Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07649
• Subject: NM_022554.3
• Aligned Length: 717
• Identities: 575
• Gaps: 75

Alignment

Query   1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
           |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct   1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query  75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
           ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct  75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query 149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
           ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct 149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query 223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGAAAAC  296
           |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||...||
Sbjct 223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGCCCAC  296

Query 297  A--CA------------------------------------AGTGACAAA------------------------  308
           |  ||                                    ||.||||.|                        
Sbjct 297  AGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAGGGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTA  370

Query 309  -------------TAACCCTGGCACTGTGAAAATCCCACCTAAACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGC  369
                        |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGCAGCAAAATGGTAACCCTGGCACTGTGAAAATTCCACCTAAACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGC  444

Query 370  TATACAGAGTTTTATCATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTG  443
           .|.||.|||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 445  AACACGGAGTTTTATCACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTG  518

Query 444  GCGTCCAAGGACTGGAACAACTCAATCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGA  517
           |||.||..||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||
Sbjct 519  GCGCCCCCGGACTGGAACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGA  592

Query 518  AAGAATCTGAAGCCGATAATACAAAGAAGGCAAAGGAAAAGATACCCCTTCACGTCTTTAGTCCCAAATACACA  591
           .||||||||||...||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CAGAATCTGAAAATGACAATACGAAGAAGGCAAAGGAAAAGATACCCCTTCACGTCTTTAGTCCCAAATACACA  666

Query 592  AAATTACGTGACTGGCACCATGAAGTTTCAGCACGTGCTCTTAACGTACAG  642
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 667  AAATTACGTGACTGGCACCATGAAGTTTCAGCACGTGCTCTTAATGTACAG  717