Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07649
• Subject: NM_001011515.2
• Aligned Length: 702
• Identities: 631
• Gaps: 60

Alignment

Query   1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74

Query  75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148

Query 149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222

Query 223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGAAAAC  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||
Sbjct 223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGCCCAC  296

Query 297  A--CA------------------------------------AGTGACAAATAA------CCCTGG---------  317
           |  ||                                    ||.||||.|.||      |||.||         
Sbjct 297  AGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGACTTCTCAGGAGCTAGCAGAGGGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACAGTA  370

Query 318  -------CACTGTGAAAATCCCACCTAAACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTAT  384
                  .|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AACAGCAAAATGGGAAAATCCCACCTAAACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTAT  444

Query 385  CATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGG  458
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  CATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGG  518

Query 459  AACAACTCAATCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCG  532
           |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AACAACTCAGTCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCG  592

Query 533  ATAATACAAAGAAGGCAAAGGAAAAGATACCCCTTCACGTCTTTAGTCCCAAATACACAAAATTACGTGACTGG  606
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ATAATACAAAGAAGGCAAAGGAAAAGATACCCCTTCACGTCTTTAGTCCCAAATACACAAAATTACGTGACTGG  666

Query 607  CACCATGAAGTTTCAGCACGTGCTCTTAACGTACAG  642
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  CACCATGAAGTTTCAGCACGTGCTCTTAACGTACAG  702