Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08464
• Subject: NM_145940.2
• Aligned Length: 1338
• Identities: 1171
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCGGCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGA  74
            |||||||||||.|||||.||.||.||.||||||.|.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGAGGCCGAAGCCGCAGATGCCCCTCCGGGCCGAGTGGAGGCGGCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAAGA  74

Query   75  CTGCACATCCCTAGCAATTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTTTTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATC  148
            |||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct   75  CTGCACATCCCTAGCGATTGGAACCAAGGCCGGTTACAAGCTGTTTTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTTGACC  148

Query  149  AAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGCGCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTA  222
            |||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  149  AAGTCCATGGAAGCAATGAAATCCCTGACGTGTATATCGTGGAGCGCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTTGTAGTG  222

Query  223  GTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAGAAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTA  296
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCAGTCACACAAAACCTCGGCAGATGAACGTCTACCATTTCAAGAAAGGCACTGAGATCTGTAATTACAGCTA  296

Query  297  CTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCTGGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTC  370
            ||||||||||||.|||||.||..||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|
Sbjct  297  CTCCAGCAACATTTTGTCTATTCGGCTCAACCGACAGAGGCTGCTGGTCTGCCTGGAAGAATCCATCTATATCC  370

Query  371  ACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTCCTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTC  444
            ||||||||||.||.||||||.|.|||||||||.|||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  371  ACAACATTAAGGATATGAAGTTATTGAAGACCGTCCTGGATATTCCCTCAAACCCAACAGGTCTCTGTGCCCTG  444

Query  445  TCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTGACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGG  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|.||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  TCTATCAACCATTCCAACTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCAGAGTACAGGCGAGATTGTACTCTATGATGG  518

Query  519  AAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAACACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAG  592
            |||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||..||||.|
Sbjct  519  AAACTCCCTGAAAACGGTGTGCACCATTGCTGCCCACGAGGGGACGCTGGCCGCTATCACCTTCAACTCCTCGG  592

Query  593  GCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGGTGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTC  666
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.|||
Sbjct  593  GCTCCAAGCTAGCAAGCGCGTCTGAAAAAGGCACTGTCATCCGAGTGTTCTCTGTTCCCGAGGGCCAGAAACTC  666

Query  667  TATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATTCCT  740
            ||||||||.||..||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  667  TATGAGTTTCGTCGAGGAATGAAAAGGTATGTGACAATCAGCTCCCTGGTGTTCAGTATGGACTCCCAGTTCCT  740

Query  741  CTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAACAGTCGACCAGAAGAGC  814
            .||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||.|||||||..|.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  741  GTGTGCCTCCAGCAACACGGAGACCGTGCACATCTTCAAGATGGAACACCTGACAGACAGCCGCCCAGAAGAGC  814

Query  815  CTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCCCTACCCAGGTGTCAGAC  888
            ||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||
Sbjct  815  CTTCCACCTGGAGCGGCTACATGGGAAAGATGTTCATGGCAGCTACCAACTACCTCCCCGCCCAGGTGTCGGAC  888

Query  889  ATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTC  962
            ||||||.|.||||||||||||||.|||||.|.||||.||||||||||.||.||||.||||||.||.|||||.||
Sbjct  889  ATGATGAACCAGGACAGGGCTTTCGCCACAGGACGCCTGAACTTCTCTGGGCAGAAGAACATTTGCACCCTGTC  962

Query  963  AACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATATGTACAATTTGGATCCTC  1036
            .|||||||||||..||||.|||.||||.||.||.||.|||...|||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  963  CACGATCCAGAAACTGCCGCGGTTGCTGGTGGCCTCCTCCGACGGACACCTTTACATCTACAACTTGGACCCAC  1036

Query 1037  AGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAA  1110
            |||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037  AGGATGGAGGAGAATGTGTCCTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTAGCTCAGGAACAACAGAAGAGAACAAAGAA  1110

Query 1111  AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCAC  1184
            |||||||||||||||||||||||||..||||||||.||.||.|||||.||.||.||..|.|||.||||||||||
Sbjct 1111  AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCCATCTTATGCTGCAACTGTAGCAAGGCCCAGCACGTCTGCAGCCTCCAC  1184

Query 1185  GGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACATGAGTTTGCGACGGGAC  1258
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGCCAGGATACTCTGAGGACGGCGGGGCGCTCCGAGGGGAAGTTATTCCGGAACACGAGTTTGCGACGGGAC  1258

Query 1259  CAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAG  1332
            ||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGTGTGTCTAGACGACGAGAATGAGTTTCCCCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAGTCAGAAGGGCAAAACGAAG  1332

Query 1333  CAGTCA  1338
            |||||.
Sbjct 1333  CAGTCC  1338