Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08210
• Subject: NM_001371916.1
• Aligned Length: 891
• Identities: 821
• Gaps: 69

Alignment

Query   1  ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGGACCGCATCTGAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct   1  ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGGACCGCAGCTGAA  74

Query  75  TGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAAGTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  75  TGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAAGTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCC------  142

Query 149  CAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGCTGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATT  222
                                                                          |||||||||||
Sbjct 143  ---------------------------------------------------------------CCCGGAGAATT  153

Query 223  TTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGCCCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACC  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 154  TTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGCCCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACC  227

Query 297  TCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAGATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 228  TCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAGATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTC  301

Query 371  TGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 302  TGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAG  375

Query 445  GATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGGTTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 376  GATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGGTTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTT  449

Query 519  CAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAATCTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCC  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 450  CAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAATCTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCC  523

Query 593  GTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGT  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 524  GTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGT  597

Query 667  ATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTTTTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 598  ATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTTTTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACA  671

Query 741  TCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATCACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGA  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 672  TCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATCACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGA  745

Query 815  ATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAACTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTC  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 746  ATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAACTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTC  819

Query 889  CAC  891
           |||
Sbjct 820  CAC  822