Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_09195
- Subject:
- XM_011529387.2
- Aligned Length:
- 2520
- Identities:
- 1742
- Gaps:
- 777
Alignment
Query 1 ATGAATGGAGAGTATAGAGGCAGAGGATTTGGACGAGGAAGATTTCAAAGCTGGAAAAGGGGAAGAGGTGGTGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAATGGAGAGTATAGAGGCAGAGGATTTGGACGAGGAAGATTTCAAAGCTGGAAAAGGGGAAGAGGTGGTGG 74
Query 75 GAACTTCTCAGGAAAATGGAGAGAAAGAGAACACAGACCTGATCTGAGTAAAACCACAGGAAAACGTACTTCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GAACTTCTCAGGAAAATGGAGAGAAAGAGAACACAGACCTGATCTGAGTAAAACCACAGGAAAACGTACTTCTG 148
Query 149 AACAAACCCCACAGTTTTTGCTTTCAACAAAGACCCCACAGTCAATGCAGTCAACATTGGATCGATTCATACCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AACAAACCCCACAGTTTTTGCTTTCAACAAAGACCCCACAGTCAATGCAGTCAACATTGGATCGATTCATACCA 222
Query 223 TATAAAGGCTGGAAGCTTTATTTCTCTGAAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCATT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATAAAGGCTGGAAGCTTTATTTCTCTGAAGTTTACAGCGATAGCTCTCCTTTGATTGAGAAGATTCAAGCATT 296
Query 297 TGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGTAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAAAAATTTTTCACAAGGCATATTGATTTGTATGACAAGGATGAAATAGAAAGAAAGGGAAGTATTTTGGTAG 370
Query 371 ATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTTAAAGAACTGACAGAAGGTGGTGAAGTAACTAACTTGATACCAGATATAGCAACTGAACTAAGAGATGCA 444
Query 445 CCTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTGAGAAAACCTTGGCTTGCATGGGTTTGGCAATACATCAGGTGTTAACTAAGGACCTTGAAAGGCATGCAGC 518
Query 519 TGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAGTTACAAGCCCAGGAAGGATTGTCTAATGATGGAGAAACAATGGTAAATGTGCCACATATTCATGCAAGGG 592
Query 593 TGTACAACTATGAGCCTTTGACACAGCTCAAGAATGTCAGAGCAAATTACTATGGAAAATACATTGCTCTAAGA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGTACAACTATGAGCCTTTGACACAGCTCAAGAATGTCAGAGCAAATTACTATGGAAAATACATTGCTCTAAGA 666
Query 667 GGGACAGTGGTTCGTGTCAGTAATATAAAGCCTCTTTGCACCAAGATGGCTTTTCTTTGTGCTGCATGTGGAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGACAGTGGTTCGTGTCAGTAATATAAAGCCTCTTTGCACCAAGATGGCTTTTCTTTGTGCTGCATGTGGAGA 740
Query 741 AATTCAGAGCTTTCCTCTTCCAGATGGAAAATACAGTCTTCCCACAAAGTGTCCTGTGCCTGTGTGTCGAGGCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AATTCAGAGCTTTCCTCTTCCAGATGGAAAATACAGTCTTCCCACAAAGTGTCCTGTGCCTGTGTGTCGAGGCA 814
Query 815 GGTCATTTACTGCTCTCCGCAGCTCTCCTCTCACAGTTACGATGGACTGGCAGTCAATCAAAATCCAGGAATTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGTCATTTACTGCTCTCCGCAGCTCTCCTCTCACAGTTACGATGGACTGGCAGTCAATCAAAATCCAGGAATTG 888
Query 889 ATGTCTGATGATCAGAGAGAAGCAGGTCGGATTCCACGAACAATAGAATGTGAGCTTGTTCATGATCTTGTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGTCTGATGATCAGAGAGAAGCAGGTCGGATTCCACGAACAATAGAATGTGAGCTTGTTCATGATCTTGTGGA 962
Query 963 TAGCTGTGTCCCGGGAGACACAGTGACTATTACTGGAATTGTCAAAGTCTCAAATGCGGAAGAAGGTTCTCGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAGCTGTGTCCCGGGAGACACAGTGACTATTACTGGAATTGTCAAAGTCTCAAATGCGGAAGAAGGTTCTCGAA 1036
Query 1037 ATAAGAATGACAAGTGTATGTTCCTTTTGTATATTGAAGCAAATTCTATTAGTAATAGCAAAGGACAGAAAACA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATAAGAATGACAAGTGTATGTTCCTTTTGTATATTGAAGCAAATTCTATTAGTAATAGCAAAGGACAGAAAACA 1110
Query 1111 AAGAGTTCTGAGGATGGGTGTAAGCATGGAATGTTGATGGAGTTCTCACTTAAAGACCTTTATGCCATCCAAGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGAGTTCTGAGGATGGGTGTAAGCATGGAATGTTGATGGAGTTCTCACTTAAAGACCTTTATGCCATCCAAGA 1184
