Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07649
• Subject: XM_006501751.2
• Aligned Length: 702
• Identities: 570
• Gaps: 60

Alignment

Query   1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCACTGGTTGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTGCAGGGCGGTAAGGATTTCAA  74
           |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||
Sbjct   1  ATGAGCAACTACAGTGTGTCATTGGTCGGCCCAGCTCCTTGGGGTTTCCGGCTCCAAGGTGGCAAGGATTTCAA  74

Query  75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTAAAAGATGGCGGCAAGGCAGCCCAGGCAAATGTAAGAATAGGCGATGTGG  148
           ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||.||||||||.||.||||
Sbjct  75  CATGCCTCTGACAATCTCTAGTCTGAAGGATGGTGGCAAGGCATCTCAGGCACATGTCAGAATAGGGGACGTGG  148

Query 149  TTCTCAGCATTGATGGAATAAATGCACAAGGAATGACTCATCTTGAAGCCCAGAATAAGATTAAGGGTTGTACA  222
           ||||||||||.|||||.||.|.||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||.||||||.
Sbjct 149  TTCTCAGCATCGATGGGATCAGTGCACAGGGAATGACGCATCTTGAAGCCCAGAACAAGATTAAGGCTTGTACG  222

Query 223  GGCTCTTTGAATATGACTCTGCAAAGAGCATCTGCTGCACCCAAGCCTGAGCCGGTTCCTGTTCAAAAGAAAAC  296
           |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.|||||..||||||||||.|.||.||.|||...||
Sbjct 223  GGCTCCTTGAATATGACTCTACAAAGAGCTTCAGCTGCAGCCAAGAGTGAGCCGGTTTCCGTCCAGAAGCCCAC  296

Query 297  A--CA------------------------------------AGTGACAAATAA------CCCTGG---------  317
           |  ||                                    ||.||||.|.||      |||.||         
Sbjct 297  AGTCACCAGCGTGTGTTCCGAGTCTGCTCAGGAGCTAGCAGAGGGACAGAGAAGAGGATCCCAGGGTGACATTA  370

Query 318  -------CACTGTGAAAATCCCACCTAAACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCTATACAGAGTTTTAT  384
                  .|.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||
Sbjct 371  AGCAGCAAAATGGGAAAATTCCACCTAAACGCCCACCAAGAAAACACATTGTGGAGCGCAACACGGAGTTTTAT  444

Query 385  CATGTACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAGAGACTGATTGAGGATACTGAAGACTGGCGTCCAAGGACTGG  458
           ||..||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||.||..|||||||
Sbjct 445  CACATACCCACTCACAGTGATGCCAGCAAGAAACGGCTGATTGAGGACACTGAGGACTGGCGCCCCCGGACTGG  518

Query 459  AACAACTCAATCTCGCTCTTTCCGAATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAACATTTGAAAGAATCTGAAGCCG  532
           |||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||...|
Sbjct 519  AACGACTCAGTCTCGTTCTTTCCGGATCCTTGCCCAGATCACTGGGACTGAGCATCTGACAGAATCTGAAAATG  592

Query 533  ATAATACAAAGAAGGCAAAGGAAAAGATACCCCTTCACGTCTTTAGTCCCAAATACACAAAATTACGTGACTGG  606
           |.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  ACAATACGAAGAAGGCAAAGGAAAAGATACCCCTTCACGTCTTTAGTCCCAAATACACAAAATTACGTGACTGG  666

Query 607  CACCATGAAGTTTCAGCACGTGCTCTTAACGTACAG  642
           |||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 667  CACCATGAAGTTTCAGCACGTGCTCTTAATGTACAG  702