAAGAATCTCAAACAGCGCTACTTACTCAGGATCAGTGGCACCAGC 857
Query 1167 CAACTCAGCTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAG 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 CAACTCAGCTTTGGGACAAACCCAGCCAAGTGACCAGGACACTTTAGTGCAAAGAGCTGAGCACATTCCAGCAG 931
Query 1241 GGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACCATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCT 1314
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 GGAAACGAACTCCGATGTGCGCCCATTGTAACCAGGTCATCAGAGGACCATTCTTAGTGGCACTGGGGAAATCT 1005
Query 1315 TGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGG 1388
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 TGGCACCCAGAAGAATTCAACTGCGCTCACTGCAAAAATACAATGGCCTACATTGGATTTGTAGAGGAGAAAGG 1079
Query 1389 AGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTG 1462
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AGCCCTGTATTGTGAGCTGTGCTATGAGAAATTCTTTGCCCCTGAATGTGGTCGATGCCAAAGGAAGATCCTTG 1153
Query 1463 GAGAAGTCATCAATGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATT 1536
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 GAGAAGTCATCAGTGCGTTGAAACAAACTTGGCATGTTTCCTGTTTTGTGTGTGTAGCCTGTGGAAAGCCCATT 1227
Query 1537 CGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTAT 1610
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228 CGGAACAATGTTTTTCACTTGGAGGATGGTGAACCCTACTGTGAGACTGATTATTATGCCCTCTTTGGTACTAT 1301
Query 1611 ATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACA 1684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 ATGCCATGGATGTGAATTTCCCATAGAAGCTGGTGACATGTTCCTGGAAGCTCTGGGCTACACCTGGCATGACA 1375
Query 1685 CTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTG 1758
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 CTTGCTTTGTATGCTCAGTGTGTTGTGAAAGTTTGGAAGGTCAGACCTTTTTCTCCAAGAAGGACAAGCCCCTG 1449
Query 1759 TGTAAGAAACATGCTCATTCTGTGAATTTT 1788
Sbjct 1450 ------------------------------ 1449