Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07648
Subject:
NM_019808.3
Aligned Length:
596
Identities:
527
Gaps:
5

Alignment

Query   1  MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQGMTHLEAQNKIKGCT  74
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Sbjct   1  MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKASQAHVRIGDVVLSIDGISAQGMTHLEAQNKIKACT  74

Query  75  GSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTSTNNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSS  148
           |||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GSLNMTLQRASAAAKSEPVSVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTSTTNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSS  148

Query 149  AFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLHANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAE  222
           |||||||.|||||||.||||.||....|||||..|||||||..|....||.||||||||||||||||..|||||
Sbjct 149  AFTPAHAATSSHASPTPVAAATPLHLSASGLHVSANLSADQCSSPPNTGKPAVNVPRQPTVTSVCSESAQELAE  222

Query 223  GQRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLK  296
           |||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223  GQRRGSQGDIKQQNGPPRKHIVERNTEFYHIPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLT  296

Query 297  ESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGV  370
           |||.|||||||..||||.|.|||.||..|..|...||.|.||.|..|..||||||||||.| ||||||||||..
Sbjct 297  ESENDNTKKANSTQEPSQQPASSGASPLSASEGPESPGSSRPSVAGLRSAAAFKPVGSTSV-KSPSWQRPNQAA  369

Query 371  PSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEF  444
           ||||||||.|..||.    ....|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370  PSTGRISNNARSSGT----GASVGPPQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEF  439

Query 445  NCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFH  518
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Sbjct 440  NCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFH  513

Query 519  LEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAH  592
           ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514  LEDGEPYCETDYYALFGTICRGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAH  587

Query 593  SVNF  596
           ||||
Sbjct 588  SVNF  591