Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07959
- Subject:
- NR_037667.1
- Aligned Length:
- 4589
- Identities:
- 2885
- Gaps:
- 1703
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 CTTTTCTCCCAGCCGCGGGAACCTGGAGTCCAAGAGCTCCTTGAGCGCCTGCGCAGGGGGTAGCAGAGGCGCGG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACAAACCGCGGGGTGACCAGGGCGCATGCGTAACAGGGCTTGACAGCGCGCGGAAGAAAAACCAGCAAGAAGGC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGCGGGGGAAGATGGCGGTCCTGGGGTAGAGTTTGCAAGCTTTCTGACTAGGCTAGTCGAGTAACTATTCGGGT 222
Query 1 -ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTG 73
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTG 296
Query 74 CCCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCC 147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCC 370
Query 148 AGACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGT 221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGT 444
Query 222 TGG----------------------------------AAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACC 261
||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGCATGAGATGCATGTCTGTGAAGTACCTGAAACATAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACC 518
Query 262 CAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAATGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCA 335
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAATGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCA 592
Query 336 TAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCCGGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGA 409
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCCGGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGA 666
Query 410 AGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGATTCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCT 483
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGATTCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCT 740
Query 484 GCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGCTGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGG 557
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGCTGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGG 814
Query 558 TTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGATACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGG 631
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGATACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGG 888
Query 632 CTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTCACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTG 705
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTCACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTG 962
Query 706 CACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGTTGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTT 779
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGTTGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTT 1036
Query 780 GAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTGCTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCAC 853
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTGCTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCAC 1110
Query 854 ATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGTGAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTA 927
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGTGAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTA 1184
Query 928 GGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGACCATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAA 1001
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGACCATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAA 1258
Query 1002 TGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCAAATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCA 1075
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCAAATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCA 1332
Query 1076 TTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATAACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAA 1149
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATAACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAA 1406
Query 1150 CAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGTACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCAC 1223
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGTACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCAC 1480
Query 1224 TTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGGCCAAGGGCAGGCCCCGTCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGA 1297
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGGCCAAGGGCAGGCCCCATCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGA 1554
Query 1298 CCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCTGCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCC 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCTGCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCC 1628
Query 1372 ATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGGTGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGC 1445
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGGTGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGC 1702
Query 1446 CACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGGCTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTG 1519
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGGCTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTG 1776
Query 1520 TGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAAAGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGA 1593
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAAAGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGA 1850
Query 1594 CAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAAAGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGA 1667
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAAAGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGA 1924
Query 1668 ACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGTTTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGG 1741
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 ACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGTTTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGG 1998
Query 1742 AAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAATCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACA 1815
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAATCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACA 2072
Query 1816 GCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCAGTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGC 1889
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCAGTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGC 2146
Query 1890 CTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGAAGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCA 1963
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGAAGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCA 2220
Query 1964 TGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGCATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGA 2037
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGCATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGA 2294
Query 2038 AGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGCATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGA 2111
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 AGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGCATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGA 2368
Query 2112 ACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATGCAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTT 2185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATGCAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTT 2442
Query 2186 TCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCTGATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAAT 2259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCTGATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAAT 2516
Query 2260 CATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAAATATACCCCTGTTTCTTATATGCACACAGCATGCCTCTG 2333
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAAATATACCCCTGTTTCTTATATGCACACAGCATGCCTCTG 2590
Query 2334 CAATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCA 2407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CAATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCA 2664
Query 2408 GCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTG 2481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GCATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTG 2738
Query 2482 GCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCT 2555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GCGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCT 2812
Query 2556 GAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGA 2629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GAATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGA 2886
Query 2630 TGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACA 2703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TGGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACA 2960
Query 2704 CACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCAT 2777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 CACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCAT 3034
Query 2778 ATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTAC 2851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ATTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTAC 3108
Query 2852 AGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT--------------------------------------- 2886
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 AGCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTTTAACCATGGAATGAATGCACTGCAGACTCTCAAGAGATC 3182
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3183 AATCAAATTGCCAGAAACAGTTTGGTTTTTCATATGGAATAAGTATTAAAGTTACAGTGTAGTTCATTTATTCA 3256
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3257 TTGATTTTTGTAATGTAATATTCTGGAAAAAATTTTGTTTTCTTAAAAATTTTGTCTGACAGCTGGGCGTGGTT 3330
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3331 GCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCGGCTCACGAGGAGATCAAGACCATCCTGGCT 3404
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3405 AACACAGTGAAACCCCGTCTCCACTAAAAAATACAAAAAAATTAGCCAAGCATGGTGGCAGGCGCCTGTAGTCC 3478
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3479 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGTGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGACTGTG 3552
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3553 CTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAATAAATAAATACATTTTGTCTGAAAAATAACTGG 3626
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3627 GATCCTGGCCAGAAAGATTGTTCTTTCTTGTTTTATTATTAGTTTTTTCTGTTGCCAAGCTTTTTTTTCTTTCA 3700
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3701 AGAATAGTCACATGTTGAGATCACTGAATTGGTAAATTTGACCGCTACTCTTCCAAAATACATCATTTGCTGCC 3774
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3775 TGACTTAGACCTAGGATTCTGAGTTGTTCATTGGGAGGTTCTGACCAGTCACTACAAGGTTTATCCATGGTAGC 3848
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3849 AGAACCTGAGTCCTTCTGTAGATGGACTTGAAAGTGTTCCGTGCAACATCCAGCCTTCTGGATTATGAAAGCCC 3922
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3923 ACAGTCTAACAGTATTGAAACATCCTGCTGTATTAGTTCAACCACATATTTATCTCTTCCTGTGCTAAAGCAGT 3996
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 3997 CTTTATTATTTTCATATTTAATTGAAACAAAGAGCAGCTAGCAATTTCATAGAAAATTAATTTGTTTTTTCTGA 4070
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 4071 TGTGTCTGCAACTGTGTATAATACAGACATTTCACATTGTTTCCAAAAGTGAAGAACACTCATTTAATATCTTC 4144
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 4145 AATGTTTTAAGTTAGAAGGGGTGGATCTTTTCCTTTGGTTGGTGATTGGTTTGGTTTATACTTGATGAGTTATG 4218
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 4219 CTAGACTGATTGTTTAGAGAGAGCAGTCTCTTTATTACACAGGCTCAGTTTGTTGGGATGCTCAGGGAACAGAG 4292
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 4293 TTTTCTGGTTAGCCAGAAAACCCCCTTTTTTCCTATTTTAATTCTGGTTGAAAACCATGATAAAATAGACTTTC 4366
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 4367 TTAGCACAGTATGGTAGATATAACTTAACTGCTTTTTGATTGGGGATCATTTAGGGCTTCAGGATCACGATTTC 4440
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 4441 TAAACATCAGGGATCATATGGTTGCAGATGCCGATGCTATAAGTAATTTGGCCGGATGCAGCTCCTAAGGTAAA 4514
Query 2887 -------------------------------------------------------------------------- 2886
Sbjct 4515 GCAGGGTACTTTCCCTGGAATTTCCTTTTTAAATAAATATCTGTTTCTTTGCTTGTGAAAAAAAAAAAAAAAAA 4588
Query 2887 - 2886
Sbjct 4589 A 4589