Query 1185 GATTCAAGCTGAAGAAAACCTGTTTAAACTCATTGTCAACTCGCTTTGCCCTGTCATTTTTGGTCATGAACTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GATTCAAGCTGAAGAAAACCTGTTTAAACTCATTGTCAACTCGCTTTGCCCTGTCATTTTTGGTCATGAACTTG 1258
Query 1259 TTAAAGCAGGTTTGGCATTAGCACTCTTTGGAGGAAGCCAGAAATACGCAGATGACAAAAACAGAATTCCAATT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTAAAGCAGGTTTGGCATTAGCACTCTTTGGAGGAAGCCAGAAATACGCAGATGACAAAAACAGAATTCCAATT 1332
Query 1333 CGGGGAGACCCCCACATCCTTGTTGTTGGAGATCCAGGCTTAGGAAAAAGTCAAATGCTACAGGCAGCGTGCAA 1406
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CGGGGAGACCCCCACATCCTTGTTGTTGGAGATCCAGGCCTAGGAAAAAGTCAAATGCTACAGGCAGCGTGCAA 1406
Query 1407 TGTTGCCCCACGTGGCGTGTATGTTTGTGGTAACACCACGACCACCTCTGGTCTGACGGTAACTCTTTCAAAAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGTTGCCCCACGTGGCGTGTATGTTTGTGGTAACACCACGACCACCTCTGGTCTGACGGTAACTCTTTCAAAAG 1480
Query 1481 ATAGTTCCTCTGGAGATTTTGCTTTGGAAGCTGGTGCCCTGGTACTTGGTGATCAAGGTATTTGTGGAATCGAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATAGTTCCTCTGGAGATTTTGCTTTGGAAGCTGGTGCCCTGGTACTTGGTGATCAAGGTATTTGTGGAATCGAT 1554
Query 1555 GAATTTGATAAGATGGGGAATCAACATCAAGCCTTGTTGGAAGCCATGGAGCAGCAAAGTATTAGTCTTGCTAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAATTTGATAAGATGGGGAATCAACATCAAGCCTTGTTGGAAGCCATGGAGCAGCAAAGTATTAGTCTTGCTAA 1628
Query 1629 GGCTGGTGTGGTTTGTAGCCTTCCTGCAAGAACTTCCATTATTGCTGCTGCAAATCCAGTTGGAGGACATTACA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GGCTGGTGTGGTTTGTAGCCTTCCTGCAAGAACTTCCATTATTGCTGCTGCAAATCCAGTTGGAGGACATTACA 1702
Query 1703 ATAAAGCCAAAACAGTTTCTGAGAATTTAAAAATGGGGAGTGCACTACTATCCAGATTTGATTTGGTCTTTATC 1776
|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ATAAAGCCAAAACAGTTTCTGAGAATTTAAA------------------------------------------- 1733
Query 1777 CTGTTAGATACTCCAAATGAGCATCATGATCACTTACTCTCTGAACATGTGATTGCAATAAGAGCTGGAAAGCA 1850
||||||||||
Sbjct 1734 -------ATACTCCAAA--------------------------------------------------------- 1743
Query 1851 GAGAACCATTAGCAGTGCCACAGTAGCTCGTATGAATAGTCAAGATTCAAATACTTCCGTACTTGAAGTAGTTT 1924
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 1925 CTGAGAAGCCATTATCAGAAAGACTAAAGGTGGTTCCTGGAGAAACAATAGATCCCATTCCCCACCAGCTATTG 1998
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 1999 AGAAAGTACATTGGCTATGCTCGGCAGTATGTGTACCCAAGGCTATCCACAGAAGCTGCTCGAGTTCTTCAAGA 2072
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 2073 TTTTTACCTTGAGCTCCGGAAACAGAGCCAGAGGTTAAATAGCTCACCAATCACTACCAGGCAGCTGGAATCTT 2146
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 2147 TGATTCGTCTGACAGAGGCACGAGCAAGGTTGGAATTGAGAGAGGAAGCAACCAAAGAAGACGCTGAGGATATA 2220
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 2221 GTGGAAATTATGAAATATAGCATGCTAGGAACTTACTCTGATGAATTTGGGAACCTAGATTTTGAGCGATCCCA 2294
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 2295 GCATGGTTCTGGAATGAGCAACAGGTCAACAGCGAAAAGATTTATTTCTGCTCTCAACAACGTTGCTGAAAGAA 2368
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 2369 CTTATAATAATATATTTCAATTTCATCAACTTCGGCAGATTGCCAAAGAACTAAACATTCAGGTTGCTGATTTT 2442
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 2443 GAAAATTTTATTGGATCACTAAATGACCAGGGTTACCTCTTGAAAAAAGGCCCAAAAGTTTACCAGCTTCAAAC 2516
Sbjct 1744 -------------------------------------------------------------------------- 1743
Query 2517 TATG 2520
Sbjct 1744 ---- 1743