Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_09121
Subject:
NM_018188.5
Aligned Length:
696
Identities:
548
Gaps:
110

Alignment

Query   1  MSWLFGVNKGPKGEGAGPPPPLPPAQPGAEGGGDRGLGDRPAPKDKWSNFDPTGLERAAKAARELEHSRYAKEA  74
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   1  MSWLFGINKGPKGEGAGPPPPLPPAQPGAEGGGDRGLGDRPAPKDKWSNFDPTGLERAAKAARELEHSRYAKDA  74

Query  75  LNLAQMQEQTLQLEQQSKLK------------------------------------------------EYEAAV  100
           ||||||||||||||||||||                                                ||||||
Sbjct  75  LNLAQMQEQTLQLEQQSKLKMRLEALSLLHTLVWAWSLCRAGAVQTQERLSGSASPEQVPAGECCALQEYEAAV  148

Query 101  EQLKSEQIRAQAEERRKTLSEETRQHQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQRLLNEENLRKQEESVQKQEAMRRATV  174
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  EQLKSEQIRAQAEERRKTLSEETRQHQARAQYQDKLARQRYEDQLKQQQLLNEENLRKQEESVQKQEAMRRATV  222

Query 175  EREMELRHKNEMLRVETEARARAKAERENADIIREQIRLKASEHRQTVLESIRTAGTLFGEGFRAFVTDRDKVT  248
           ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 223  EREMELRHKNEMLRVEAEARARAKAERENADIIREQIRLKAAEHRQTVLESIRTAGTLFGEGFRAFVTDWDKVT  296

Query 249  ATVAGLTLLAVGVYSAKNATAVTGRFIEARLGKPSLVRETSRITVLEALRHPIQVSRRLLSRPQDVLEGVVLSP  322
           ||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 297  ATVAGLTLLAVGVYSAKNATLVAGRFIEARLGKPSLVRETSRITVLEALRHPIQVSRRLLSRPQDALEGVVLSP  370

Query 323  SLEARVRDIAIATRNTKKNRGLYRHILLYGPPGTGKTLFAKKLALHSGMDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKLF  396
           ||||||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  SLEARVRDIAIATRNTKKNRSLYRNILMYGPPGTGKTLFAKKLALHSGMDYAIMTGGDVAPMGREGVTAMHKLF  444

Query 397  DWANTSRRGLLLFMDEADAFLRKRATEEISKDLRATLNAFLYHMGQHSNKFMLVLASNLPEQFDCAINSRIDVM  470
           |||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||.|||||.|||.||..|
Sbjct 445  DWANTSRRGLLLFVDEADAFLRKRATEKISEDLRATLNAFLYRTGQHSNKFMLVLASNQPEQFDWAINDRINEM  518

Query 471  VHFDLPQQEERERLVRLHFDNCVLKPATEGKRRLKLAQFDYGRKCSEVARLTEGMSGREIAQLAVSWQATAYAS  544
           ||||||.|||||||||..||..|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  VHFDLPGQEERERLVRMYFDKYVLKPATEGKQRLKLAQFDYGRKCSEVARLTEGMSGREIAQLAVSWQATAYAS  592

Query 545  KDGVLTEAMMDACVQDAVQQYRQKMRWLKAEGPGRGVEHPLSGVQGETLTSWSLATDPSYPCLAGPCTFRICSW  618
           .||||||||||..|||||||..|||.||||||||||.|...|                                
Sbjct 593  EDGVLTEAMMDTRVQDAVQQHQQKMCWLKAEGPGRGDEPSPS--------------------------------  634

Query 619  MGTGLCPGPLSPRMSCGGGRPFCPPGHPLL  648
                                         
Sbjct 635  ------------------------------  634