Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07805
• Subject: NM_001286188.1
• Aligned Length: 1349
• Identities: 1270
• Gaps: 78

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MPQPLLPALPPLSSPSGAGSCGPSGGEVKQEPVGGRGRREWRVAPSSRPRSSPRLALPTQCSGRRLFRRRARGL  74

Query    1  ----MEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIV  70
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  RSDNMEAVKTFNSELYSLNDYKPPISKAKMTQITKAAIKAIKFYKHVVQSVEKFIQKCKPEYKVPGLYVIDSIV  148

Query   71  RQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVT  144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  RQSRHQFGQEKDVFAPRFSNNIISTFQNLYRCPGDDKSKIVRVLNLWQKNNVFKSEIIQPLLDMAAGIPPPVVT  222

Query  145  PVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQ  218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  PVLASTTTAMSNTPGTPVTPVTPANVVQGLPDPWVSQITNTDTLAAVAQILQSPQGQQLQQLIQTLQIQQQKPQ  296

Query  219  PSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVS  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  PSILQALDAGLVVQLQALTAQLTAAAAAANTLTPLEQGVSFNKKLMDRFDFGEDSEHSEEPKKEIPASQLSHVS  370

Query  293  ESVNISIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSI  366
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ESVNNSIFHQIAEQLQQQNLEHLRQQLLEQQQPQKATPQDSQEGTFGSEHSASPSQGSSQQHFLEPEVNLDDSI  444

Query  367  DIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKR  440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  DIQQQDMDIDEGQDGVEEEVFEQEAKKVAVRSRSRTHSRSRSRSPRKRRSRSRSGSRKRKHRKRSRSRSRERKR  518

Query  441  KSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGC  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  KSSRSYSSERRAREREKERQKKGLPPIRSKTLSVCSTTLWVGQVDKKATQQDLTNLFEEFGQIESINMIPPRGC  592

Query  515  AYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGG  588
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AYVCMVHRQDAFRALQKLSSGSYKIGSKVIKIAWALNKGVKTEYKQFWDVDLGVTYIPWEKVKVDDLEGFAEGG  666

Query  589  MIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVS  662
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  MIDQETVNTEWETVKSSEPVKETVQTTQSPTPVEKETVVTTQAEVFPPPVAMLQIPVAPAVPTVSLVPPAFPVS  740

Query  663  MPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLV  736
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  MPVPPPGFSPIPPPPFLRASFNPSQPPPGFMPPPVPPPVVPPPTIPPVVPTSLVQPSLSMTPETVKDVGFGSLV  814

Query  737  IPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS  810
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  IPGGSVASNLATSALPAGNVFNAPTKQAEPEEKVPHLIDHQISSGENTRSVIPNDISSNAAILGGQPPNVTSNS  888

Query  811  GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVG  884
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GILGVQRPNVSSNSEILGVRPSNVSSSSGIIAAQPPNILNNSGILGIQPPSVSNSSGLLGVLPPNIPNNSGLVG  962

Query  885  VQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVL  958
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  VQPPNVPNTPGLLGTQPPAGPQNLPPLSIPNQRMPTMPMLDIRPGLIPQAPGPRFPLIQPGIPPQRGIPPPSVL  1036

Query  959  DSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPP  1032
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  DSALHPPPRGPFPPGDIFSQPERPFLAPGRQSVDNVTNPEKRIPLGNDNIQQEGDRDYRFPPIETRESISRPPP  1110

Query 1033  VDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRV  1106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  VDVRDVVGRPIDPREGPGRPPLDGRDHFGRPPVDIRENLVRPGIDHLGRRDHFGFNPEKPWGHRGDFDEREHRV  1184

Query 1107  LPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGR  1180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  LPVYGGPKGLHEERGRFRSGNYRFDPRSGPWNRGFGQEVHRDFDDRRRPWERQRDRDDRDFDFCREMNGNRLGR  1258

Query 1181  DRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTV  1254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  DRIQNTWVPPPHARVFDYFEGATSQRKGDNVPQVNGENTERHAQPPPIPVQNDPELYEKLTSSNEINKEKSDTV  1332

Query 1255  ADIESEPVVESTETEGT  1271
            |||||||||||||||||
Sbjct 1333  ADIESEPVVESTETEGT  1349