Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_08575
• Subject: NM_001145025.2
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1622
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGCCTTTCCGGCTGCTCATCCCGCTCGGCCTCCTGTGCGCGCTGCTGCCTCAGCACCATGGTGCGCCAGGTCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTTTCCGGCTGCTCATCCCGCTCGGCCTCCTGTGCGCGCTGCTGCCTCAGCACCATGGTGCGCCAGGTCC  74

Query   75  CGACGGCTCCGCGCCAGATCCCGCCCACTACAGGGAGCGAGTCAAGGCCATGTTCTACCACGCCTACGACAGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct   75  CGACGGCTCCGCGCCAGATCCCGCCCACTA--------------------------------------------  104

Query  149  ACCTGGAGAATGCCTTTCCCTTCGATGAGCTGCGACCTCTCACCTGTGACGGGCACGACACCTGGGGCAGTTTT  222
                                                                               |||||||
Sbjct  105  -------------------------------------------------------------------CAGTTTT  111

Query  223  TCTCTGACTCTAATTGATGCACTGGACACCTTGCTGATTTTGGGGAATGTCTCAGAATTCCAAAGAGTGGTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  112  TCTCTGACTCTAATTGATGCACTGGACACCTTGCTGATTTTGGGGAATGTCTCAGAATTCCAAAGAGTGGTTGA  185

Query  297  AGTGCTCCAGGACAGCGTGGACTTTGATATTGATGTGAACGCCTCTGTGTTTGAAACAAACATTCGAGTGGTAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  186  AGTGCTCCAGGACAGCGTGGACTTTGATATTGATGTGAACGCCTCTGTGTTTGAAACAAACATTCGAGTGGTAG  259

Query  371  GAGGACTCCTGTCTGCTCATCTGCTCTCCAAGAAGGCTGGGGTGGAAGTAGAGGCTGGATGGCCCTGTTCCGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  260  GAGGACTCCTGTCTGCTCATCTGCTCTCCAAGAAGGCTGGGGTGGAAGTAGAGGCTGGATGGCCCTGTTCCGGG  333

Query  445  CCTCTCCTGAGAATGGCTGAGGAGGCGGCCCGAAAACTCCTCCCAGCCTTTCAGACCCCCACTGGCATGCCATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  CCTCTCCTGAGAATGGCTGAGGAGGCGGCCCGAAAACTCCTCCCAGCCTTTCAGACCCCCACTGGCATGCCATA  407

Query  519  TGGAACAGTGAACTTACTTCATGGCGTGAACCCAGGAGAGACCCCTGTCACCTGTACGGCAGGGATTGGGACCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  408  TGGAACAGTGAACTTACTTCATGGCGTGAACCCAGGAGAGACCCCTGTCACCTGTACGGCAGGGATTGGGACCT  481

Query  593  TCATTGTTGAATTTGCCACCCTGAGCAGCCTCACTGGTGACCCGGTGTTCGAAGATGTGGCCAGAGTGGCTTTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  TCATTGTTGAATTTGCCACCCTGAGCAGCCTCACTGGTGACCCGGTGTTCGAAGATGTGGCCAGAGTGGCTTTG  555

Query  667  ATGCGCCTCTGGGAGAGCCGGTCAGATATCGGGCTGGTCGGCAACCACATTGATGTGCTCACTGGCAAGTGGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  ATGCGCCTCTGGGAGAGCCGGTCAGATATCGGGCTGGTCGGCAACCACATTGATGTGCTCACTGGCAAGTGGGT  629

Query  741  GGCCCAGGACGCAGGCATCGGGGCTGGCGTGGACTCCTACTTTGAGTACTTGGTGAAAGGAGCCATCCTGCTTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  GGCCCAGGACGCAGGCATCGGGGCTGGCGTGGACTCCTACTTTGAGTACTTGGTGAAAGGAGCCATCCTGCTTC  703

Query  815  AGGATAAGAAGCTCATGGCCATGTTCCTAGAGTATAACAAAGCCATCCGGAACTACACCCGCTTCGATGACTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  704  AGGATAAGAAGCTCATGGCCATGTTCCTAGAGTATAACAAAGCCATCCGGAACTACACCCGCTTCGATGACTGG  777

