Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07831
- Subject:
- NM_028966.3
- Aligned Length:
- 1893
- Identities:
- 1708
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ---ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 74
Query 72 GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 145
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTAAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTTCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 148
Query 146 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 219
|||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTGGAAGGAGAGGCCAACAGCCCGGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 222
Query 220 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT 293
|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTTCTGCTAACTCACCTGCCTTTGCTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGC 296
Query 294 AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 367
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGTATATGAAACTGCTGCCCAAGATCCTGGCACACTCTATCGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 370
Query 368 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT 441
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATCCACCCAGCCACTTCCTTGGAAGACCGCAGCGCACTAGCCATGTGGCTGAAT 444
Query 442 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA 515
|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACTTGGAGGACCGCACATCCACCAGCTTTGGTAGCCAGAACCGAGGCCGCTCGGACTCTGTGGATTATGGACA 518
Query 516 GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 589
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACGCATTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGACGATAAGCTCAATGGCTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 592
Query 590 TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC 663
|||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 TTTGCATCAGTGCCTCCAACTGGCAGGACAAGAGCCTGGGCTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCTTCC 666
Query 664 TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCT 737
||.||||||||..||||||||||.||||||||||||.||.||||.||.|||||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct 667 TCGTCTGTCCCTGCCACAATCAACACGATTGGAACCGGCGCAAGCACGAATGTTCCAGCTTGGTTAAAAAGCCT 740
Query 738 CCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGC 811
||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 741 CCGCCTGCACAAGTACGCTGCGCTCTTCTCGCAGATGACTTATGAGGAAATGATGGCCCTCACTGAGTGTCAAC 814
Query 812 TGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAA 885
|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 TGGAGGCTCAGAATGTTACCAAAGGCGCAAGACACAAAATTGTAATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAG 888
Query 886 AATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCA 959
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||.||
Sbjct 889 AACCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGAAGGGGGCAGCCTGCGCACCCCCCTCCAGGAGCTACATCA 962
Query 960 GATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGG 1033
||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||..|||.||||||
Sbjct 963 GATGATCCTGACACCCATCAAGGCCTACAGCTCTCCCAGTACCACCCCTGAGGTGCGCTGCCGGG--------- 1027
Query 1034 CCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGC---CACT 1104
|||||||||||||| |||||||..|||||.|||||||||||..|.||.||||| |||.
Sbjct 1028 ---------AGCCCTCACTGATG------GAGAGCCCAAGCCCTGACTGCAAAGACAGCGCTGCAGCAGTCACC 1086
Query 1105 GGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGA 1178
.|||||||.||||...||||.|||||.||||||||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1087 AGCGCCACAGCCAGTGCCTCAGCCGGTGCCAGCGGTGGACTGCAACCACCCCAGCTGAGCAGCTGCGACGGAGA 1160
Query 1179 GCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACAC 1252
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1161 GCTGGCTGTCGCCCCTCTGCCGGAGGGGGACCTCCCGGGGCAGTTCACCCGAGTCATGGGGAAAGTGTGCACAC 1234
Query 1253 AGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCAT 1326
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||||..|||||
Sbjct 1235 AGCTCTTGGTCTCCAGACCCGATGAAGAAAATATAAGCTCCTATCTACAGCTCTTAGACAAGTGTCTTGTTCAT 1308
Query 1327 GAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTT 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1309 GAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTT 1382
Query 1401 CCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCC 1474
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1383 CCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGACAGCAAAGAAATCGTGGCTTTGGGCAGTCCAACTCCC 1456
Query 1475 TCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAAC 1548
||||.||.||..|||||||||||.|.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||||||||.
Sbjct 1457 TCCCAACAGCCAGCTCTGTGGGCAGCGGCATGGGCAGACGGAACCCACGACAGTACCAGATCGCATCTCGGAAT 1530
Query 1549 GTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTAC 1622
|||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|.||.|.
Sbjct 1531 GTCCCTTCCGCCCGCCTTGGTCTCCTGGGCACCAGTGGATTTGTCAGCTCCAACCAGCGCCACACCGCTGCCAA 1604
Query 1623 CCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCC 1696
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1605 CCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTCTGGTTTGCCAACCCTGGGGGCAGCAACAGCATGCCCAGCC 1678
Query 1697 GCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAG 1770
|||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1679 GCACCCACAGCTCCGTCCAGAAGACCCGCTCGCTGCCCGTGCATACTTCCCCACAAAACATGCTGATGTTCCAG 1752
Query 1771 CAGCCAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGAC 1844
||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1753 CAACCAGAATTTCAGCTTCCTGTGACTGAACCTGACATCAACAATAGGCTGGAGTCCTTGTGCCTCAGTATGAC 1826
Query 1845 CGAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC 1887
.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1827 GGAGCATGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACAATC 1869