Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_09518
• Subject: NM_001283199.2
• Aligned Length: 828
• Identities: 602
• Gaps: 225

Alignment

Query   1  ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGCCCTGTTTCCAAAAACGCGTACAGGCTCATCTTGGCAGCCAA  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGTGCATCATCTTCTTTAAGTTTGATCCTCGCCCTGTTTCCAAAAACGCGTACAGGCTCATCTTGGCAGCCAA  74

Query  75  CAGGGATGAATTCTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CAGGGATGAATTCTACAGCCGACCCTCCAAGTTAGCTGACTTCTGGGGGAACAACAACGAGATCCTCAGTGGGC  148

Query 149  TGGACATGGAGGAAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TGGACATGGAGGAAGGCAAGGAAGGAGGCACATGGCTGGGCATCAGCACACGTGGCAAGCTGGCAGCACTCACC  222

Query 223  AACTACCTGCAGCCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AACTACCTGCAGCCGCAGCTGGACTGGCAGGCCCGAGGGCGAGGTGAACTTGTCACCCACTTTCTGACCACTGA  296

Query 297  CGTGGACAGCTTGTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CGTGGACAGCTTGTCCTACCTGAAGAAGGTCTCTATGGAGGGCCATCTGTACAATGGCTTCAACCTCATAGCAG  370

Query 371  CCAACCTGAGCACAGCAAAGGGAGACGTCATTTGCTACTATGGGAACCGAGGGGAGCCTGATCCTATCGTTTTG  444
           ||.|||||||                                                                
Sbjct 371  CCGACCTGAG----------------------------------------------------------------  380

Query 445  ACGCCAGGCACCTACGGGCTGAGCAACGCGCTGCTGGAGACTCCCTGGAGGAAGCTGTGCTTTGGGAAGCAGCT  518
                                                                                     
Sbjct 381  --------------------------------------------------------------------------  380

Query 519  CTTCCTGGAGGCTGTGGAACGGAGCCAGGCGCTGCCCAAGGATGTGCTCATCGCCAGCCTCCTGGATGTGCTCA  592
                                                                                     
Sbjct 381  --------------------------------------------------------------------------  380

Query 593  ACAATAAAGAGGCGCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGC  666
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 381  -------------GCAGCTGCCAGACCCGGCCATCGAGGACCAGGGTGGGGAGTACGTGCAGCCCATGCTGAGC  441

Query 667  AAGTACGCGGCTGTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCAGAACCAACACTATCATCCTGGTAGATGCGGA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442  AAGTACGCGGCTGTGTGCGTGCGCTGCCCTGGCTACGGCACCAGAACCAACACTATCATCCTGGTAGATGCGGA  515

Query 741  CGGCCACGTGACCTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAACCTATGAGT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516  CGGCCACGTGACCTTCACTGAGCGTAGCATGATGGACAAGGACCTCTCCCACTGGGAGACCAGAACCTATGAGT  589

Query 815  TCACACTGCAGAGC  828
           ||||||||||||||
Sbjct 590  TCACACTGCAGAGC  603