Query  889  TACCTGTGGGTTCAGATGTACAAGGGGACTGTGTCCATGCCAGTCTTCCAGTCCTTGGAGGCCTACTGGCCTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  778  TACCTGTGGGTTCAGATGTACAAGGGGACTGTGTCCATGCCAGTCTTCCAGTCCTTGGAGGCCTACTGGCCTGG  851

Query  963  TCTTCAGAGCCTCATTGGAGACATTGACAATGCCATGAGGACCTTCCTCAACTACTACACTGTATGGAAGCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  852  TCTTCAGAGCCTCATTGGAGACATTGACAATGCCATGAGGACCTTCCTCAACTACTACACTGTATGGAAGCAGT  925

Query 1037  TTGGGGGGCTCCCGGAATTCTACAACATTCCTCAGGGATACACAGTGGAGAAGCGAGAGGGCTACCCACTTCGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  926  TTGGGGGGCTCCCGGAATTCTACAACATTCCTCAGGGATACACAGTGGAGAAGCGAGAGGGCTACCCACTTCGG  999

Query 1111  CCAGAACTTATTGAAAGCGCAATGTACCTCTACCGTGCCACGGGGGATCCCACCCTCCTAGAACTCGGAAGAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1000  CCAGAACTTATTGAAAGCGCAATGTACCTCTACCGTGCCACGGGGGATCCCACCCTCCTAGAACTCGGAAGAGA  1073

Query 1185  TGCTGTGGAATCCATTGAAAAAATCAGCAAGGTGGAGTGCGGATTTGCAACAATCAAAGATCTGCGAGACCACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1074  TGCTGTGGAATCCATTGAAAAAATCAGCAAGGTGGAGTGCGGATTTGCAACAATCAAAGATCTGCGAGACCACA  1147

Query 1259  AGCTGGACAACCGCATGGAGTCGTTCTTCCTGGCCGAGACTGTGAAATACCTCTACCTCCTGTTTGACCCAACC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1148  AGCTGGACAACCGCATGGAGTCGTTCTTCCTGGCCGAGACTGTGAAATACCTCTACCTCCTGTTTGACCCAACC  1221

Query 1333  AACTTCATCCACAACAATGGGTCCACCTTCGACACGGTGATCACCCCCTATGGGGAGTGCATCCTGGGGGCTGG  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  AACTTCATCCACAACAATGGGTCCACCTTCGACGCGGTGATCACCCCCTATGGGGAGTGCATCCTGGGGGCTGG  1295

Query 1407  GGGGTACATCTTCAACACAGAAGCTCACCCCATCGACCCTGCCGCCCTGCACTGCTGCCAGAGGCTGAAGGAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1296  GGGGTACATCTTCAACACAGAAGCTCACCCCATCGACCCTGCCGCCCTGCACTGCTGCCAGAGGCTGAAGGAAG  1369

Query 1481  AGCAGTGGGAGGTGGAGGACTTGATGAGGGAATTCTACTCTCTCAAACGGAGCAGGTCGAAATTTCAGAAAAAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1370  AGCAGTGGGAGGTGGAGGACTTGATGAGGGAATTCTACTCTCTCAAACGGAGCAGGTCGAAATTTCAGAAAAAC  1443

Query 1555  ACTGTTAGTTCGGGGCCATGGGAACCTCCAGCAAGGCCAGGAACACTCTTCTCACCAGAAAACCATGACCAGGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1444  ACTGTTAGTTCGGGGCCATGGGAACCTCCAGCAAGGCCAGGAACACTCTTCTCACCAGAAAACCATGACCAGGC  1517

Query 1629  AAGGGAGAGGAAGCCTGCCAAACAGAAGGTCCCACTTCTCAGCTGCCCCAGTCAGCCCTTCACCTCCAAGTTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1518  AAGGGAGAGGAAGCCTGCCAAACAGAAGGTCCCACTTCTCAGCTGCCCCAGTCAGCCCTTCACCTCCAAGTTGG  1591

Query 1703  CATTACTGGGACAGGTTTTCCTAGACTCCTCA  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1592  CATTACTGGGACAGGTTTTCCTAGACTCCTCA  1623