Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07959
• Subject: NM_001199809.1
• Aligned Length: 962
• Identities: 912
• Gaps: 49

Alignment

Query   1  MASNSTKSFLADAGYGEQELDANSALMELDKGLRSGKLGEQCEAVVRFPRLFQKYPFPILINSAFLKLADVFRV  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MASNSTKSFLADAGYGEQELDANSALMELDKGLRSGKLGEQCEAVVRFPRLFQKYPFPILINSAFLKLADVFRV  74

Query  75  GNNFLRLCVLKVTQQSEKHLEKILNVDEFVKRIFSVIHSNDPVARAITLRMLGSLASIIPERKNAHHSIRQSLD  148
           |                                                 ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  G-------------------------------------------------MLGSLASIIPERKNAHHSIRQSLD  99

Query 149  SHDNVEVEAAVFAAANFSAQSKDFAVGICNKISEMIQGLATPVDLKLKLIPILQHMHHDAILASSARQLLQQLV  222
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Sbjct 100  SHDNVEVEAAVFAAANFSAQSKDFAVGICNKISEMIQGLATPVDLKLKLIPILQHMHHDAILASSARQLLQQLV  173

Query 223  TSYPSTKMVIVSLHTFTLLAASSLVDTPKQIQLLLQYLKNDPRKAVKRLAIQDLKLLANKTPHTWSRENIQALC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174  TSYPSTKMVIVSLHTFTLLAASSLVDTPKQIQLLLQYLKNDPRKAVKRLAIQDLKLLANKTPHTWSRENIQALC  247

Query 297  ECALQTPYDSLKLGMLSVLSTLSGTIAIKHYFSIVPGNVSSSPRSSDLVKLAQECCYHNNRGIAAHGVRVLTNI  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248  ECALQTPYDSLKLGMLSVLSTLSGTIAIKHYFSIVPGNVSSSPRSSDLVKLAQECCYHNNRGIAAHGVRVLTNI  321

Query 371  TVSCQEKDLLALEQDAVFGLESLLVLCSQDDSPGAQATLKIALNCMVKLAKGRPRLSQSVVETLLTQLHSAQDA  444
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Sbjct 322  TVSCQEKDLLALEQDAVFGLESLLVLCSQDDSPGAQATLKIALNCMVKLAKGRPHLSQSVVETLLTQLHSAQDA  395

Query 445  ARILMCHCLAAIAMQLPVLGDGMLGDLMELYKVIGRSATDKQQELLVSLATVIFVASQKALSVESKAVIKQQLE  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396  ARILMCHCLAAIAMQLPVLGDGMLGDLMELYKVIGRSATDKQQELLVSLATVIFVASQKALSVESKAVIKQQLE  469

Query 519  SVSNGWTVYRIARQASRMGNHDMAKELYQSLLTQVASEHFYFWLNSLKEFSHAEQCLTGLQEENYSSALSCIAE  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470  SVSNGWTVYRIARQASRMGNHDMAKELYQSLLTQVASEHFYFWLNSLKEFSHAEQCLTGLQEENYSSALSCIAE  543

Query 593  SLKFYHKGIASLTAASTPLNPLSFQCEFVKLRIDLLQAFSQLICTCNSLKTSPPPAIATTIAMTLGNDLQRCGR  666
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Sbjct 544  SLKFYHKGIASLTAASTPLNPLSFQCEFVKLRIDLLQAFSQLICTCNSLKTSPPPAIATTIAMTLGNDLQRCGR  617

Query 667  ISNQMKQSMEEFRSLASRYGDLYQASFDADSATLRNVELQQQSCLLISHAIEALILDPESASFQEYGSTGTAHA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618  ISNQMKQSMEEFRSLASRYGDLYQASFDADSATLRNVELQQQSCLLISHAIEALILDPESASFQEYGSTGTAHA  691

Query 741  DSEYERRMMSVYNHVLEEVESLNRKYTPVSYMHTACLCNAIIALLKVPLSFQRYFFQKLQSTSIKLALSPSPRN  814
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Sbjct 692  DSEYERRMMSVYNHVLEEVESLNRKYTPVSYMHTACLCNAIIALLKVPLSFQRYFFQKLQSTSIKLALSPSPRN  765

Query 815  PAEPIAVQNNQQLALKVEGVVQHGSKPGLFRKIQSVCLNVSSTLQSKSGQDYKIPIDNMTNEMEQRVEPHNDYF  888
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Sbjct 766  PAEPIAVQNNQQLALKVEGVVQHGSKPGLFRKIQSVCLNVSSTLQSKSGQDYKIPIDNMTNEMEQRVEPHNDYF  839

Query 889  STQFLLNFAILGTHNITVESSVKDANGIVWKTGPRTTIFVKSLEDPYSQQIRLQQQQAQQPLQQQQQRNAYTRF  962
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Sbjct 840  STQFLLNFAILGTHNITVESSVKDANGIVWKTGPRTTIFVKSLEDPYSQQIRLQQQQAQQPLQQQQQRNAYTRF  913