Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07959
- Subject:
- XM_011509396.2
- Aligned Length:
- 2994
- Identities:
- 2885
- Gaps:
- 108
Alignment
Query 1 ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCAAACTCAACTAAGTCTTTCCTGGCAGATGCCGGCTATGGCGAACAGGAACTGGATGCCAACTCTGC 74
Query 75 CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTTATGGAATTGGACAAAGGCCTAAGATCTGGCAAACTTGGTGAACAGTGTGAAGCAGTTGTTCGCTTTCCCA 148
Query 149 GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GACTTTTTCAGAAGTATCCATTCCCTATTCTTATCAATTCTGCATTCCTAAAGTTAGCTGATGTTTTCAGAGTT 222
Query 223 GGAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACCCAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAAATAATTTCCTGAGGCTATGTGTTCTTAAAGTTACCCAACAAAGTGAGAAACATTTGGAGAAGATTCTAAA 296
Query 297 TGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCATAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTGGATGAATTTGTGAAGAGAATTTTTTCTGTGATTCATAGTAATGATCCTGTGGCAAGAGCCATCACCCTCC 370
Query 371 GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGATGTTGGGAAGTCTGGCATCAATAATTCCTGAGAGGAAGAATGCTCATCATAGTATTCGTCAGAGTTTAGAT 444
Query 445 TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCACATGATAATGTAGAAGTTGAAGCTGCTGTTTTTGCTGCTGCAAACTTCTCTGCACAGTCAAAGGATTTTGC 518
Query 519 TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTAGGAATCTGTAACAAAATCAGTGAAATGATTCAAGGTTTAGCGACACCAGTAGACTTGAAGCTAAAATTGA 592
Query 593 TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TACCCATTCTACAGCACATGCACCATGATGCAATCTTGGCTTCCAGTGCTCGTCAGCTTTTACAACAGCTGGTC 666
Query 667 ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACATCCTATCCGTCCACCAAAATGGTGATTGTGTCTTTGCACACTTTCACTCTGCTTGCAGCGTCATCTTTGGT 740
Query 741 TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGATACACCTAAGCAGATTCAGCTTCTGTTGCAGTATTTGAAGAATGATCCCAGGAAGGCAGTAAAGAGACTTG 814
Query 815 CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTATTCAAGATCTGAAATTACTTGCTAATAAAACACCACATACTTGGAGTAGGGAGAATATTCAGGCACTTTGT 888
Query 889 GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGTGTGCCCTCCAGACTCCTTATGACAGCTTAAAACTAGGGATGTTGTCTGTCCTTTCCACACTATCAGGGAC 962
Query 963 CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATCGCCATCAAACATTACTTCAGTATAGTTCCAGGAAATGTGAGTTCTTCTCCCAGATCTTCTGATTTAGTCA 1036
Query 1037 AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AATTAGCCCAAGAGTGCTGTTACCATAATAACAGGGGCATTGCAGCTCATGGAGTTAGAGTCCTAACTAATATA 1110
Query 1111 ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTGTTTCTTGTCAAGAAAAGGATCTTTTGGCACTGGAACAAGATGCTGTCTTTGGCCTGGAATCCCTACTGGT 1184
Query 1185 ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACTTTGTAGTCAAGATGATAGTCCAGGTGCTCAGGCCACTTTAAAGATTGCTCTAAACTGTATGGTGAAGTTGG 1258
Query 1259 CCAAGGGCAGGCCCCGTCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT 1332
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCAAGGGCAGGCCCCATCTTAGCCAGTCAGTAGTTGAGACCTTGTTGACTCAATTGCACAGTGCTCAAGACGCT 1332
Query 1333 GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCCGGATTTTGATGTGCCATTGCCTGGCAGCCATTGCCATGCAACTGCCGGTGCTGGGTGATGGGATGCTTGG 1406
Query 1407 TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGACCTCATGGAGCTGTACAAGGTGATTGGACGATCAGCCACAGACAAGCAACAAGAACTTCTGGTGAGTTTGG 1480
Query 1481 CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTACTGTGATTTTTGTTGCAAGTCAGAAGGCATTGTCTGTGGAAAGTAAGGCAGTAATTAAGCAGCAGCTTGAA 1554
