Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08464
• Subject: XM_017024808.1
• Aligned Length: 1338
• Identities: 954
• Gaps: 384

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCGGCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCACATCCCTAGCAATTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTTTTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGCGCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAGAAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCTGGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTC  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  ACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTCCTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTC  444
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------ATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTCCTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTC  60

Query  445  TCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTGACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   61  TCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTGACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGG  134

Query  519  AAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAACACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  135  AAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAACACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAG  208

Query  593  GCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGGTGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  209  GCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGGTGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTC  282

Query  667  TATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATTCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  283  TATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGTATGGATTCACAATTCCT  356

Query  741  CTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAACAGTCGACCAGAAGAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  357  CTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAACAGTCGACCAGAAGAGC  430

Query  815  CTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCCCTACCCAGGTGTCAGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  431  CTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCCCTACCCAGGTGTCAGAC  504

Query  889  ATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  505  ATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGGAACATCTGTACCCTCTC  578

Query  963  AACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATATGTACAATTTGGATCCTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  579  AACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATATGTACAATTTGGATCCTC  652

Query 1037  AGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  653  AGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAACAGAAGAGAATAAAGAA  726

Query 1111  AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  AATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGTGCATCTTCAGCCTCCAC  800

Query 1185  GGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACATGAGTTTGCGACGGGAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  GGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACATGAGTTTGCGACGGGAC  874

Query 1259  CAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  CAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATCAGAAGGGCAAAACGAAG  948

Query 1333  CAGTCA  1338
            ||||||
Sbjct  949  CAGTCA  954