Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_08729
Subject:
NM_001085515.2
Aligned Length:
717
Identities:
657
Gaps:
4

Alignment

Query   1  MLQIPQEKSQAYPRRRRPGCYAYRQNPEAIAAAAMYTFLPDNFSPAKPKPSKELKPLLGSAVLGLLLVLAAVVA  74
           |.|..||.||||| |.|||..|..........|.||||||||||||||||.|||.|||.|||||||||||||||
Sbjct   1  MSQNLQETSQAYP-RHRPGSHAGPKSLKVTPRATMYTFLPDNFSPAKPKPTKELRPLLCSAVLGLLLVLAAVVA  73

Query  75  WCYYSVSLRKAERLRAELLDLKAGGFSIRNQKGEQVFRLAFRSGALDLDSCSRDGALLGCSLTADGLPLHFFIQ  148
           |||||.|||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||.|||||||
Sbjct  74  WCYYSASLRKAERLRAELLDLNRGGFSIRNQKGEQVFRLAFRSGALDLDSCSRDGALLGCSRAADGRPLHFFIQ  147

Query 149  TVRPKDTVMCYRVRWEEAAPGRAVEHAMFLGDAAAHWYGGAEMRTQHWPIRLDGQQEPQPFVTSDVYSSDAAFG  222
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148  TVRPKDTVMCYRVRWEEAVPGRAVEHAMFLGDAAAHWYGGAEMRTQHWPIRLDGQQEPQPFVTSDVYSSDAAFG  221

Query 223  GILERYWLSSRAAAIKVNDSVPFHLGWNSTERSLRLQARYHDTPYKPPAGRAAAPELSYRVCVGSDVTSIHKYM  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 222  GILERYWLSSRAAAIKVNDSVPFHLGWNSTERSMRLQARYHDTSYKPPAGRTAAPELSYRVCVGSDVTSIHKYM  295

Query 297  VRRYFNKPSRVPAPEAFRDPIWSTWALYGRAVDQDKVLRFAQQIRLHHFNSSHLEIDDMYTPAYGDFDFDEVKF  370
           |||||||||||||.|||||||||||||.||||||.|||.||||||.|.|||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 296  VRRYFNKPSRVPASEAFRDPIWSTWALHGRAVDQNKVLQFAQQIRQHRFNSSHLEIDDMYTPAYGDFNFDEGKF  369

Query 371  PNASDMFRRLRDAGFRVTLWVHPFVNYNSSRFGEGVERELFVREPTGRLPALVRWWNGIGAVLDFTHPKARDWF  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 370  PNASDMFRRLRDAGFRVTLWVHPFVNYNSSSFGEGVERELFVREPTGRLPALVRWWNGIGAVLDFTHPEAREWF  443

Query 445  QGHLRRLRSRYSVASFKFDAGEVSYLPRDFSTYRPLPDPSVWSRRYTEMALPFFSLAEVRVGYQSQNISCFFRL  518
           ||||||||.||.|.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 444  QGHLRRLRLRYNVTSFKFDAGEVSYLPRDFSTYRPLSDPSVWSRRYTEMAEPFFSLAEVRVGYQSQNISCFFRL  517

Query 519  VDRDSVWGYDLGLRSLIPAVLTVSMLGYPFILPDMVGGNAVPQRTAG---GDVPERELYIRWLEVAAFMPAMQF  589
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||   |..||||||.||||||||||||||
Sbjct 518  VDRDSVWGYDLGLRSLIPAVLTVSMLGYPFILPDMIGGNAVPERTAGRQDGPGPERELYVRWLEVAAFMPAMQF  591

Query 590  SIPPWRYDAEVVAIAQKFAALRASLVAPLLLELAGEVTDTGDPIVRPLWWIAPGDETAHRIDSQFLIGDTLLVA  663
           |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592  SIPPWQYDAEVVAIAHKFAALRASLVAPLLLELAGEITDTGDPIVRPLWWIAPGDETAHRIDSQFLIGDTLLVA  665

Query 664  PVLEPGKQERDVYLPAGKWRSYKGELFDKTPVLLTDYPVDLDEIAYFTWAS  714
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 666  PVLEPGKQERDVYLPAGKWRSYKGELFDKTPVLLTDYPVDLDEVAYFTWAS  716