Query 1555 AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTGTCTCCAATGGATGGACTGTATACCGTATTGCCAGACAGGCTTCCAGAATGGGTAATCATGACATGGCCAA 1628
Query 1629 AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGAGCTTTATCAGAGTTTGCTGACTCAGGTTGCCTCAGAACATTTCTACTTCTGGCTAAATAGTTTGAAGGAGT 1702
Query 1703 TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TTTCACATGCAGAACAGTGTCTCACTGGGTTGCAAGAGGAAAATTATAGTTCAGCACTTTCTTGCATTGCTGAA 1776
Query 1777 TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TCTTTAAAATTCTATCACAAAGGGATTGCTTCCTTAACAGCAGCTAGTACACCACTGAATCCTTTAAGCTTTCA 1850
Query 1851 GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GTGTGAATTTGTAAAACTCAGGATTGACCTTTTACAAGCCTTCTCTCAACTTATCTGTACTTGTAATAGCCTGA 1924
Query 1925 AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGACAAGCCCACCACCTGCAATTGCCACAACAATTGCCATGACCTTAGGAAATGACCTCCAGAGGTGTGGTCGC 1998
Query 1999 ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATCTCCAATCAGATGAAACAGTCCATGGAAGAATTTCGAAGCCTTGCTTCTCGATATGGAGATCTTTACCAGGC 2072
Query 2073 ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 ATCTTTTGATGCTGACTCAGCAACTTTGAGGAATGTTGAACTACAGCAGCAGAGCTGTTTACTGATATCTCATG 2146
Query 2147 CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CAATAGAAGCCCTGATTTTGGATCCAGAATCAGCAAGTTTCCAGGAATATGGATCTACTGGAACAGCCCATGCT 2220
Query 2221 GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GATAGTGAATATGAAAGAAGAATGATGTCTGTATATAATCATGTCTTGGAGGAGGTAGAATCACTCAATCGGAA 2294
Query 2295 ATATACCCCTGTTTCTTAT------------------------------------------------------- 2313
|||||||||||||||||||
Sbjct 2295 ATATACCCCTGTTTCTTATATGTTTTGGAGGCAGGAAAGTCCAGTATCAAGCTGCCAGCAGATTCGGTTCCTGG 2368
Query 2314 -----------------------------------------------------ATGCACACAGCATGCCTCTGC 2334
|||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TGAGGACTTTCTTCCTGGCCCTGGTGACAGCCACCTTCTTATTACATCTTCACATGCACACAGCATGCCTCTGC 2442
Query 2335 AATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAG 2408
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AATGCCATCATTGCTTTGCTGAAAGTTCCCCTTTCTTTCCAGAGATATTTTTTCCAGAAACTACAGTCTACCAG 2516
Query 2409 CATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGG 2482
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 CATCAAGCTTGCTCTGTCACCATCGCCCCGGAATCCTGCAGAGCCCATTGCTGTCCAGAATAACCAGCAGCTGG 2590
Query 2483 CGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTG 2556
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CGCTAAAGGTAGAGGGAGTGGTTCAGCACGGATCTAAACCAGGACTCTTCCGCAAAATTCAGTCTGTCTGTCTG 2664
Query 2557 AATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGAT 2630
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AATGTTTCTTCCACACTGCAGAGTAAATCTGGACAAGACTACAAGATACCCATTGACAACATGACCAATGAGAT 2738
Query 2631 GGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACAC 2704
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GGAGCAAAGGGTTGAACCTCATAATGATTACTTCAGTACTCAATTTCTGTTGAACTTTGCTATCCTTGGAACAC 2812
Query 2705 ACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATA 2778
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 ACAACATTACAGTGGAATCTTCTGTGAAAGATGCCAATGGTATAGTATGGAAGACTGGTCCCAGAACTACCATA 2886
Query 2779 TTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACA 2852
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 TTTGTAAAATCCCTGGAAGACCCTTATTCCCAGCAAATTCGCTTACAACAGCAGCAAGCCCAGCAGCCATTACA 2960
Query 2853 GCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GCAGCAGCAGCAACGCAATGCCTACACACGGTTT 2994